More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1125 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  100 
 
 		 250 aa  508  1e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2223  amino acid permease ATP-binding protein  80.8 
 
 		 251 aa  414  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  80.25 
 
 		 247 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  77.6 
 
 		 247 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  78.51 
 
 		 257 aa  393  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  75.1 
 
 		 252 aa  393  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  77.2 
 
 		 248 aa  390  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  76.1 
 
 		 262 aa  388  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  75.21 
 
 		 251 aa  388  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  75.21 
 
 		 258 aa  387  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1395  ABC transporter related  76.49 
 
 		 251 aa  389  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  74.9 
 
 		 257 aa  383  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  74.3 
 
 		 251 aa  383  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  73.25 
 
 		 259 aa  378  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1247  ABC transporter related protein  73.14 
 
 		 249 aa  375  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0795163  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  72.84 
 
 		 244 aa  375  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1551  ABC transporter related protein  73.66 
 
 		 264 aa  373  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.019793 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  70.56 
 
 		 261 aa  372  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  70.08 
 
 		 270 aa  370  1e-101  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  70.78 
 
 		 254 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  70.78 
 
 		 254 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3286  ABC transporter related protein  76.13 
 
 		 280 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00174942  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0020  amino acid ABC transporter ATPase  71.6 
 
 		 256 aa  364  1e-100  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.732673  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  70.66 
 
 		 242 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  71.07 
 
 		 242 aa  363  1e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3987  ABC transporter related  68.42 
 
 		 255 aa  362  3e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2428  ABC transporter-related protein  72.43 
 
 		 264 aa  360  1e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419191  normal  0.0707207 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  68.42 
 
 		 251 aa  360  2e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15420  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  72.54 
 
 		 274 aa  359  2e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0145582  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  67.21 
 
 		 256 aa  357  8e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  69.96 
 
 		 244 aa  353  1e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22740  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  67.47 
 
 		 264 aa  350  2e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547683  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  69.83 
 
 		 242 aa  349  3e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3519  ABC transporter related  68.72 
 
 		 244 aa  344  8e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  64.75 
 
 		 251 aa  332  4e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  65.02 
 
 		 252 aa  331  8e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  62.65 
 
 		 253 aa  328  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  63.64 
 
 		 259 aa  321  8e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3597  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  62.5 
 
 		 260 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2319  ABC transporter related  62.5 
 
 		 260 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1075  ABC transporter related  60.91 
 
 		 250 aa  320  9.999999999999999e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2175  ABC transporter related  62.5 
 
 		 260 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.240046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  61.41 
 
 		 262 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  61.41 
 
 		 262 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  61.83 
 
 		 262 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  62.5 
 
 		 249 aa  318  3.9999999999999996e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0796  ABC transporter related  62.24 
 
 		 257 aa  318  6e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  61.57 
 
 		 265 aa  318  7e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  61.98 
 
 		 267 aa  317  2e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  61.83 
 
 		 253 aa  315  5e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  63.64 
 
 		 245 aa  314  9e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2139  ABC transporter-related protein  62 
 
 		 251 aa  313  1.9999999999999998e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  62.5 
 
 		 252 aa  313  1.9999999999999998e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  60.58 
 
 		 263 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  60.58 
 
 		 253 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  59.5 
 
 		 242 aa  312  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  63.6 
 
 		 273 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  60.74 
 
 		 242 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2327  ABC transporter related  59.13 
 
 		 252 aa  311  4.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  59.75 
 
 		 258 aa  311  5.999999999999999e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  61.22 
 
 		 245 aa  311  6.999999999999999e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3674  ABC transporter related  63.75 
 
 		 265 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  62.08 
 
 		 242 aa  311  7.999999999999999e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  58.68 
 
 		 249 aa  311  7.999999999999999e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  59.09 
 
 		 249 aa  311  7.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6378  ABC transporter related  61.69 
 
 		 273 aa  310  9e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  60.33 
 
 		 246 aa  310  1e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3710  ABC transporter related  60 
 
 		 252 aa  310  1e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.110417 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7087  ABC transporter related  62.5 
 
 		 254 aa  310  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  62.14 
 
 		 243 aa  310  1e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  60.91 
 
 		 246 aa  310  1e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  61.16 
 
 		 244 aa  310  1e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61 
 
 		 253 aa  310  2e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  60.17 
 
 		 263 aa  310  2e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5082  ABC transporter related  64.81 
 
 		 244 aa  310  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.27733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  59.68 
 
 		 257 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0238  ABC transporter related  62.92 
 
 		 250 aa  309  2.9999999999999997e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.783536  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0244  ABC transporter related  62.92 
 
 		 250 aa  309  2.9999999999999997e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1343  ABC transporter related  60.08 
 
 		 246 aa  308  4e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2812  ABC transporter related  60 
 
 		 260 aa  308  4e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.844738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  59.26 
 
 		 255 aa  308  4e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4546  ABC transporter related  61.22 
 
 		 260 aa  308  4e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.0112462 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1526  ABC transporter, ATPase subunit  60.82 
 
 		 247 aa  308  5.9999999999999995e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  60.42 
 
 		 253 aa  308  5.9999999999999995e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3332  ABC transporter related  60.08 
 
 		 261 aa  308  5.9999999999999995e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  62.08 
 
 		 244 aa  308  6.999999999999999e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  61 
 
 		 244 aa  308  8e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  60.42 
 
 		 241 aa  307  8e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1959  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.68 
 
 		 251 aa  307  9e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0443525  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  59.67 
 
 		 253 aa  307  9e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  59.68 
 
 		 257 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.58 
 
 		 284 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  60.74 
 
 		 247 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3860  ABC transporter related  60 
 
 		 253 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30090  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  63.64 
 
 		 252 aa  306  2.0000000000000002e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  59.68 
 
 		 258 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.68 
 
 		 269 aa  306  2.0000000000000002e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0230  ABC transporter related protein  59.67 
 
 		 253 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  59.59 
 
 		 248 aa  306  2.0000000000000002e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  59.68 
 
 		 258 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>