More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0786 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 270 aa  556  1e-157  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0020  amino acid ABC transporter ATPase  89.71 
 
 		 256 aa  455  1e-127  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.732673  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  77.55 
 
 		 259 aa  402  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  75.3 
 
 		 261 aa  398  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  77.14 
 
 		 251 aa  392  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  75.3 
 
 		 258 aa  394  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  76.45 
 
 		 257 aa  390  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1247  ABC transporter related protein  75.1 
 
 		 249 aa  387  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0795163  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  71.88 
 
 		 256 aa  386  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  72.65 
 
 		 247 aa  382  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1551  ABC transporter related protein  73.25 
 
 		 264 aa  382  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.019793 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2223  amino acid permease ATP-binding protein  73.98 
 
 		 251 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3987  ABC transporter related  71.95 
 
 		 255 aa  380  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  72.65 
 
 		 247 aa  377  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  71.31 
 
 		 262 aa  380  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  71.84 
 
 		 254 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  71.84 
 
 		 254 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  72.02 
 
 		 251 aa  374  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  74.39 
 
 		 257 aa  374  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  71.9 
 
 		 242 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3286  ABC transporter related protein  75.31 
 
 		 280 aa  369  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00174942  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  70.61 
 
 		 251 aa  370  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  70.2 
 
 		 248 aa  367  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  67.89 
 
 		 252 aa  366  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  70.37 
 
 		 244 aa  363  2e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1395  ABC transporter related  70.37 
 
 		 251 aa  363  2e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  70.08 
 
 		 250 aa  362  3e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  70.25 
 
 		 242 aa  362  4e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2428  ABC transporter-related protein  72.43 
 
 		 264 aa  358  7e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419191  normal  0.0707207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  69.01 
 
 		 242 aa  354  6.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15420  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  68.55 
 
 		 274 aa  352  5e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0145582  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22740  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  68.95 
 
 		 264 aa  350  1e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547683  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  66.67 
 
 		 244 aa  343  2e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3519  ABC transporter related  65.02 
 
 		 244 aa  333  1e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  63.01 
 
 		 252 aa  323  2e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  61.63 
 
 		 247 aa  319  3e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  62.4 
 
 		 242 aa  318  5e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  61.98 
 
 		 242 aa  318  5e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  64.02 
 
 		 267 aa  318  6e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  62.66 
 
 		 251 aa  318  7e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  61.57 
 
 		 249 aa  318  7e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  58.98 
 
 		 258 aa  317  1e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1075  ABC transporter related  61.16 
 
 		 250 aa  317  1e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  62.55 
 
 		 243 aa  316  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  60.74 
 
 		 242 aa  317  2e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  59.44 
 
 		 265 aa  316  2e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.6 
 
 		 269 aa  316  3e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  63.27 
 
 		 247 aa  315  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  61.57 
 
 		 253 aa  315  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  61.16 
 
 		 249 aa  315  6e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  62.08 
 
 		 249 aa  315  6e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  61.57 
 
 		 249 aa  315  7e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  61.67 
 
 		 242 aa  315  7e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.6 
 
 		 249 aa  314  9e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.74 
 
 		 251 aa  314  9.999999999999999e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  62.04 
 
 		 259 aa  313  9.999999999999999e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  63.18 
 
 		 269 aa  313  9.999999999999999e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  60.24 
 
 		 253 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0907  ABC transporter related  60.4 
 
 		 254 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  61 
 
 		 262 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  61.75 
 
 		 273 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1832  ABC transporter related  61.98 
 
 		 242 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0351546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  61 
 
 		 262 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  61.41 
 
 		 262 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  59.2 
 
 		 255 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  60.83 
 
 		 242 aa  312  2.9999999999999996e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  60.58 
 
 		 246 aa  312  2.9999999999999996e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  58.69 
 
 		 259 aa  312  2.9999999999999996e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  61.6 
 
 		 257 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  61.57 
 
 		 256 aa  312  2.9999999999999996e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0796  ABC transporter related  57.98 
 
 		 257 aa  312  2.9999999999999996e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1300  general amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60 
 
 		 254 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4549  ABC transporter related  60 
 
 		 254 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4425  ABC transporter related  60 
 
 		 254 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.329357 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  59.43 
 
 		 248 aa  311  4.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  60 
 
 		 246 aa  311  9e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  61 
 
 		 263 aa  311  1e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  60.58 
 
 		 263 aa  310  1e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  60.41 
 
 		 248 aa  310  1e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  60.91 
 
 		 243 aa  311  1e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1075  ABC transporter  60.66 
 
 		 254 aa  309  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.520778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.18 
 
 		 252 aa  309  2e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0976  ABC transporter-like  59.6 
 
 		 254 aa  310  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  60.33 
 
 		 244 aa  309  2e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  61.48 
 
 		 258 aa  310  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  61.2 
 
 		 257 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  58.1 
 
 		 256 aa  310  2e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30090  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  61.63 
 
 		 252 aa  310  2e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  61.48 
 
 		 258 aa  310  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7857  ABC transporter related  61.57 
 
 		 261 aa  310  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  60.91 
 
 		 243 aa  309  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1258  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.25 
 
 		 254 aa  308  4e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13929  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  62.39 
 
 		 246 aa  309  4e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1622  ABC transporter related  58.57 
 
 		 252 aa  308  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320946  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  60.96 
 
 		 258 aa  308  4e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0055  general L-amino acid transport ATP-binding protein  63.18 
 
 		 268 aa  308  5e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  62.04 
 
 		 252 aa  308  8e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.78 
 
 		 252 aa  307  9e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  61.25 
 
 		 242 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4592  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.78 
 
 		 252 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723887  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>