More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1048 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  100 
 
 
245 aa  495  1e-139  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  89.8 
 
 
245 aa  450  1.0000000000000001e-126  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  79.34 
 
 
244 aa  397  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  67.9 
 
 
249 aa  342  4e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  66.12 
 
 
255 aa  341  8e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1152  ABC transporter related  67.63 
 
 
252 aa  338  4e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3674  ABC transporter related  66.8 
 
 
265 aa  337  8e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  64.75 
 
 
267 aa  337  8e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1959  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.58 
 
 
251 aa  337  9.999999999999999e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0443525  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  67.08 
 
 
243 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  65.71 
 
 
267 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0230  ABC transporter related protein  65.16 
 
 
253 aa  337  9.999999999999999e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3860  ABC transporter related  63.93 
 
 
253 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  64.34 
 
 
253 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2552  ABC transporter related  66.8 
 
 
245 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221216  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.34 
 
 
269 aa  336  1.9999999999999998e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  64.75 
 
 
253 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.34 
 
 
249 aa  335  3.9999999999999995e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  66.25 
 
 
240 aa  335  3.9999999999999995e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  64.32 
 
 
253 aa  335  3.9999999999999995e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  66.53 
 
 
247 aa  335  5e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  66.12 
 
 
259 aa  334  7e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  64.75 
 
 
256 aa  334  7e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1885  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.17 
 
 
251 aa  334  7.999999999999999e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00643068  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  64.34 
 
 
249 aa  334  9e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  63.52 
 
 
258 aa  333  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0976  ABC transporter-like  64.2 
 
 
254 aa  333  1e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  63.52 
 
 
258 aa  333  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1526  ABC transporter, ATPase subunit  66.26 
 
 
247 aa  333  2e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  67.5 
 
 
246 aa  333  2e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0907  ABC transporter related  64.61 
 
 
254 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  65.84 
 
 
243 aa  333  2e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  63.93 
 
 
249 aa  332  4e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  66.25 
 
 
246 aa  332  4e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1300  general amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.2 
 
 
254 aa  331  6e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4425  ABC transporter related  64.2 
 
 
254 aa  331  6e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.329357 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4549  ABC transporter related  64.2 
 
 
254 aa  331  6e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  64.46 
 
 
252 aa  331  6e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  64.75 
 
 
265 aa  331  6e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  64.34 
 
 
262 aa  331  7.000000000000001e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  63.52 
 
 
257 aa  331  7.000000000000001e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  65.83 
 
 
246 aa  331  7.000000000000001e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  64.34 
 
 
262 aa  331  7.000000000000001e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  63.93 
 
 
257 aa  331  8e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  65.43 
 
 
251 aa  331  8e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  63.93 
 
 
262 aa  330  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  63.27 
 
 
256 aa  329  2e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  63.79 
 
 
258 aa  329  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  62.7 
 
 
269 aa  329  2e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.52 
 
 
251 aa  328  3e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1075  ABC transporter  63.52 
 
 
254 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.520778  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  64.2 
 
 
243 aa  328  5.0000000000000004e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3710  ABC transporter related  63.52 
 
 
252 aa  328  6e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.110417 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  63.27 
 
 
263 aa  327  7e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  65 
 
 
246 aa  327  9e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03129  predicted amino-acid transporter subunit  63.93 
 
 
252 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0435  ABC transporter related protein  63.93 
 
 
252 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03080  hypothetical protein  63.93 
 
 
252 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1258  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.11 
 
 
254 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13929  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  63.11 
 
 
249 aa  327  1.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3466  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.93 
 
 
252 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0172997  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0435  ABC transporter related  63.93 
 
 
252 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.337414 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  66.39 
 
 
244 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2001  ABC transporter related  68.94 
 
 
258 aa  327  1.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.52 
 
 
252 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  66.67 
 
 
246 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1741  ABC transporter related  65.71 
 
 
267 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  64.34 
 
 
244 aa  326  2.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3332  ABC transporter related  64.75 
 
 
261 aa  326  2.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4592  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.52 
 
 
252 aa  325  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723887  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3757  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.52 
 
 
252 aa  325  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0539181  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  62.45 
 
 
263 aa  325  5e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  61.07 
 
 
259 aa  325  5e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  62.81 
 
 
242 aa  324  7e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0796  ABC transporter related  63.52 
 
 
257 aa  323  1e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0055  general L-amino acid transport ATP-binding protein  64.17 
 
 
268 aa  323  1e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.7 
 
 
252 aa  323  1e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2581  ABC transporter related  63.01 
 
 
255 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.507078  normal  0.289132 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  61.57 
 
 
242 aa  323  2e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  62.66 
 
 
253 aa  323  2e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4950  ABC transporter related  62.3 
 
 
259 aa  322  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  63.93 
 
 
252 aa  323  2e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2981  ABC transporter related  65.7 
 
 
245 aa  323  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137964  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  62.45 
 
 
258 aa  323  2e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6378  ABC transporter related  62.7 
 
 
273 aa  322  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  62.96 
 
 
253 aa  322  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  62.76 
 
 
239 aa  322  3e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  62.86 
 
 
248 aa  322  4e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  62.92 
 
 
242 aa  322  4e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  62.5 
 
 
242 aa  322  5e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1075  ABC transporter related  62.3 
 
 
250 aa  322  5e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0519  ABC transporter related  66.39 
 
 
247 aa  321  6e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  63.27 
 
 
253 aa  321  7e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4510  ABC transporter related  63.9 
 
 
266 aa  321  7e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00592633  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2319  ABC transporter related  63.64 
 
 
260 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5947  ABC transporter related  63.79 
 
 
254 aa  319  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0218631 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3950  AABC amino acid transporter, ATPase subunit  64.68 
 
 
250 aa  319  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0536  ABC transporter related  65.98 
 
 
247 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2068  ABC transporter related  66.67 
 
 
247 aa  318  3e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2175  ABC transporter related  63.22 
 
 
260 aa  319  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.240046  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>