More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_3296 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  100 
 
 		 256 aa  523  1e-147  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  73.47 
 
 		 248 aa  379  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  64.49 
 
 		 244 aa  332  5e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4950  ABC transporter related  63.18 
 
 		 259 aa  331  6e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  63.27 
 
 		 245 aa  330  1e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  63.27 
 
 		 245 aa  329  2e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  61.15 
 
 		 257 aa  325  6e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1622  ABC transporter related  62.65 
 
 		 252 aa  324  8.000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320946  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  60.89 
 
 		 259 aa  322  3e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  61.22 
 
 		 249 aa  322  3e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  62.15 
 
 		 253 aa  321  6e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6378  ABC transporter related  64.37 
 
 		 273 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  62.6 
 
 		 249 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  61.72 
 
 		 253 aa  319  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  60.98 
 
 		 246 aa  318  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  62.81 
 
 		 257 aa  318  6e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  60.41 
 
 		 249 aa  318  7e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  61.89 
 
 		 263 aa  317  7.999999999999999e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4510  ABC transporter related  60.78 
 
 		 266 aa  317  7.999999999999999e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00592633  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  63.31 
 
 		 273 aa  317  9e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  61.98 
 
 		 257 aa  317  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60 
 
 		 251 aa  316  2e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.57 
 
 		 269 aa  317  2e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  60.82 
 
 		 246 aa  315  3e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  61.63 
 
 		 246 aa  315  3e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  60.24 
 
 		 256 aa  315  4e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1526  ABC transporter, ATPase subunit  59.61 
 
 		 247 aa  315  5e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  59.46 
 
 		 258 aa  315  6e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  59.59 
 
 		 249 aa  314  8e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  61.29 
 
 		 246 aa  313  9.999999999999999e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  60.33 
 
 		 258 aa  314  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  58.54 
 
 		 252 aa  313  9.999999999999999e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  61.16 
 
 		 269 aa  313  9.999999999999999e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  60.33 
 
 		 258 aa  314  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  59.44 
 
 		 247 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.16 
 
 		 249 aa  313  1.9999999999999998e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0519  ABC transporter related  61.96 
 
 		 247 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2552  ABC transporter related  59.51 
 
 		 245 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221216  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  59.76 
 
 		 265 aa  313  1.9999999999999998e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  61.73 
 
 		 251 aa  312  2.9999999999999996e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  60.66 
 
 		 263 aa  312  2.9999999999999996e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  60 
 
 		 246 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0536  ABC transporter related  61.96 
 
 		 247 aa  312  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0976  ABC transporter-like  59.77 
 
 		 254 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  59.52 
 
 		 259 aa  312  3.9999999999999997e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7857  ABC transporter related  59.52 
 
 		 261 aa  311  6.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1300  general amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.16 
 
 		 254 aa  310  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0055  general L-amino acid transport ATP-binding protein  60.73 
 
 		 268 aa  310  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1075  ABC transporter  60.16 
 
 		 254 aa  310  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.520778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4549  ABC transporter related  60.16 
 
 		 254 aa  310  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4425  ABC transporter related  60.16 
 
 		 254 aa  310  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.329357 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1258  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.76 
 
 		 254 aa  309  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13929  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  59.13 
 
 		 253 aa  310  2e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  61.38 
 
 		 243 aa  310  2e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  58.1 
 
 		 270 aa  310  2e-83  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  61.22 
 
 		 267 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0907  ABC transporter related  59.77 
 
 		 254 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2981  ABC transporter related  61.69 
 
 		 245 aa  309  2.9999999999999997e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  60.74 
 
 		 267 aa  308  4e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1152  ABC transporter related  60.24 
 
 		 252 aa  308  5e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  58.57 
 
 		 262 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  58.57 
 
 		 262 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2581  ABC transporter related  59.02 
 
 		 255 aa  308  8e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.507078  normal  0.289132 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  60.08 
 
 		 242 aa  307  8e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  59.44 
 
 		 247 aa  307  9e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03129  predicted amino-acid transporter subunit  58.27 
 
 		 252 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0435  ABC transporter related protein  58.27 
 
 		 252 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4592  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.27 
 
 		 252 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03080  hypothetical protein  58.27 
 
 		 252 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  59.52 
 
 		 258 aa  307  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  58.96 
 
 		 262 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0435  ABC transporter related  58.27 
 
 		 252 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.337414 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3466  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.27 
 
 		 252 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0172997  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3757  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.27 
 
 		 252 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0539181  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3860  ABC transporter related  58.73 
 
 		 253 aa  306  1.0000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  58.85 
 
 		 242 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2068  ABC transporter related  60.73 
 
 		 247 aa  306  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.27 
 
 		 252 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0796  ABC transporter related  59.84 
 
 		 257 aa  306  2.0000000000000002e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  59.68 
 
 		 259 aa  306  2.0000000000000002e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  59.92 
 
 		 253 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  57.31 
 
 		 253 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  60.98 
 
 		 243 aa  306  3e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.87 
 
 		 252 aa  305  3e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  60.57 
 
 		 243 aa  306  3e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  57.55 
 
 		 242 aa  305  3e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3332  ABC transporter related  59.51 
 
 		 261 aa  306  3e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  59.67 
 
 		 243 aa  305  4.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3674  ABC transporter related  60.49 
 
 		 265 aa  305  6e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  60.67 
 
 		 240 aa  304  8.000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0230  ABC transporter related protein  59.11 
 
 		 253 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  58.4 
 
 		 254 aa  303  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  58.4 
 
 		 254 aa  303  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  59.04 
 
 		 247 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  59.26 
 
 		 240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.46 
 
 		 257 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  62.9 
 
 		 252 aa  303  3.0000000000000004e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1832  ABC transporter related  57.55 
 
 		 242 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0351546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  59.67 
 
 		 242 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1959  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.92 
 
 		 251 aa  302  4.0000000000000003e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0443525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>