More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0729 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  100 
 
 		 240 aa  488  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  72.5 
 
 		 242 aa  365  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  72.92 
 
 		 239 aa  363  2e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  74.17 
 
 		 240 aa  359  3e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  71.67 
 
 		 240 aa  356  1.9999999999999998e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  69.17 
 
 		 240 aa  350  1e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  69.58 
 
 		 240 aa  350  1e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  70.42 
 
 		 240 aa  347  1e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  70 
 
 		 244 aa  344  6e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  67.5 
 
 		 240 aa  340  1e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  67.92 
 
 		 243 aa  337  8e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  65.42 
 
 		 241 aa  333  1e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  69.17 
 
 		 240 aa  333  1e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  66.25 
 
 		 243 aa  329  3e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  67.5 
 
 		 240 aa  327  8e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  65.42 
 
 		 240 aa  326  2.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  66.53 
 
 		 244 aa  325  4.0000000000000003e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  64.58 
 
 		 240 aa  323  1e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  65.42 
 
 		 243 aa  321  5e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  65.42 
 
 		 244 aa  322  5e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  64.17 
 
 		 242 aa  321  7e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  62.5 
 
 		 242 aa  320  9.999999999999999e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  63.75 
 
 		 242 aa  319  1.9999999999999998e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  62.92 
 
 		 242 aa  319  3e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  63.33 
 
 		 240 aa  318  5e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  64.41 
 
 		 246 aa  318  5e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  65 
 
 		 243 aa  318  6e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  62.92 
 
 		 241 aa  318  7e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  62.92 
 
 		 241 aa  318  7e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  64.4 
 
 		 263 aa  317  7.999999999999999e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  64.17 
 
 		 241 aa  317  7.999999999999999e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  62 
 
 		 273 aa  317  9e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.92 
 
 		 241 aa  317  9e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  65.43 
 
 		 243 aa  317  1e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  65 
 
 		 243 aa  317  1e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  63.75 
 
 		 241 aa  317  1e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  63.33 
 
 		 244 aa  317  1e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  60.25 
 
 		 244 aa  317  1e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.83 
 
 		 240 aa  316  2e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  62.5 
 
 		 241 aa  316  2e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  61.67 
 
 		 242 aa  315  4e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  63.75 
 
 		 240 aa  315  4e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  62.08 
 
 		 241 aa  315  5e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  62.08 
 
 		 241 aa  314  7e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  62.08 
 
 		 241 aa  314  7e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.92 
 
 		 244 aa  313  9.999999999999999e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  63.14 
 
 		 244 aa  314  9.999999999999999e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  62.08 
 
 		 241 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  64.17 
 
 		 241 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  62.08 
 
 		 241 aa  312  2.9999999999999996e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  62.08 
 
 		 247 aa  311  5.999999999999999e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  63.33 
 
 		 240 aa  310  1e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.75 
 
 		 284 aa  310  1e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.33 
 
 		 253 aa  309  2e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  63.33 
 
 		 240 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  63.33 
 
 		 240 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  63.6 
 
 		 249 aa  309  2.9999999999999997e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4901  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.33 
 
 		 240 aa  308  4e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.33 
 
 		 240 aa  308  4e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  63.33 
 
 		 240 aa  308  4e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  63.33 
 
 		 240 aa  308  4e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.33 
 
 		 240 aa  308  4e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  60.42 
 
 		 242 aa  308  4e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  64.41 
 
 		 247 aa  308  4e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  60.4 
 
 		 260 aa  308  4e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.33 
 
 		 240 aa  308  4e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  61.92 
 
 		 246 aa  308  4e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.33 
 
 		 240 aa  308  5e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  63.33 
 
 		 253 aa  308  5e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  64.2 
 
 		 243 aa  308  5.9999999999999995e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  63.14 
 
 		 257 aa  307  9e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  61.25 
 
 		 240 aa  307  9e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.5 
 
 		 240 aa  306  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  62.5 
 
 		 240 aa  306  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.5 
 
 		 240 aa  306  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.08 
 
 		 240 aa  306  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  62.5 
 
 		 240 aa  306  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  60.83 
 
 		 243 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  61.67 
 
 		 249 aa  307  1.0000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.5 
 
 		 240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.5 
 
 		 240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.08 
 
 		 240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  63.9 
 
 		 241 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.5 
 
 		 240 aa  306  3e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  61.35 
 
 		 263 aa  306  3e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  63.56 
 
 		 251 aa  306  3e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  60 
 
 		 260 aa  305  3e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  62.5 
 
 		 252 aa  305  4.0000000000000004e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  63.18 
 
 		 248 aa  305  4.0000000000000004e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  61.25 
 
 		 242 aa  305  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  62.76 
 
 		 249 aa  305  5.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  61.67 
 
 		 246 aa  305  6e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  60.42 
 
 		 253 aa  305  6e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  61.44 
 
 		 253 aa  304  7e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  60.67 
 
 		 256 aa  304  7e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  60.83 
 
 		 242 aa  304  7e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  61.83 
 
 		 243 aa  304  9.000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  63.98 
 
 		 246 aa  304  9.000000000000001e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  62.5 
 
 		 240 aa  304  9.000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  62.98 
 
 		 242 aa  303  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>