More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_360 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 284 aa  587  1e-167  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  95.65 
 
 		 253 aa  499  1e-140  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  94.47 
 
 		 253 aa  494  1e-139  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  67.92 
 
 		 249 aa  333  3e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  67.92 
 
 		 240 aa  332  4e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  64.54 
 
 		 253 aa  330  2e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.95 
 
 		 269 aa  329  3e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  64.78 
 
 		 252 aa  328  7e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  66.25 
 
 		 246 aa  327  1.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65 
 
 		 249 aa  326  3e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  62.55 
 
 		 269 aa  325  4.0000000000000003e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  65.27 
 
 		 239 aa  325  4.0000000000000003e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  66.53 
 
 		 246 aa  325  5e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  64.23 
 
 		 257 aa  325  7e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  64.75 
 
 		 246 aa  325  7e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  64.63 
 
 		 257 aa  324  8.000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  63.45 
 
 		 253 aa  324  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6378  ABC transporter related  65.42 
 
 		 273 aa  324  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  63.52 
 
 		 246 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  66.53 
 
 		 262 aa  323  3e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  66.53 
 
 		 262 aa  323  3e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1343  ABC transporter related  66.12 
 
 		 246 aa  322  4e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  63.41 
 
 		 273 aa  321  7e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4510  ABC transporter related  63.86 
 
 		 266 aa  321  7e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00592633  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  62.45 
 
 		 258 aa  321  7e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2758  ABC transporter related  63.1 
 
 		 252 aa  321  8e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1959  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.4 
 
 		 251 aa  321  8e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0443525  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  63.97 
 
 		 257 aa  320  9.999999999999999e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  65.71 
 
 		 246 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  67.49 
 
 		 243 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  63.01 
 
 		 258 aa  319  3e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2552  ABC transporter related  63.64 
 
 		 245 aa  319  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221216  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  63.11 
 
 		 246 aa  319  3e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  63.01 
 
 		 258 aa  319  3e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  63.93 
 
 		 246 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  65.27 
 
 		 262 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  62.11 
 
 		 256 aa  318  9e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1885  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62 
 
 		 251 aa  318  9e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00643068  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  65.31 
 
 		 255 aa  317  1e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  62.25 
 
 		 267 aa  317  1e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  63.07 
 
 		 245 aa  317  1e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  62.81 
 
 		 244 aa  317  1e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  65.85 
 
 		 248 aa  317  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  65.04 
 
 		 247 aa  317  2e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  62.24 
 
 		 245 aa  316  3e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  63.9 
 
 		 247 aa  315  4e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  61.45 
 
 		 254 aa  315  5e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1075  ABC transporter  62.66 
 
 		 254 aa  315  5e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.520778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  61.45 
 
 		 254 aa  315  5e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3987  ABC transporter related  62.2 
 
 		 255 aa  315  6e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0055  general L-amino acid transport ATP-binding protein  63.75 
 
 		 268 aa  315  8e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  63.64 
 
 		 242 aa  314  9e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  62.4 
 
 		 262 aa  314  9e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1300  general amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.84 
 
 		 254 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1258  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.24 
 
 		 254 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13929  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4425  ABC transporter related  59.84 
 
 		 254 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.329357 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0976  ABC transporter-like  61.83 
 
 		 254 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0907  ABC transporter related  59.84 
 
 		 254 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4549  ABC transporter related  59.84 
 
 		 254 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  63.33 
 
 		 240 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  63.33 
 
 		 267 aa  314  9.999999999999999e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4870  ABC transporter related  61.38 
 
 		 256 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.933928  normal  0.605559 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  62.08 
 
 		 240 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  61.67 
 
 		 242 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  65.04 
 
 		 248 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  62.4 
 
 		 242 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  61.54 
 
 		 253 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0796  ABC transporter related  64.85 
 
 		 257 aa  311  4.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1526  ABC transporter, ATPase subunit  62.66 
 
 		 247 aa  311  6.999999999999999e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.24 
 
 		 252 aa  311  6.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  64.88 
 
 		 248 aa  311  7.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  61.57 
 
 		 244 aa  311  7.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03129  predicted amino-acid transporter subunit  62.24 
 
 		 252 aa  310  1e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0435  ABC transporter related protein  62.24 
 
 		 252 aa  310  1e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3466  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.24 
 
 		 252 aa  310  1e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0172997  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0230  ABC transporter related protein  61.54 
 
 		 253 aa  311  1e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0435  ABC transporter related  62.24 
 
 		 252 aa  310  1e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.337414 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3991  ABC transporter related  63.33 
 
 		 261 aa  311  1e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03080  hypothetical protein  62.24 
 
 		 252 aa  310  1e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  63.75 
 
 		 240 aa  310  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  63.49 
 
 		 247 aa  310  2e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  60.58 
 
 		 242 aa  310  2e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  61.73 
 
 		 244 aa  309  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  60.73 
 
 		 253 aa  309  2.9999999999999997e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  62.24 
 
 		 259 aa  309  2.9999999999999997e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4592  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.24 
 
 		 252 aa  309  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4427  ABC transporter related  65.27 
 
 		 254 aa  309  2.9999999999999997e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120026  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  62.4 
 
 		 251 aa  309  2.9999999999999997e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3757  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.24 
 
 		 252 aa  309  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0539181  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  62.2 
 
 		 258 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2020  ABC transporter related  65.98 
 
 		 246 aa  309  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  61.45 
 
 		 252 aa  309  4e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  63.6 
 
 		 263 aa  308  4e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0519  ABC transporter related  64.05 
 
 		 247 aa  308  4e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  61.04 
 
 		 259 aa  308  5e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  61.98 
 
 		 242 aa  308  5e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  60.49 
 
 		 244 aa  308  8e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3710  ABC transporter related  59.52 
 
 		 252 aa  308  8e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.110417 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  60.98 
 
 		 249 aa  308  9e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  62.5 
 
 		 242 aa  308  9e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>