More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1431 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  100 
 
 		 248 aa  504  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1395  ABC transporter related  97.98 
 
 		 251 aa  495  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  79.27 
 
 		 247 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  76.92 
 
 		 262 aa  394  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  74.49 
 
 		 251 aa  387  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  76.83 
 
 		 247 aa  387  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  77.27 
 
 		 257 aa  385  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2223  amino acid permease ATP-binding protein  77.37 
 
 		 251 aa  385  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1551  ABC transporter related protein  76.64 
 
 		 264 aa  384  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.019793 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  77.2 
 
 		 250 aa  380  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  74.29 
 
 		 252 aa  384  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  72.87 
 
 		 256 aa  382  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  75.31 
 
 		 244 aa  384  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  74.49 
 
 		 251 aa  381  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  76.13 
 
 		 257 aa  380  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  73.47 
 
 		 261 aa  379  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  74.29 
 
 		 259 aa  380  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  73.66 
 
 		 254 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  73.66 
 
 		 254 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  73.31 
 
 		 258 aa  375  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3987  ABC transporter related  73.28 
 
 		 255 aa  377  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  72.91 
 
 		 251 aa  377  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  72.31 
 
 		 242 aa  370  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  73.55 
 
 		 242 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  70.2 
 
 		 270 aa  367  1e-100  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1247  ABC transporter related protein  74.38 
 
 		 249 aa  367  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0795163  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3286  ABC transporter related protein  75.31 
 
 		 280 aa  362  4e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00174942  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2428  ABC transporter-related protein  73.25 
 
 		 264 aa  359  3e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419191  normal  0.0707207 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  70.78 
 
 		 244 aa  354  5.999999999999999e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0020  amino acid ABC transporter ATPase  69.39 
 
 		 256 aa  353  1e-96  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.732673  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15420  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  70.45 
 
 		 274 aa  353  2e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0145582  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22740  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  68.27 
 
 		 264 aa  346  2e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547683  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3519  ABC transporter related  69.14 
 
 		 244 aa  344  7e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  68.6 
 
 		 242 aa  340  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  64.63 
 
 		 246 aa  323  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  61.94 
 
 		 252 aa  321  7e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  62.3 
 
 		 249 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  64.92 
 
 		 252 aa  319  3e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4546  ABC transporter related  64.49 
 
 		 260 aa  316  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.0112462 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  62.6 
 
 		 246 aa  317  2e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4480  ABC transporter related  63.97 
 
 		 266 aa  316  3e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  62.2 
 
 		 246 aa  316  3e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  59.92 
 
 		 242 aa  315  4e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1179  ABC transporter related  66.25 
 
 		 241 aa  315  6e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0654977 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  61.98 
 
 		 244 aa  312  2.9999999999999996e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  60.41 
 
 		 248 aa  312  2.9999999999999996e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  61.63 
 
 		 251 aa  312  2.9999999999999996e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1100  ABC transporter related  62.92 
 
 		 241 aa  311  5.999999999999999e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2139  ABC transporter-related protein  62.9 
 
 		 251 aa  311  9e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  60.33 
 
 		 242 aa  310  1e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  61.67 
 
 		 242 aa  310  1e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0779  glutamate/aspartate ABC transporter ATP-binding protein  65.42 
 
 		 241 aa  308  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0705  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  65.42 
 
 		 241 aa  308  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0815  glutamate/aspartate ABC transporter ATP-binding protein  65.42 
 
 		 241 aa  308  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0766  glutamate/aspartate ABC transporter ATP-binding protein  65.42 
 
 		 241 aa  308  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.860071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  60.74 
 
 		 267 aa  308  5e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1547  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.17 
 
 		 241 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  60.16 
 
 		 263 aa  308  5.9999999999999995e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5082  ABC transporter related  61.57 
 
 		 244 aa  308  5.9999999999999995e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.27733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  59.76 
 
 		 263 aa  306  1.0000000000000001e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1343  ABC transporter related  60.57 
 
 		 246 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  60.33 
 
 		 259 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  62.04 
 
 		 253 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  60.33 
 
 		 253 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.22 
 
 		 253 aa  305  3e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30090  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  61.54 
 
 		 252 aa  305  3e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2327  ABC transporter related  58.47 
 
 		 252 aa  305  3e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  59.44 
 
 		 258 aa  306  3e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  60.16 
 
 		 262 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  60.16 
 
 		 262 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4441  ABC transporter related  62.55 
 
 		 255 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103673 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  59.09 
 
 		 242 aa  305  5.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0719  glutamate/aspartate ABC transporter ATP-binding protein  65 
 
 		 241 aa  305  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  59.84 
 
 		 253 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  62.86 
 
 		 245 aa  304  7e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.86 
 
 		 284 aa  304  8.000000000000001e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1832  ABC transporter related  61.57 
 
 		 242 aa  304  8.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0351546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2570  ABC transporter related  61.25 
 
 		 241 aa  304  9.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0998599  normal  0.044732 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  59.76 
 
 		 262 aa  304  9.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2136  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.58 
 
 		 241 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.68203  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0831  ABC transporter related  60.48 
 
 		 249 aa  304  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2005  polar amino acid ABC transporter ATP-binding protein  64.58 
 
 		 241 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.545359  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3005  polar amino acid ABC transporter ATP-binding protein  64.58 
 
 		 241 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2258  ABC transporter related  61.89 
 
 		 286 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21556  normal  0.633697 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  59.59 
 
 		 259 aa  304  1.0000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0775  polar amino acid ABC transporter ATP-binding protein  64.58 
 
 		 241 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2609  polar amino acid ABC transporter ATP-binding protein  64.58 
 
 		 241 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.647404  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.08 
 
 		 240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  59.51 
 
 		 253 aa  303  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  59.58 
 
 		 242 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7857  ABC transporter related  60.82 
 
 		 261 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  60.82 
 
 		 245 aa  303  2.0000000000000002e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2001  ABC transporter related  64.58 
 
 		 258 aa  303  2.0000000000000002e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3710  ABC transporter related  58.94 
 
 		 252 aa  303  2.0000000000000002e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.110417 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.16 
 
 		 269 aa  302  3.0000000000000004e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0519  ABC transporter related  60.73 
 
 		 247 aa  302  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0673  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  64.17 
 
 		 241 aa  302  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0536  ABC transporter related  60.73 
 
 		 247 aa  302  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4070  ABC transporter-related protein  61.63 
 
 		 245 aa  302  3.0000000000000004e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2974  ABC transporter related protein  64.17 
 
 		 241 aa  302  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>