More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1001 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  100 
 
 		 267 aa  555  1e-157  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  80.56 
 
 		 262 aa  434  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  83.95 
 
 		 258 aa  435  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  79.22 
 
 		 262 aa  435  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  83.95 
 
 		 258 aa  435  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  79.22 
 
 		 262 aa  435  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  83.13 
 
 		 257 aa  430  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  83.13 
 
 		 257 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  82.92 
 
 		 256 aa  424  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0976  ABC transporter-like  78.86 
 
 		 254 aa  425  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  81.48 
 
 		 269 aa  425  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  78.57 
 
 		 263 aa  425  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  81.07 
 
 		 249 aa  421  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1075  ABC transporter  76.8 
 
 		 254 aa  421  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.520778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  81.07 
 
 		 269 aa  422  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  76.28 
 
 		 253 aa  421  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  77.25 
 
 		 263 aa  421  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  79.76 
 
 		 258 aa  421  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1300  general amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  77.96 
 
 		 254 aa  418  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1258  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  76.4 
 
 		 254 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13929  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0907  ABC transporter related  78.37 
 
 		 254 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  80.66 
 
 		 267 aa  418  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4425  ABC transporter related  77.96 
 
 		 254 aa  418  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.329357 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4510  ABC transporter related  77.31 
 
 		 266 aa  420  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00592633  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4549  ABC transporter related  77.96 
 
 		 254 aa  418  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  80.58 
 
 		 273 aa  417  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6378  ABC transporter related  80.58 
 
 		 273 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0796  ABC transporter related  78.86 
 
 		 257 aa  415  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  78.1 
 
 		 258 aa  412  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  77.05 
 
 		 249 aa  411  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  75.7 
 
 		 251 aa  412  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  76.64 
 
 		 249 aa  410  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  71.1 
 
 		 259 aa  409  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  76.64 
 
 		 249 aa  406  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0055  general L-amino acid transport ATP-binding protein  80 
 
 		 268 aa  402  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03129  predicted amino-acid transporter subunit  75.31 
 
 		 252 aa  397  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0435  ABC transporter related protein  75.31 
 
 		 252 aa  397  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0435  ABC transporter related  75.31 
 
 		 252 aa  397  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.337414 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3757  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  75.72 
 
 		 252 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0539181  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0230  ABC transporter related protein  76.54 
 
 		 253 aa  398  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  76.42 
 
 		 255 aa  399  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4427  ABC transporter related  74.21 
 
 		 254 aa  399  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120026  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03080  hypothetical protein  75.31 
 
 		 252 aa  397  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3466  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  75.31 
 
 		 252 aa  397  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0172997  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  75.31 
 
 		 252 aa  399  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4592  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  75.72 
 
 		 252 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  75.72 
 
 		 253 aa  397  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3860  ABC transporter related  74.29 
 
 		 253 aa  394  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  75.31 
 
 		 253 aa  395  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3710  ABC transporter related  75.31 
 
 		 252 aa  395  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.110417 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  77.5 
 
 		 246 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  74.9 
 
 		 252 aa  396  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2327  ABC transporter related  76.54 
 
 		 252 aa  393  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  75.83 
 
 		 249 aa  394  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7857  ABC transporter related  74.48 
 
 		 261 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  75.42 
 
 		 246 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  73.77 
 
 		 247 aa  387  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1526  ABC transporter, ATPase subunit  73.66 
 
 		 247 aa  387  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  73.47 
 
 		 246 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2552  ABC transporter related  74.58 
 
 		 245 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221216  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3950  AABC amino acid transporter, ATPase subunit  72.5 
 
 		 250 aa  378  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2987  ABC transporter related  72.58 
 
 		 257 aa  377  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715624  normal  0.638101 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2068  ABC transporter related  74.79 
 
 		 247 aa  374  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2821  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  70.9 
 
 		 248 aa  375  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.668457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2825  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  70.49 
 
 		 248 aa  375  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  73.33 
 
 		 251 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2846  ABC transporter related  70.42 
 
 		 251 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.92934  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_004310  BR1959  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  70.42 
 
 		 251 aa  368  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0443525  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3674  ABC transporter related  72.69 
 
 		 265 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5511  ABC transporter related  67.61 
 
 		 247 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233836  decreased coverage  0.000387504 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2139  ABC transporter-related protein  72.06 
 
 		 251 aa  365  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1885  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  70 
 
 		 251 aa  365  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00643068  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1075  ABC transporter related  66.4 
 
 		 250 aa  365  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  68.22 
 
 		 259 aa  364  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  69.39 
 
 		 265 aa  363  2e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7087  ABC transporter related  70.61 
 
 		 254 aa  361  6e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  70.9 
 
 		 253 aa  361  8e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5947  ABC transporter related  71.07 
 
 		 254 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0218631 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3332  ABC transporter related  69.51 
 
 		 261 aa  359  2e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4870  ABC transporter related  68.75 
 
 		 256 aa  358  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.933928  normal  0.605559 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5082  ABC transporter related  71.43 
 
 		 244 aa  358  7e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.27733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1702  ABC transporter related  69.83 
 
 		 253 aa  356  1.9999999999999998e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.478201 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3584  ABC transporter related  68.44 
 
 		 255 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.34638  normal  0.0302261 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  68.18 
 
 		 244 aa  351  8.999999999999999e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1599  ABC transporter related  70.78 
 
 		 261 aa  350  1e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.920866 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  66.8 
 
 		 253 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1152  ABC transporter related  67.22 
 
 		 252 aa  350  2e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  67.36 
 
 		 252 aa  349  2e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1741  ABC transporter related  68.55 
 
 		 267 aa  349  2e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  67.5 
 
 		 246 aa  347  1e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  67.5 
 
 		 246 aa  345  5e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0985  ABC transporter related  66.39 
 
 		 247 aa  344  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.178128 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2319  ABC transporter related  66.53 
 
 		 260 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2175  ABC transporter related  66.26 
 
 		 260 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.240046  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3597  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  66.53 
 
 		 260 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2001  ABC transporter related  68.94 
 
 		 258 aa  339  2e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0519  ABC transporter related  68.88 
 
 		 247 aa  339  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4002  ABC transporter related  69.26 
 
 		 253 aa  339  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0536  ABC transporter related  68.88 
 
 		 247 aa  338  4e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  65.71 
 
 		 245 aa  337  9.999999999999999e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>