More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2443 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  100 
 
 		 261 aa  529  1e-149  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  78.29 
 
 		 259 aa  412  1e-114  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1551  ABC transporter related protein  75.86 
 
 		 264 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.019793 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  74.62 
 
 		 251 aa  402  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  80.17 
 
 		 257 aa  402  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0020  amino acid ABC transporter ATPase  79.01 
 
 		 256 aa  399  9.999999999999999e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.732673  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  78.49 
 
 		 251 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  75.3 
 
 		 270 aa  398  9.999999999999999e-111  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  77.69 
 
 		 258 aa  398  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  76.49 
 
 		 254 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  76.49 
 
 		 254 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2223  amino acid permease ATP-binding protein  74.6 
 
 		 251 aa  391  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  76.73 
 
 		 247 aa  392  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1247  ABC transporter related protein  78.93 
 
 		 249 aa  392  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0795163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  77.69 
 
 		 242 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3987  ABC transporter related  71.65 
 
 		 255 aa  389  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  72.59 
 
 		 251 aa  390  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  76.95 
 
 		 244 aa  389  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  73.44 
 
 		 256 aa  386  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  74.69 
 
 		 247 aa  385  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  77.78 
 
 		 262 aa  387  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  74.38 
 
 		 242 aa  381  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  72.36 
 
 		 252 aa  377  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  75.3 
 
 		 257 aa  380  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  73.47 
 
 		 248 aa  379  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2428  ABC transporter-related protein  77.02 
 
 		 264 aa  377  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419191  normal  0.0707207 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1395  ABC transporter related  73.66 
 
 		 251 aa  377  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3286  ABC transporter related protein  76.54 
 
 		 280 aa  374  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00174942  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22740  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  69.32 
 
 		 264 aa  368  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547683  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15420  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  69.88 
 
 		 274 aa  364  1e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0145582  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  70.56 
 
 		 250 aa  363  2e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  71.9 
 
 		 242 aa  362  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  68.72 
 
 		 244 aa  352  2e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3519  ABC transporter related  66.67 
 
 		 244 aa  340  2e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  57.87 
 
 		 255 aa  314  8e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  63.64 
 
 		 241 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  58.78 
 
 		 259 aa  313  1.9999999999999998e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  59.76 
 
 		 252 aa  312  3.9999999999999997e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  58.63 
 
 		 249 aa  312  3.9999999999999997e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  60.56 
 
 		 258 aa  311  4.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  60.41 
 
 		 246 aa  311  4.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  59.84 
 
 		 253 aa  311  7.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  58.68 
 
 		 249 aa  310  1e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  57.92 
 
 		 258 aa  311  1e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  59.43 
 
 		 246 aa  310  1e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3597  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.36 
 
 		 260 aa  309  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  58.53 
 
 		 258 aa  310  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  59.18 
 
 		 247 aa  310  2e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2319  ABC transporter related  57.36 
 
 		 260 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  58.53 
 
 		 258 aa  310  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2175  ABC transporter related  60 
 
 		 260 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.240046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  58.68 
 
 		 249 aa  309  2.9999999999999997e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30090  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  63.05 
 
 		 252 aa  309  2.9999999999999997e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  57.48 
 
 		 255 aa  309  2.9999999999999997e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  59.02 
 
 		 246 aa  308  4e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  59.09 
 
 		 242 aa  309  4e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  60.17 
 
 		 251 aa  308  5e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  57.37 
 
 		 253 aa  308  5e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1075  ABC transporter related  59.34 
 
 		 250 aa  308  6.999999999999999e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60 
 
 		 253 aa  308  8e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.09 
 
 		 269 aa  308  8e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0796  ABC transporter related  57.92 
 
 		 257 aa  306  1.0000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  55.77 
 
 		 265 aa  307  1.0000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1300  general amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.33 
 
 		 254 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4549  ABC transporter related  58.33 
 
 		 254 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  59.09 
 
 		 242 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4425  ABC transporter related  58.33 
 
 		 254 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.329357 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60 
 
 		 284 aa  306  3e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  59.75 
 
 		 263 aa  306  3e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  59.75 
 
 		 263 aa  306  3e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  60.49 
 
 		 259 aa  305  4.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  59.59 
 
 		 247 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.09 
 
 		 249 aa  305  4.0000000000000004e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  61.63 
 
 		 252 aa  305  4.0000000000000004e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0907  ABC transporter related  57.94 
 
 		 254 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  59.92 
 
 		 267 aa  305  6e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  60.42 
 
 		 242 aa  305  6e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5082  ABC transporter related  60.5 
 
 		 244 aa  304  7e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.27733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  59.06 
 
 		 273 aa  304  9.000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  58.92 
 
 		 262 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  57.14 
 
 		 253 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2812  ABC transporter related  55.81 
 
 		 260 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.844738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  58.92 
 
 		 262 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0976  ABC transporter-like  59.58 
 
 		 254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  59.58 
 
 		 242 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0055  general L-amino acid transport ATP-binding protein  57.69 
 
 		 268 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  59.09 
 
 		 242 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  60.67 
 
 		 269 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.02 
 
 		 251 aa  303  2.0000000000000002e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  59.51 
 
 		 248 aa  303  2.0000000000000002e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  58.92 
 
 		 262 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  60.42 
 
 		 242 aa  302  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7087  ABC transporter related  57.2 
 
 		 254 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  57.92 
 
 		 253 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  61.25 
 
 		 244 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  60.33 
 
 		 244 aa  301  5.000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  57.85 
 
 		 249 aa  301  5.000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  58.37 
 
 		 257 aa  301  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  59.59 
 
 		 253 aa  301  6.000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  57.85 
 
 		 246 aa  301  8.000000000000001e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>