More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1343 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1343  ABC transporter related  100 
 
 		 246 aa  502  1e-141  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  73.98 
 
 		 246 aa  377  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  71.6 
 
 		 247 aa  368  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  70.73 
 
 		 246 aa  365  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  69.42 
 
 		 248 aa  354  5.999999999999999e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  69.29 
 
 		 255 aa  346  2e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  63.37 
 
 		 246 aa  331  6e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  62.81 
 
 		 246 aa  328  6e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1526  ABC transporter, ATPase subunit  63.01 
 
 		 247 aa  327  8e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  67.08 
 
 		 242 aa  327  9e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2552  ABC transporter related  62.4 
 
 		 245 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221216  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3332  ABC transporter related  61.63 
 
 		 261 aa  324  7e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  63.64 
 
 		 246 aa  324  8.000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65 
 
 		 240 aa  323  2e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  63.11 
 
 		 249 aa  323  2e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  66.12 
 
 		 284 aa  322  3e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6378  ABC transporter related  64.02 
 
 		 273 aa  321  8e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.7 
 
 		 253 aa  321  9.000000000000001e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  61.98 
 
 		 259 aa  320  9.999999999999999e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2492  ABC transporter related  64.2 
 
 		 243 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  64.46 
 
 		 253 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  63.67 
 
 		 248 aa  318  3e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  63.75 
 
 		 244 aa  318  3.9999999999999996e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  64.17 
 
 		 240 aa  318  5e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  61.79 
 
 		 247 aa  317  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  65.42 
 
 		 242 aa  316  2e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2068  ABC transporter related  62.6 
 
 		 247 aa  315  3e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  62.86 
 
 		 248 aa  315  4e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  59.5 
 
 		 265 aa  314  6e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  61.92 
 
 		 273 aa  314  7e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  61.89 
 
 		 258 aa  314  8e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0693  ABC transporter-related protein  61.92 
 
 		 249 aa  314  8e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.413615  normal  0.685528 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  63.9 
 
 		 243 aa  314  8e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  64.58 
 
 		 244 aa  313  9.999999999999999e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  62.5 
 
 		 241 aa  312  2.9999999999999996e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  62.5 
 
 		 242 aa  312  2.9999999999999996e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  62.14 
 
 		 245 aa  312  3.9999999999999997e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  61.67 
 
 		 242 aa  312  3.9999999999999997e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2913  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  60.42 
 
 		 245 aa  311  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3991  ABC transporter related  61.38 
 
 		 261 aa  311  5.999999999999999e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  61.25 
 
 		 249 aa  311  5.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  63.9 
 
 		 243 aa  311  5.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0985  ABC transporter related  59.92 
 
 		 247 aa  311  6.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.178128 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1820  ABC transporter related  63.11 
 
 		 248 aa  311  7.999999999999999e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  58.61 
 
 		 251 aa  310  1e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  63.33 
 
 		 243 aa  310  1e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  60.82 
 
 		 262 aa  310  1e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.13 
 
 		 269 aa  310  1e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  57.96 
 
 		 252 aa  309  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3674  ABC transporter related  61.32 
 
 		 265 aa  310  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  62.24 
 
 		 244 aa  309  2e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  60.16 
 
 		 267 aa  310  2e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  59.92 
 
 		 253 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  60.83 
 
 		 249 aa  309  2.9999999999999997e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0796  ABC transporter related  61.32 
 
 		 257 aa  308  4e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  61.67 
 
 		 245 aa  308  4e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_004310  BR1959  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.11 
 
 		 251 aa  308  5.9999999999999995e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0443525  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  59.02 
 
 		 262 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  59.02 
 
 		 262 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  59.43 
 
 		 262 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  66.67 
 
 		 243 aa  307  8e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3860  ABC transporter related  58.78 
 
 		 253 aa  307  9e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  60.58 
 
 		 244 aa  307  9e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.13 
 
 		 249 aa  307  1.0000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  59.02 
 
 		 253 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  63.9 
 
 		 243 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  61.16 
 
 		 259 aa  307  1.0000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7857  ABC transporter related  59.18 
 
 		 261 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  59.35 
 
 		 257 aa  306  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0519  ABC transporter related  61.13 
 
 		 247 aa  306  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  59.84 
 
 		 258 aa  307  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  60.57 
 
 		 248 aa  307  1.0000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  61.48 
 
 		 249 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  59.41 
 
 		 269 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4182  ABC transporter related protein  60.16 
 
 		 261 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  58.94 
 
 		 257 aa  306  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3710  ABC transporter related  58.13 
 
 		 252 aa  306  3e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.110417 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  61.11 
 
 		 258 aa  305  4.0000000000000004e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0536  ABC transporter related  60.73 
 
 		 247 aa  305  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  59.84 
 
 		 263 aa  305  4.0000000000000004e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1885  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.68 
 
 		 251 aa  305  5.0000000000000004e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00643068  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  60 
 
 		 239 aa  305  6e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  63.79 
 
 		 243 aa  304  9.000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  61 
 
 		 247 aa  303  1.0000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  59.84 
 
 		 263 aa  304  1.0000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  59.17 
 
 		 253 aa  303  1.0000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  61.67 
 
 		 242 aa  303  2.0000000000000002e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6373  ABC transporter related  60.42 
 
 		 254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535484  normal  0.530942 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  59.83 
 
 		 256 aa  303  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4427  ABC transporter related  60.82 
 
 		 254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120026  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  59 
 
 		 258 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  59 
 
 		 258 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  59.83 
 
 		 247 aa  303  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5511  ABC transporter related  58.2 
 
 		 247 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233836  decreased coverage  0.000387504 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1395  ABC transporter related  59.35 
 
 		 251 aa  302  3.0000000000000004e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0976  ABC transporter-like  59.5 
 
 		 254 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  60.08 
 
 		 250 aa  302  3.0000000000000004e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  61.25 
 
 		 242 aa  302  3.0000000000000004e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  59.58 
 
 		 242 aa  302  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  59.18 
 
 		 249 aa  302  4.0000000000000003e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>