More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3950 on replicon NC_007488
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007488  RSP_3950  AABC amino acid transporter, ATPase subunit  100 
 
 
250 aa  516  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6378  ABC transporter related  73.47 
 
 
273 aa  388  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  72.36 
 
 
258 aa  385  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  72.36 
 
 
258 aa  385  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  71.54 
 
 
258 aa  384  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  72.36 
 
 
273 aa  384  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  72.13 
 
 
269 aa  382  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  72.5 
 
 
249 aa  382  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4592  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  70.9 
 
 
252 aa  381  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723887  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  73.03 
 
 
256 aa  383  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  72.5 
 
 
249 aa  382  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4510  ABC transporter related  72.76 
 
 
266 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00592633  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3757  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  70.9 
 
 
252 aa  381  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0539181  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  70.04 
 
 
257 aa  377  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  71.72 
 
 
249 aa  378  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  71.67 
 
 
259 aa  379  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1075  ABC transporter  71.43 
 
 
254 aa  377  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.520778  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0907  ABC transporter related  73.33 
 
 
254 aa  377  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0976  ABC transporter-like  72.92 
 
 
254 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  72.08 
 
 
249 aa  379  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  72.5 
 
 
267 aa  378  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  70.08 
 
 
252 aa  379  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  70.49 
 
 
252 aa  380  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  71.02 
 
 
253 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.233351 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03129  predicted amino-acid transporter subunit  70.08 
 
 
252 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0435  ABC transporter related protein  70.08 
 
 
252 aa  377  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1300  general amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  72.92 
 
 
254 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03080  hypothetical protein  70.08 
 
 
252 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1258  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  71.02 
 
 
254 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13929  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4425  ABC transporter related  72.92 
 
 
254 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.329357 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  70.66 
 
 
262 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0435  ABC transporter related  70.08 
 
 
252 aa  377  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.337414 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  69.64 
 
 
253 aa  375  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3860  ABC transporter related  69.92 
 
 
253 aa  375  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  71.07 
 
 
263 aa  377  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  72.13 
 
 
267 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  70.04 
 
 
257 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2846  ABC transporter related  71.25 
 
 
251 aa  375  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.92934  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  70.66 
 
 
262 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4549  ABC transporter related  72.92 
 
 
254 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3466  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  70.08 
 
 
252 aa  377  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0172997  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  70.66 
 
 
262 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  70.04 
 
 
258 aa  374  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  71.37 
 
 
269 aa  375  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  69.64 
 
 
253 aa  372  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  70.25 
 
 
263 aa  373  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7857  ABC transporter related  70.83 
 
 
261 aa  373  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3710  ABC transporter related  68.85 
 
 
252 aa  371  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.110417 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  70.42 
 
 
251 aa  369  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0230  ABC transporter related protein  69.23 
 
 
253 aa  370  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0055  general L-amino acid transport ATP-binding protein  72.77 
 
 
268 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  69.87 
 
 
255 aa  365  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0796  ABC transporter related  69.01 
 
 
257 aa  363  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2552  ABC transporter related  67.49 
 
 
245 aa  363  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221216  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  66.8 
 
 
247 aa  363  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1526  ABC transporter, ATPase subunit  70.51 
 
 
247 aa  361  5.0000000000000005e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_004310  BR1959  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  69.71 
 
 
251 aa  361  7.0000000000000005e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0443525  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  68.8 
 
 
246 aa  361  7.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  67.95 
 
 
246 aa  358  4e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1885  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  69.29 
 
 
251 aa  357  7e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00643068  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1075  ABC transporter related  69.17 
 
 
250 aa  357  8e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2327  ABC transporter related  65.6 
 
 
252 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  66.95 
 
 
246 aa  355  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5511  ABC transporter related  65.69 
 
 
247 aa  353  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233836  decreased coverage  0.000387504 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  66.27 
 
 
249 aa  353  1e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4870  ABC transporter related  65.86 
 
 
256 aa  350  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.933928  normal  0.605559 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  68.18 
 
 
251 aa  348  6e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  65.84 
 
 
259 aa  347  1e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2825  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  65.69 
 
 
248 aa  345  3e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3332  ABC transporter related  67.08 
 
 
261 aa  345  3e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5947  ABC transporter related  67.08 
 
 
254 aa  345  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0218631 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  65.32 
 
 
265 aa  345  4e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3584  ABC transporter related  66.39 
 
 
255 aa  344  8.999999999999999e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.34638  normal  0.0302261 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7087  ABC transporter related  66.8 
 
 
254 aa  343  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1702  ABC transporter related  70.09 
 
 
253 aa  343  2e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.478201 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4427  ABC transporter related  65.71 
 
 
254 aa  342  2.9999999999999997e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120026  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2821  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  65.27 
 
 
248 aa  342  2.9999999999999997e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.668457  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  66.53 
 
 
253 aa  342  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2068  ABC transporter related  68.8 
 
 
247 aa  341  5e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  67.08 
 
 
243 aa  340  2e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  66.53 
 
 
252 aa  340  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5082  ABC transporter related  67.22 
 
 
244 aa  340  2e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.27733  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  66.25 
 
 
243 aa  335  3.9999999999999995e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3674  ABC transporter related  68.8 
 
 
265 aa  334  7e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2987  ABC transporter related  67.09 
 
 
257 aa  334  9e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715624  normal  0.638101 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  66.25 
 
 
243 aa  332  2e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1599  ABC transporter related  68.18 
 
 
261 aa  332  3e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.920866 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1152  ABC transporter related  66.67 
 
 
252 aa  332  3e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3991  ABC transporter related  63.6 
 
 
261 aa  331  7.000000000000001e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  62.92 
 
 
242 aa  331  8e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  62.5 
 
 
242 aa  330  1e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1741  ABC transporter related  67.5 
 
 
267 aa  330  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2622  ABC transporter related  66.81 
 
 
241 aa  329  2e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  64.85 
 
 
246 aa  328  4e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4182  ABC transporter related protein  62.76 
 
 
261 aa  327  8e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  63.6 
 
 
246 aa  326  2.0000000000000001e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  65.81 
 
 
253 aa  326  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4091  ABC transporter related  59.41 
 
 
247 aa  326  2.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.231596 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2139  ABC transporter-related protein  64.75 
 
 
251 aa  325  4.0000000000000003e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0519  ABC transporter related  63.33 
 
 
247 aa  324  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>