More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3912 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  100 
 
 		 262 aa  532  1e-150  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1551  ABC transporter related protein  79.59 
 
 		 264 aa  398  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.019793 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  75 
 
 		 258 aa  398  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  76.49 
 
 		 251 aa  397  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  76.92 
 
 		 248 aa  394  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  75.68 
 
 		 257 aa  393  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  76.83 
 
 		 247 aa  392  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  78.14 
 
 		 257 aa  392  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2223  amino acid permease ATP-binding protein  76.1 
 
 		 251 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1395  ABC transporter related  76.11 
 
 		 251 aa  392  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  76.33 
 
 		 259 aa  393  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  75.31 
 
 		 252 aa  388  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3286  ABC transporter related protein  80.25 
 
 		 280 aa  387  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00174942  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  71.31 
 
 		 251 aa  388  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  74.5 
 
 		 251 aa  385  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  77.78 
 
 		 261 aa  387  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  71.15 
 
 		 256 aa  385  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3987  ABC transporter related  74.4 
 
 		 255 aa  382  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  76.54 
 
 		 244 aa  382  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  73.55 
 
 		 242 aa  380  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  73.98 
 
 		 247 aa  379  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  71.31 
 
 		 270 aa  380  1e-104  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  76.1 
 
 		 250 aa  379  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  74.07 
 
 		 254 aa  374  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  74.07 
 
 		 254 aa  374  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0020  amino acid ABC transporter ATPase  73.66 
 
 		 256 aa  372  1e-102  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.732673  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  73.97 
 
 		 242 aa  371  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1247  ABC transporter related protein  75.62 
 
 		 249 aa  370  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0795163  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  73.14 
 
 		 242 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2428  ABC transporter-related protein  75.31 
 
 		 264 aa  363  1e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419191  normal  0.0707207 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22740  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  72.29 
 
 		 264 aa  362  2e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547683  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15420  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  70.68 
 
 		 274 aa  358  5e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0145582  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  70.37 
 
 		 244 aa  352  2e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3519  ABC transporter related  68.31 
 
 		 244 aa  344  7e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30090  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  67.47 
 
 		 252 aa  327  9e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  61.57 
 
 		 242 aa  326  3e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  60.23 
 
 		 259 aa  325  4.0000000000000003e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  65.38 
 
 		 246 aa  325  5e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  61.04 
 
 		 253 aa  325  7e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  63.37 
 
 		 243 aa  323  1e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  64.92 
 
 		 252 aa  323  1e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  58.17 
 
 		 263 aa  323  2e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  61.16 
 
 		 249 aa  323  2e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  58.17 
 
 		 263 aa  322  3e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  62.96 
 
 		 243 aa  322  5e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  62.2 
 
 		 247 aa  321  6e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  65 
 
 		 244 aa  321  7e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  59.45 
 
 		 267 aa  321  8e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1832  ABC transporter related  63.22 
 
 		 242 aa  321  8e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0351546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  62.3 
 
 		 258 aa  321  9.999999999999999e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  61.73 
 
 		 252 aa  320  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  62.81 
 
 		 241 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  61.83 
 
 		 246 aa  319  3e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  60.33 
 
 		 242 aa  318  5e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  62.08 
 
 		 242 aa  318  5e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  61.92 
 
 		 258 aa  318  7e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2570  ABC transporter related  63.75 
 
 		 241 aa  318  7e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0998599  normal  0.044732 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.4 
 
 		 269 aa  318  7e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  61.41 
 
 		 246 aa  317  1e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  58.1 
 
 		 255 aa  317  1e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1179  ABC transporter related  65.42 
 
 		 241 aa  317  1e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0654977 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  61.48 
 
 		 259 aa  317  2e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2758  ABC transporter related  60.82 
 
 		 252 aa  317  2e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6962  ABC transporter related  64.17 
 
 		 241 aa  317  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  60.33 
 
 		 249 aa  317  2e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  60.74 
 
 		 249 aa  317  2e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  61.16 
 
 		 253 aa  315  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3964  ABC transporter related  62.04 
 
 		 258 aa  315  4e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  61.63 
 
 		 269 aa  315  4e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4441  ABC transporter related  62.04 
 
 		 255 aa  315  5e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103673 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4332  ABC transporter related  62.04 
 
 		 258 aa  315  5e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.282174 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.4 
 
 		 284 aa  314  7e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0834  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  62.96 
 
 		 249 aa  314  8e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.55 
 
 		 253 aa  314  9e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  56.49 
 
 		 262 aa  314  9e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  60.83 
 
 		 242 aa  314  9e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1100  ABC transporter related  62.5 
 
 		 241 aa  314  9e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  56.49 
 
 		 262 aa  314  9e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.98 
 
 		 249 aa  314  9.999999999999999e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3961  ABC transporter related  61.98 
 
 		 248 aa  314  9.999999999999999e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.533772 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7857  ABC transporter related  59.53 
 
 		 261 aa  313  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  61.98 
 
 		 267 aa  313  9.999999999999999e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5082  ABC transporter related  61.41 
 
 		 244 aa  313  9.999999999999999e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.27733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  60.42 
 
 		 242 aa  313  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0593  ABC transporter related  62.08 
 
 		 241 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.180749  normal  0.457666 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0976  ABC transporter-like  61.16 
 
 		 254 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0567  ABC transporter related  62.08 
 
 		 241 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.97 
 
 		 251 aa  313  1.9999999999999998e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0796  ABC transporter related  58.75 
 
 		 257 aa  313  1.9999999999999998e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  60.33 
 
 		 242 aa  312  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  58.46 
 
 		 257 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0055  general L-amino acid transport ATP-binding protein  61.51 
 
 		 268 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  56.49 
 
 		 262 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  60.08 
 
 		 247 aa  312  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  62.14 
 
 		 243 aa  312  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1075  ABC transporter  60.49 
 
 		 254 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.520778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  60.41 
 
 		 251 aa  312  3.9999999999999997e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1075  ABC transporter related  60.74 
 
 		 250 aa  312  3.9999999999999997e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  58.78 
 
 		 246 aa  312  3.9999999999999997e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2327  ABC transporter related  58.33 
 
 		 252 aa  311  4.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>