More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2758 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2758  ABC transporter related  100 
 
 
252 aa  516  1.0000000000000001e-145  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.49 
 
 
253 aa  323  2e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.1 
 
 
284 aa  321  6e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  62.3 
 
 
253 aa  317  1e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  60.82 
 
 
262 aa  317  2e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  63.41 
 
 
249 aa  315  4e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.83 
 
 
269 aa  314  7e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  61.07 
 
 
258 aa  314  7e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  63.07 
 
 
244 aa  314  8e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  60.83 
 
 
269 aa  312  2.9999999999999996e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  59.13 
 
 
258 aa  311  3.9999999999999997e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  59.13 
 
 
258 aa  311  3.9999999999999997e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  59.2 
 
 
255 aa  311  6.999999999999999e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  64.2 
 
 
243 aa  311  6.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.42 
 
 
249 aa  311  9e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  60.17 
 
 
242 aa  311  9e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  62.08 
 
 
242 aa  310  1e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  60 
 
 
253 aa  310  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0055  general L-amino acid transport ATP-binding protein  61.7 
 
 
268 aa  310  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  59.44 
 
 
263 aa  310  1e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  61.22 
 
 
246 aa  310  1e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  60.83 
 
 
257 aa  310  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  60.73 
 
 
247 aa  310  1e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6378  ABC transporter related  62.08 
 
 
273 aa  310  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  61.67 
 
 
240 aa  309  2e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  61.67 
 
 
267 aa  310  2e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  60.83 
 
 
257 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  59.52 
 
 
273 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2492  ABC transporter related  62.96 
 
 
243 aa  309  4e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  60 
 
 
258 aa  308  4e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  61.75 
 
 
248 aa  307  9e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.75 
 
 
240 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  61.41 
 
 
267 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3674  ABC transporter related  61.67 
 
 
265 aa  306  3e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  57.79 
 
 
259 aa  305  4.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  61.35 
 
 
248 aa  305  4.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  60.42 
 
 
242 aa  305  5.0000000000000004e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  59.43 
 
 
246 aa  305  6e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  58.17 
 
 
253 aa  305  7e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  59.02 
 
 
262 aa  304  7e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  61.67 
 
 
246 aa  304  8.000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  58.92 
 
 
242 aa  304  8.000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  59.02 
 
 
262 aa  304  9.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  59.02 
 
 
262 aa  304  9.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  57.83 
 
 
263 aa  304  1.0000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  59.43 
 
 
246 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  61.79 
 
 
257 aa  304  1.0000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0796  ABC transporter related  59.35 
 
 
257 aa  304  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7857  ABC transporter related  59.51 
 
 
261 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  60 
 
 
240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  60 
 
 
242 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2020  ABC transporter related  63.11 
 
 
246 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1551  ABC transporter related protein  60.49 
 
 
264 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.019793 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2622  ABC transporter related  61.41 
 
 
241 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  60.17 
 
 
270 aa  302  3.0000000000000004e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  59.35 
 
 
248 aa  302  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5947  ABC transporter related  58.94 
 
 
254 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0218631 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1741  ABC transporter related  61 
 
 
267 aa  301  5.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  59.17 
 
 
256 aa  301  6.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  59.43 
 
 
246 aa  301  7.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60.16 
 
 
251 aa  301  8.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  59.17 
 
 
242 aa  301  9e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  60.17 
 
 
243 aa  300  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  60.33 
 
 
254 aa  300  1e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  56.69 
 
 
256 aa  300  1e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  60.33 
 
 
254 aa  300  1e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2846  ABC transporter related  58.75 
 
 
251 aa  300  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.92934  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  60.42 
 
 
242 aa  300  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  60 
 
 
246 aa  300  2e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0020  amino acid ABC transporter ATPase  59.59 
 
 
256 aa  300  2e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.732673  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3332  ABC transporter related  58.78 
 
 
261 aa  299  2e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1526  ABC transporter, ATPase subunit  58.78 
 
 
247 aa  299  3e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  60.08 
 
 
243 aa  299  3e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  59.02 
 
 
246 aa  299  3e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  56.1 
 
 
253 aa  299  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  61.16 
 
 
244 aa  299  3e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4510  ABC transporter related  59.83 
 
 
266 aa  299  4e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00592633  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7087  ABC transporter related  57.89 
 
 
254 aa  298  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  60.17 
 
 
255 aa  298  4e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0907  ABC transporter related  58.92 
 
 
254 aa  298  4e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  58.94 
 
 
247 aa  298  5e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  56.22 
 
 
259 aa  298  5e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  58.75 
 
 
242 aa  298  5e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4870  ABC transporter related  57.96 
 
 
256 aa  298  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.933928  normal  0.605559 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1820  ABC transporter related  61.48 
 
 
248 aa  298  6e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  60.83 
 
 
240 aa  298  7e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3860  ABC transporter related  57.26 
 
 
253 aa  298  7e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2987  ABC transporter related  60.89 
 
 
257 aa  298  8e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715624  normal  0.638101 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  59.58 
 
 
242 aa  297  9e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  59.43 
 
 
247 aa  296  1e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1300  general amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.51 
 
 
254 aa  297  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4549  ABC transporter related  58.51 
 
 
254 aa  297  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0976  ABC transporter-like  58.09 
 
 
254 aa  297  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4425  ABC transporter related  58.51 
 
 
254 aa  297  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.329357 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3961  ABC transporter related  58.78 
 
 
248 aa  297  1e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.533772 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2552  ABC transporter related  57.85 
 
 
245 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221216  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  57.26 
 
 
253 aa  297  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1152  ABC transporter related  58.7 
 
 
252 aa  297  1e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  60.17 
 
 
242 aa  297  1e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0249  ATPase  59.2 
 
 
261 aa  296  2e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>