More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2175 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2175  ABC transporter related  100 
 
 		 260 aa  531  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.240046  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3597  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  99.62 
 
 		 260 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2319  ABC transporter related  98.46 
 
 		 260 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2812  ABC transporter related  93.46 
 
 		 260 aa  500  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.844738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  67.63 
 
 		 253 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  67.22 
 
 		 253 aa  355  5e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0230  ABC transporter related protein  67.22 
 
 		 253 aa  353  2e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3860  ABC transporter related  65.48 
 
 		 253 aa  353  2e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1300  general amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  67.22 
 
 		 254 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4425  ABC transporter related  67.22 
 
 		 254 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.329357 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4549  ABC transporter related  67.22 
 
 		 254 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  66.8 
 
 		 262 aa  349  3e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0907  ABC transporter related  66.8 
 
 		 254 aa  349  3e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  64.71 
 
 		 255 aa  349  3e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  66.8 
 
 		 262 aa  349  3e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  67.22 
 
 		 262 aa  348  6e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  64.2 
 
 		 258 aa  347  1e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  66.39 
 
 		 263 aa  347  1e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3710  ABC transporter related  64.49 
 
 		 252 aa  347  1e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.110417 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  66.67 
 
 		 267 aa  347  1e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  66.53 
 
 		 273 aa  347  2e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  66.39 
 
 		 263 aa  346  3e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1075  ABC transporter  65.98 
 
 		 254 aa  345  4e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.520778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0796  ABC transporter related  67.36 
 
 		 257 aa  345  4e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0976  ABC transporter-like  65.56 
 
 		 254 aa  345  6e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1258  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.56 
 
 		 254 aa  344  8e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13929  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  63.67 
 
 		 256 aa  343  1e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  66.26 
 
 		 267 aa  343  2e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  66.67 
 
 		 251 aa  343  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  64.37 
 
 		 258 aa  342  2.9999999999999997e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  63.28 
 
 		 253 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  64.37 
 
 		 258 aa  342  2.9999999999999997e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  66.8 
 
 		 265 aa  341  5.999999999999999e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.29 
 
 		 269 aa  341  7e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  67.23 
 
 		 259 aa  341  8e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  65.02 
 
 		 269 aa  341  9e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03129  predicted amino-acid transporter subunit  63.67 
 
 		 252 aa  340  1e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0435  ABC transporter related protein  63.67 
 
 		 252 aa  340  1e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.67 
 
 		 252 aa  340  1e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3466  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.67 
 
 		 252 aa  340  1e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0172997  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0435  ABC transporter related  63.67 
 
 		 252 aa  340  1e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.337414 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03080  hypothetical protein  63.67 
 
 		 252 aa  340  1e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1075  ABC transporter related  63.56 
 
 		 250 aa  340  1e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3674  ABC transporter related  66.8 
 
 		 265 aa  340  1e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1959  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.61 
 
 		 251 aa  340  2e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0443525  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  64.9 
 
 		 253 aa  339  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4592  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.67 
 
 		 252 aa  340  2e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3757  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.67 
 
 		 252 aa  340  2e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0539181  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0055  general L-amino acid transport ATP-binding protein  65 
 
 		 268 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.02 
 
 		 249 aa  339  2.9999999999999998e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6378  ABC transporter related  63.89 
 
 		 273 aa  338  4e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  64.88 
 
 		 257 aa  338  7e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.86 
 
 		 252 aa  337  8e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  64.73 
 
 		 258 aa  337  9e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1885  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.2 
 
 		 251 aa  336  1.9999999999999998e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00643068  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  65 
 
 		 252 aa  336  2.9999999999999997e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  64.88 
 
 		 257 aa  335  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1152  ABC transporter related  63.35 
 
 		 252 aa  334  9e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.7 
 
 		 251 aa  333  2e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  61.48 
 
 		 249 aa  333  2e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  65.42 
 
 		 247 aa  332  4e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4510  ABC transporter related  65.69 
 
 		 266 aa  331  7.000000000000001e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00592633  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  61.48 
 
 		 249 aa  331  8e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  61.07 
 
 		 249 aa  328  5.0000000000000004e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  65.42 
 
 		 246 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0595  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.22 
 
 		 259 aa  328  5.0000000000000004e-89  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.062853  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4427  ABC transporter related  63.79 
 
 		 254 aa  328  6e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120026  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  61 
 
 		 259 aa  328  6e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2821  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  60.49 
 
 		 248 aa  328  7e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.668457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5082  ABC transporter related  65.55 
 
 		 244 aa  328  8e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.27733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  64.58 
 
 		 246 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2327  ABC transporter related  63.67 
 
 		 252 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2825  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  60.49 
 
 		 248 aa  326  2.0000000000000001e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2552  ABC transporter related  64.17 
 
 		 245 aa  326  3e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221216  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  63.33 
 
 		 242 aa  325  3e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7087  ABC transporter related  62.81 
 
 		 254 aa  326  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1526  ABC transporter, ATPase subunit  64.46 
 
 		 247 aa  325  4.0000000000000003e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1741  ABC transporter related  63.35 
 
 		 267 aa  325  5e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  64.17 
 
 		 246 aa  324  9e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3332  ABC transporter related  64.73 
 
 		 261 aa  323  1e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1702  ABC transporter related  63.11 
 
 		 253 aa  323  2e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.478201 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  62.92 
 
 		 249 aa  323  2e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5947  ABC transporter related  59.46 
 
 		 254 aa  322  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0218631 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2987  ABC transporter related  64.88 
 
 		 257 aa  322  3e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715624  normal  0.638101 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2139  ABC transporter-related protein  65.31 
 
 		 251 aa  320  9.999999999999999e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2846  ABC transporter related  59.76 
 
 		 251 aa  320  9.999999999999999e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.92934  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  63.22 
 
 		 245 aa  319  3e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5511  ABC transporter related  61.25 
 
 		 247 aa  318  6e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233836  decreased coverage  0.000387504 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2068  ABC transporter related  64.05 
 
 		 247 aa  317  7.999999999999999e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7857  ABC transporter related  61.09 
 
 		 261 aa  317  7.999999999999999e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1247  ABC transporter related protein  61.22 
 
 		 249 aa  317  1e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0795163  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3950  AABC amino acid transporter, ATPase subunit  61.67 
 
 		 250 aa  316  2e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  62.5 
 
 		 250 aa  316  2e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3961  ABC transporter related  61.25 
 
 		 248 aa  315  4e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.533772 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  59.02 
 
 		 251 aa  314  9e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2412  ABC transporter related  61.92 
 
 		 250 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.177058 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  60.17 
 
 		 242 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  59.34 
 
 		 242 aa  312  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  60.24 
 
 		 257 aa  312  3.9999999999999997e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  59.34 
 
 		 244 aa  311  4.999999999999999e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>