More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_22740 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_22740  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
264 aa  533  1e-150  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547683  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15420  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  75.91 
 
 
274 aa  407  1.0000000000000001e-112  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0145582  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  74.12 
 
 
257 aa  383  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  71.97 
 
 
259 aa  381  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1247  ABC transporter related protein  75.82 
 
 
249 aa  378  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0795163  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  75 
 
 
251 aa  379  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  75.41 
 
 
258 aa  380  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  70.83 
 
 
257 aa  375  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  69.32 
 
 
261 aa  368  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  67.43 
 
 
256 aa  364  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  72.29 
 
 
262 aa  362  2e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3987  ABC transporter related  70.8 
 
 
255 aa  363  2e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  69.96 
 
 
254 aa  362  3e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  69.96 
 
 
254 aa  362  3e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  69.84 
 
 
251 aa  361  5.0000000000000005e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1551  ABC transporter related protein  68.75 
 
 
264 aa  360  1e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.019793 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  71.31 
 
 
242 aa  357  8e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  69.26 
 
 
242 aa  356  1.9999999999999998e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  68.13 
 
 
251 aa  355  5.999999999999999e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2223  amino acid permease ATP-binding protein  71.02 
 
 
251 aa  353  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  70.28 
 
 
247 aa  353  1e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0020  amino acid ABC transporter ATPase  67.42 
 
 
256 aa  353  2e-96  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.732673  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  68.95 
 
 
270 aa  350  1e-95  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  69.39 
 
 
244 aa  350  2e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  67.76 
 
 
247 aa  347  1e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2428  ABC transporter-related protein  70.61 
 
 
264 aa  347  1e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419191  normal  0.0707207 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  68.27 
 
 
248 aa  346  2e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  67.47 
 
 
250 aa  342  2.9999999999999997e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3286  ABC transporter related protein  69.8 
 
 
280 aa  342  2.9999999999999997e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00174942  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1395  ABC transporter related  67.47 
 
 
251 aa  341  5.999999999999999e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  66.94 
 
 
244 aa  340  2e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  67.21 
 
 
242 aa  336  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  64.96 
 
 
252 aa  336  2.9999999999999997e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3519  ABC transporter related  64.49 
 
 
244 aa  326  3e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30090  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  67.21 
 
 
252 aa  318  5e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  61.63 
 
 
259 aa  311  4.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  60 
 
 
246 aa  310  1e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  60.25 
 
 
242 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  59.84 
 
 
242 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  58.4 
 
 
252 aa  306  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1959  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.63 
 
 
251 aa  306  3e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0443525  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  59.6 
 
 
252 aa  304  9.000000000000001e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  59.02 
 
 
253 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1885  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.23 
 
 
251 aa  302  4.0000000000000003e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00643068  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1075  ABC transporter related  60.41 
 
 
250 aa  301  9e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  60.08 
 
 
246 aa  300  1e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  57.61 
 
 
263 aa  300  1e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4510  ABC transporter related  61.32 
 
 
266 aa  300  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00592633  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5082  ABC transporter related  60.92 
 
 
244 aa  300  1e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.27733  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  58.94 
 
 
253 aa  300  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  61.44 
 
 
246 aa  300  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  58.7 
 
 
251 aa  299  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  58.1 
 
 
259 aa  299  3e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.87 
 
 
269 aa  299  3e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6378  ABC transporter related  61.41 
 
 
273 aa  298  6e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  61.41 
 
 
273 aa  298  7e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  59.92 
 
 
244 aa  297  1e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  58.2 
 
 
243 aa  296  2e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  59.75 
 
 
247 aa  296  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.7 
 
 
284 aa  296  2e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5947  ABC transporter related  58.47 
 
 
254 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0218631 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  58.23 
 
 
258 aa  296  3e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  54.55 
 
 
255 aa  296  3e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  58.23 
 
 
258 aa  296  3e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  57.72 
 
 
247 aa  296  3e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2981  ABC transporter related  60.66 
 
 
245 aa  295  4e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137964  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0055  general L-amino acid transport ATP-binding protein  56.65 
 
 
268 aa  295  4e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2319  ABC transporter related  56.54 
 
 
260 aa  295  5e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  58.02 
 
 
244 aa  295  5e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  56.97 
 
 
258 aa  295  6e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  59.44 
 
 
248 aa  295  6e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.74 
 
 
240 aa  295  7e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3597  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.54 
 
 
260 aa  295  7e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345291  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  54.94 
 
 
253 aa  294  8e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2987  ABC transporter related  59.84 
 
 
257 aa  294  1e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715624  normal  0.638101 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  57.49 
 
 
253 aa  294  1e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1343  ABC transporter related  59.11 
 
 
246 aa  293  1e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7087  ABC transporter related  57.25 
 
 
254 aa  294  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  57.79 
 
 
242 aa  293  2e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2327  ABC transporter related  55.73 
 
 
252 aa  293  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  57.48 
 
 
269 aa  293  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  56.79 
 
 
263 aa  293  2e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  56.3 
 
 
267 aa  293  2e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.47 
 
 
249 aa  293  3e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  59.09 
 
 
241 aa  292  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  56.81 
 
 
257 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0447  amino acid transporter ATP-binding protein  54.62 
 
 
248 aa  293  3e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2175  ABC transporter related  58.26 
 
 
260 aa  292  3e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.240046  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  59.02 
 
 
247 aa  293  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.78 
 
 
253 aa  292  4e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  54.09 
 
 
258 aa  292  4e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  56.68 
 
 
246 aa  292  4e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  59.02 
 
 
245 aa  292  4e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  56.05 
 
 
248 aa  291  5e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2812  ABC transporter related  55.38 
 
 
260 aa  292  5e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.844738  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  59.18 
 
 
256 aa  292  5e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  58.63 
 
 
248 aa  291  6e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7857  ABC transporter related  57.77 
 
 
261 aa  291  8e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  56.42 
 
 
257 aa  291  9e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3961  ABC transporter related  58.61 
 
 
248 aa  291  1e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.533772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>