More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1594 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  100 
 
 		 259 aa  525  1e-148  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  78.29 
 
 		 261 aa  412  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  80.17 
 
 		 251 aa  405  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  77.55 
 
 		 270 aa  402  1e-111  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0020  amino acid ABC transporter ATPase  76.47 
 
 		 256 aa  401  1e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.732673  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  78.93 
 
 		 257 aa  403  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  80.17 
 
 		 258 aa  401  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  76.08 
 
 		 251 aa  398  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  72.2 
 
 		 256 aa  395  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1551  ABC transporter related protein  77.37 
 
 		 264 aa  396  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.019793 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  76.52 
 
 		 254 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  76.52 
 
 		 254 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  76.33 
 
 		 262 aa  393  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  77.2 
 
 		 257 aa  391  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2223  amino acid permease ATP-binding protein  75.81 
 
 		 251 aa  393  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  77.27 
 
 		 242 aa  391  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1247  ABC transporter related protein  77.69 
 
 		 249 aa  390  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0795163  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  76.13 
 
 		 247 aa  384  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22740  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  71.97 
 
 		 264 aa  381  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547683  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  71.04 
 
 		 251 aa  382  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  74.49 
 
 		 244 aa  380  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3286  ABC transporter related protein  77.78 
 
 		 280 aa  382  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00174942  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3987  ABC transporter related  73.49 
 
 		 255 aa  383  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  73.88 
 
 		 247 aa  377  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  73.55 
 
 		 242 aa  378  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  74.29 
 
 		 248 aa  380  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  71.49 
 
 		 252 aa  375  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1395  ABC transporter related  73.47 
 
 		 251 aa  376  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2428  ABC transporter-related protein  75.72 
 
 		 264 aa  373  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419191  normal  0.0707207 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  73.25 
 
 		 250 aa  370  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15420  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  72.54 
 
 		 274 aa  363  2e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0145582  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  71.07 
 
 		 242 aa  357  7e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  69.14 
 
 		 244 aa  351  5.9999999999999994e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3519  ABC transporter related  64.61 
 
 		 244 aa  333  2e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  61.73 
 
 		 252 aa  317  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  59.92 
 
 		 242 aa  316  2e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1832  ABC transporter related  63.22 
 
 		 242 aa  315  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0351546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30090  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  65.7 
 
 		 252 aa  311  4.999999999999999e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1075  ABC transporter related  59.2 
 
 		 250 aa  310  1e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5082  ABC transporter related  62.71 
 
 		 244 aa  310  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.27733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  60.17 
 
 		 258 aa  309  2.9999999999999997e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  59.27 
 
 		 253 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  60.17 
 
 		 251 aa  309  2.9999999999999997e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.24 
 
 		 284 aa  309  2.9999999999999997e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7857  ABC transporter related  61.16 
 
 		 261 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  59.92 
 
 		 242 aa  309  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  59.26 
 
 		 255 aa  309  4e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  59.92 
 
 		 259 aa  308  4e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  59.18 
 
 		 246 aa  308  5e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  59.92 
 
 		 249 aa  308  5.9999999999999995e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  60.33 
 
 		 259 aa  308  5.9999999999999995e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  60.08 
 
 		 243 aa  308  5.9999999999999995e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  59.92 
 
 		 242 aa  308  5.9999999999999995e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  60.58 
 
 		 246 aa  308  5.9999999999999995e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  59.75 
 
 		 263 aa  308  6.999999999999999e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  61.97 
 
 		 246 aa  308  8e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  60.49 
 
 		 253 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  59.34 
 
 		 263 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  59.68 
 
 		 256 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.67 
 
 		 252 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  59.5 
 
 		 249 aa  306  3e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5511  ABC transporter related  60.33 
 
 		 247 aa  306  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233836  decreased coverage  0.000387504 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  61.09 
 
 		 258 aa  305  3e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  61.09 
 
 		 258 aa  305  3e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1300  general amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.42 
 
 		 254 aa  305  6e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4425  ABC transporter related  60.42 
 
 		 254 aa  305  6e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.329357 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4549  ABC transporter related  60.42 
 
 		 254 aa  305  6e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  60.74 
 
 		 253 aa  304  7e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.25 
 
 		 269 aa  305  7e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3674  ABC transporter related  60.24 
 
 		 265 aa  304  8.000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  60.42 
 
 		 242 aa  304  8.000000000000001e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2981  ABC transporter related  62.14 
 
 		 245 aa  304  9.000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3757  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.26 
 
 		 252 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0539181  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4592  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.26 
 
 		 252 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4441  ABC transporter related  59.36 
 
 		 255 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103673 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  57.72 
 
 		 249 aa  303  1.0000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0907  ABC transporter related  60 
 
 		 254 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  59.09 
 
 		 249 aa  303  1.0000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  58.92 
 
 		 262 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1959  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.83 
 
 		 251 aa  303  2.0000000000000002e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0443525  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  60 
 
 		 242 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.85 
 
 		 252 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0447  amino acid transporter ATP-binding protein  57.66 
 
 		 248 aa  303  2.0000000000000002e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1622  ABC transporter related  59.44 
 
 		 252 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320946  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2327  ABC transporter related  58.78 
 
 		 252 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  60.08 
 
 		 265 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1075  ABC transporter  59.26 
 
 		 254 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.520778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  58.51 
 
 		 262 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5947  ABC transporter related  57.6 
 
 		 254 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0218631 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4332  ABC transporter related  59.13 
 
 		 258 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.282174 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  60.83 
 
 		 242 aa  302  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0796  ABC transporter related  57.14 
 
 		 257 aa  303  3.0000000000000004e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  59.26 
 
 		 243 aa  302  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  58.51 
 
 		 262 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0435  ABC transporter related protein  58.85 
 
 		 252 aa  302  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.25 
 
 		 249 aa  302  4.0000000000000003e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  59.26 
 
 		 243 aa  302  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3964  ABC transporter related  58.82 
 
 		 258 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2812  ABC transporter related  58.06 
 
 		 260 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.844738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0435  ABC transporter related  58.85 
 
 		 252 aa  302  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.337414 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>