More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0862 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  100 
 
 		 248 aa  509  1e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  86.29 
 
 		 247 aa  437  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  81.45 
 
 		 246 aa  417  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  77.96 
 
 		 246 aa  402  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  77.59 
 
 		 255 aa  396  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1343  ABC transporter related  69.42 
 
 		 246 aa  354  5.999999999999999e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  64.52 
 
 		 248 aa  335  3.9999999999999995e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  64.52 
 
 		 248 aa  334  5.999999999999999e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  66.25 
 
 		 240 aa  330  2e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  69.16 
 
 		 243 aa  330  2e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  65.98 
 
 		 243 aa  328  6e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  64.32 
 
 		 243 aa  328  6e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5082  ABC transporter related  65.37 
 
 		 244 aa  327  1.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.27733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  64.73 
 
 		 243 aa  327  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  61.48 
 
 		 259 aa  326  2.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  65.84 
 
 		 243 aa  325  4.0000000000000003e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  65.29 
 
 		 249 aa  325  5e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3332  ABC transporter related  62.86 
 
 		 261 aa  322  3e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2020  ABC transporter related  65.16 
 
 		 246 aa  320  9.000000000000001e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  61.92 
 
 		 247 aa  320  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2492  ABC transporter related  65.02 
 
 		 243 aa  319  1.9999999999999998e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  61.83 
 
 		 246 aa  319  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.87 
 
 		 269 aa  319  1.9999999999999998e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  59.68 
 
 		 267 aa  319  3e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1075  ABC transporter related  61.32 
 
 		 250 aa  318  3.9999999999999996e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  62.5 
 
 		 249 aa  318  5e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1820  ABC transporter related  66.39 
 
 		 248 aa  318  6e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  59.27 
 
 		 257 aa  317  7.999999999999999e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  59.68 
 
 		 257 aa  317  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2913  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  59.92 
 
 		 245 aa  317  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  62.92 
 
 		 242 aa  317  1e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.87 
 
 		 249 aa  317  2e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2552  ABC transporter related  60.74 
 
 		 245 aa  316  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221216  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.29 
 
 		 253 aa  315  4e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0693  ABC transporter-related protein  61.51 
 
 		 249 aa  315  4e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.413615  normal  0.685528 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  61.04 
 
 		 251 aa  315  6e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  61.7 
 
 		 242 aa  314  8e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  59.84 
 
 		 251 aa  314  8e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  61.25 
 
 		 244 aa  314  9e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  58.06 
 
 		 269 aa  314  9e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  61.07 
 
 		 262 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  62.5 
 
 		 246 aa  313  9.999999999999999e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  61.07 
 
 		 262 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  61.25 
 
 		 242 aa  313  9.999999999999999e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  60.42 
 
 		 253 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  61.07 
 
 		 262 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  60.66 
 
 		 258 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  59.92 
 
 		 246 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  58.94 
 
 		 259 aa  313  1.9999999999999998e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  61.25 
 
 		 242 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  64.46 
 
 		 253 aa  312  2.9999999999999996e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  64.05 
 
 		 252 aa  312  2.9999999999999996e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  61.25 
 
 		 242 aa  312  3.9999999999999997e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  59.43 
 
 		 270 aa  311  3.9999999999999997e-84  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2465  ABC transporter related  61.92 
 
 		 249 aa  312  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  59.92 
 
 		 246 aa  311  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2846  ABC transporter related  58.7 
 
 		 251 aa  311  5.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.92934  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.88 
 
 		 284 aa  311  5.999999999999999e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  60.83 
 
 		 240 aa  311  5.999999999999999e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  60.17 
 
 		 244 aa  311  5.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2072  ABC transporter related  61.92 
 
 		 249 aa  311  6.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0159024  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  62.5 
 
 		 256 aa  311  6.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  60.83 
 
 		 240 aa  311  6.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2260  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  61.51 
 
 		 249 aa  311  7.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.334703  normal  0.463936 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  58.94 
 
 		 265 aa  311  7.999999999999999e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  59.92 
 
 		 262 aa  311  9e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  60.08 
 
 		 247 aa  311  9e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3950  AABC amino acid transporter, ATPase subunit  61.21 
 
 		 250 aa  310  1e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  62.5 
 
 		 242 aa  310  1e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  60 
 
 		 249 aa  310  1e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  57.26 
 
 		 258 aa  310  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  57.26 
 
 		 258 aa  310  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  61.67 
 
 		 244 aa  310  2e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  62.81 
 
 		 245 aa  310  2e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  60.25 
 
 		 247 aa  310  2e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  60.42 
 
 		 249 aa  310  2e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1526  ABC transporter, ATPase subunit  60.42 
 
 		 247 aa  310  2e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  60 
 
 		 242 aa  309  2e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  60.83 
 
 		 242 aa  309  2.9999999999999997e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  60.83 
 
 		 267 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  59.58 
 
 		 242 aa  309  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  60.25 
 
 		 263 aa  309  2.9999999999999997e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0443  ABC transporter related  65.33 
 
 		 244 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4427  ABC transporter related  61.51 
 
 		 254 aa  308  4e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120026  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2585  ABC transporter related  58.51 
 
 		 244 aa  308  4e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1702  ABC transporter related  61.64 
 
 		 253 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.478201 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0447  amino acid transporter ATP-binding protein  59.17 
 
 		 248 aa  308  5.9999999999999995e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1832  ABC transporter related  62.5 
 
 		 242 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0351546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.33 
 
 		 252 aa  307  9e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  60.17 
 
 		 247 aa  307  1.0000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1075  ABC transporter  59.92 
 
 		 254 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.520778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  62.08 
 
 		 239 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4592  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.92 
 
 		 252 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  59.75 
 
 		 257 aa  306  2.0000000000000002e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  59.43 
 
 		 263 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3757  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.92 
 
 		 252 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0539181  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1551  ABC transporter related protein  61.57 
 
 		 264 aa  305  3e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.019793 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1258  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.5 
 
 		 254 aa  306  3e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13929  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  59.58 
 
 		 249 aa  306  3e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03080  hypothetical protein  57.92 
 
 		 252 aa  305  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>