More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1791 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  100 
 
 		 256 aa  520  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  79.2 
 
 		 251 aa  412  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  80.99 
 
 		 242 aa  405  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  72.2 
 
 		 259 aa  395  1e-109  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  75.92 
 
 		 254 aa  391  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3987  ABC transporter related  75.2 
 
 		 255 aa  391  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  76.52 
 
 		 251 aa  392  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  75.92 
 
 		 254 aa  391  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  73.44 
 
 		 261 aa  386  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  71.88 
 
 		 270 aa  386  1e-106  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  71.15 
 
 		 262 aa  385  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  76.03 
 
 		 242 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  72.87 
 
 		 248 aa  382  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  73.36 
 
 		 257 aa  383  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  74.79 
 
 		 251 aa  382  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1247  ABC transporter related protein  74.29 
 
 		 249 aa  379  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0795163  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1395  ABC transporter related  72.47 
 
 		 251 aa  379  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  74.07 
 
 		 244 aa  377  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  72.51 
 
 		 257 aa  377  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1551  ABC transporter related protein  71.31 
 
 		 264 aa  374  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.019793 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  73.14 
 
 		 258 aa  374  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  71.43 
 
 		 247 aa  373  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2428  ABC transporter-related protein  73.05 
 
 		 264 aa  371  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419191  normal  0.0707207 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0020  amino acid ABC transporter ATPase  72.43 
 
 		 256 aa  369  1e-101  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.732673  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22740  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  67.43 
 
 		 264 aa  364  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547683  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  69.8 
 
 		 247 aa  365  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2223  amino acid permease ATP-binding protein  68.57 
 
 		 251 aa  364  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  68.27 
 
 		 252 aa  365  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15420  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  70.9 
 
 		 274 aa  364  1e-100  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0145582  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3286  ABC transporter related protein  72.43 
 
 		 280 aa  358  3e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00174942  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  69.83 
 
 		 242 aa  349  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  67.21 
 
 		 250 aa  349  3e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  64.61 
 
 		 244 aa  332  5e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3519  ABC transporter related  62.96 
 
 		 244 aa  326  3e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  61.16 
 
 		 242 aa  321  6e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  63.31 
 
 		 252 aa  316  2e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  60 
 
 		 246 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4441  ABC transporter related  60.55 
 
 		 255 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103673 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4546  ABC transporter related  61.26 
 
 		 260 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.0112462 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  59.11 
 
 		 252 aa  312  2.9999999999999996e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  60.33 
 
 		 242 aa  311  5.999999999999999e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  60.83 
 
 		 249 aa  311  5.999999999999999e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  58.54 
 
 		 255 aa  311  6.999999999999999e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4480  ABC transporter related  61.26 
 
 		 266 aa  311  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  58.54 
 
 		 259 aa  310  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1100  ABC transporter related  61.67 
 
 		 241 aa  310  2e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4332  ABC transporter related  58.91 
 
 		 258 aa  310  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.282174 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  61.16 
 
 		 241 aa  310  2e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3964  ABC transporter related  58.91 
 
 		 258 aa  310  2e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  60.42 
 
 		 242 aa  309  2.9999999999999997e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1832  ABC transporter related  62.4 
 
 		 242 aa  308  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0351546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  58.2 
 
 		 253 aa  309  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  57.85 
 
 		 249 aa  308  5.9999999999999995e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2258  ABC transporter related  62.1 
 
 		 286 aa  308  6.999999999999999e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21556  normal  0.633697 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1563  ABC transporter related  60.33 
 
 		 242 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0142744  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  60.33 
 
 		 242 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  60.49 
 
 		 243 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2987  ABC transporter related  61.57 
 
 		 257 aa  306  1.0000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715624  normal  0.638101 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  58.09 
 
 		 263 aa  306  2.0000000000000002e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  58.51 
 
 		 263 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1622  ABC transporter related  58.63 
 
 		 252 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320946  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6962  ABC transporter related  62.92 
 
 		 241 aa  305  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3961  ABC transporter related  61.57 
 
 		 248 aa  305  4.0000000000000004e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.533772 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  57.68 
 
 		 258 aa  305  4.0000000000000004e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30090  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60.96 
 
 		 252 aa  304  8.000000000000001e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2825  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  58.68 
 
 		 248 aa  304  8.000000000000001e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3911  ABC transporter  60.25 
 
 		 244 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.357859  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  57.02 
 
 		 249 aa  303  1.0000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  59.26 
 
 		 243 aa  303  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  59.92 
 
 		 244 aa  304  1.0000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5082  ABC transporter related  60.5 
 
 		 244 aa  303  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.27733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2821  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  58.68 
 
 		 248 aa  303  1.0000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.668457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2570  ABC transporter related  61.67 
 
 		 241 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0998599  normal  0.044732 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4174  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.66 
 
 		 244 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481199  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  58.85 
 
 		 253 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  58.92 
 
 		 246 aa  303  3.0000000000000004e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2581  ABC transporter related  58.06 
 
 		 255 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.507078  normal  0.289132 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1839  glutamate/aspartate ABC transporter ATP-binding protein  62.92 
 
 		 241 aa  302  3.0000000000000004e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2923  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  62.92 
 
 		 241 aa  302  3.0000000000000004e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.524102  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3013  ABC transporter related  62.92 
 
 		 241 aa  302  3.0000000000000004e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  57.44 
 
 		 249 aa  302  4.0000000000000003e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  61.25 
 
 		 244 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4021  ABC transporter-related protein  60.66 
 
 		 244 aa  302  4.0000000000000003e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000248641 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  60.49 
 
 		 253 aa  302  4.0000000000000003e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  57.96 
 
 		 248 aa  302  4.0000000000000003e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2319  ABC transporter related  57.14 
 
 		 260 aa  301  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  59.75 
 
 		 246 aa  301  5.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2175  ABC transporter related  57.14 
 
 		 260 aa  301  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.240046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  57.32 
 
 		 267 aa  301  6.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3597  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.14 
 
 		 260 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  59.34 
 
 		 248 aa  301  7.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  58.85 
 
 		 243 aa  301  7.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2327  ABC transporter related  57.38 
 
 		 252 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5947  ABC transporter related  58.17 
 
 		 254 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0218631 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.02 
 
 		 251 aa  301  8.000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  57.54 
 
 		 258 aa  301  9e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  57.54 
 
 		 258 aa  301  9e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2685  ABC transporter-related protein  60.25 
 
 		 244 aa  300  1e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.480561 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  58.33 
 
 		 253 aa  300  1e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0719  glutamate/aspartate ABC transporter ATP-binding protein  63.75 
 
 		 241 aa  300  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>