More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3809 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  100 
 
 
240 aa  485  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  88.75 
 
 
243 aa  433  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  87.92 
 
 
243 aa  426  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  72.08 
 
 
240 aa  358  5e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  71.67 
 
 
242 aa  351  7e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  67.92 
 
 
240 aa  344  7e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  67.5 
 
 
240 aa  342  2e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  67.5 
 
 
240 aa  340  1e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  68.75 
 
 
239 aa  337  8e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  67.92 
 
 
240 aa  335  2.9999999999999997e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  67.08 
 
 
240 aa  333  1e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  66.25 
 
 
244 aa  330  1e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  63.75 
 
 
240 aa  325  4.0000000000000003e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  61.67 
 
 
240 aa  322  3e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.25 
 
 
240 aa  322  5e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  61.67 
 
 
246 aa  319  1.9999999999999998e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  59.58 
 
 
242 aa  318  5e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  62.08 
 
 
242 aa  316  2e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  60.83 
 
 
240 aa  315  4e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60.42 
 
 
240 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.42 
 
 
240 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60.42 
 
 
240 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.42 
 
 
240 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  61.67 
 
 
244 aa  312  3.9999999999999997e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60 
 
 
240 aa  311  5.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.67 
 
 
244 aa  311  7.999999999999999e-84  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  60.42 
 
 
240 aa  311  7.999999999999999e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60 
 
 
240 aa  310  9e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  61.25 
 
 
244 aa  310  9e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.42 
 
 
240 aa  310  1e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60 
 
 
240 aa  310  1e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  61.67 
 
 
244 aa  310  1e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  61.92 
 
 
247 aa  309  2e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  62.76 
 
 
246 aa  309  2.9999999999999997e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  62.5 
 
 
244 aa  308  6.999999999999999e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  63.75 
 
 
241 aa  307  8e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.58 
 
 
240 aa  307  8e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  61.25 
 
 
242 aa  307  9e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  63.33 
 
 
241 aa  306  1.0000000000000001e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  59.58 
 
 
240 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  62.92 
 
 
241 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  62.92 
 
 
241 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  62.92 
 
 
241 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  62.92 
 
 
241 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  61 
 
 
241 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  60 
 
 
243 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  57.08 
 
 
242 aa  306  3e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.08 
 
 
241 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  63.6 
 
 
249 aa  305  5.0000000000000004e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  62.08 
 
 
241 aa  305  6e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  62.08 
 
 
241 aa  304  7e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  62.08 
 
 
241 aa  304  7e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  61.92 
 
 
249 aa  304  9.000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  62.92 
 
 
241 aa  304  9.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3165  ABC transporter related  63.18 
 
 
257 aa  304  9.000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.127499  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  62.08 
 
 
241 aa  304  9.000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  60 
 
 
240 aa  302  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  61.73 
 
 
243 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  60.58 
 
 
243 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  61.67 
 
 
241 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  59.58 
 
 
242 aa  302  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1820  ABC transporter related  60.91 
 
 
248 aa  301  4.0000000000000003e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  61.2 
 
 
273 aa  302  4.0000000000000003e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  59 
 
 
247 aa  300  1e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  60.42 
 
 
240 aa  300  1e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  60.67 
 
 
246 aa  300  1e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4704  ABC transporter-related protein  63.18 
 
 
257 aa  300  1e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.874551  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  60.42 
 
 
245 aa  300  1e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  61 
 
 
243 aa  300  1e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3014  ABC transporter related  61.13 
 
 
252 aa  300  1e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.101758  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  60.42 
 
 
244 aa  300  2e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  57.08 
 
 
252 aa  299  2e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0185  ABC transporter related  62.08 
 
 
243 aa  299  2e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  61.51 
 
 
247 aa  299  3e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  61.09 
 
 
244 aa  298  3e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  60.83 
 
 
243 aa  299  3e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1832  ABC transporter related  60.83 
 
 
242 aa  298  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0351546  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  59.83 
 
 
244 aa  298  4e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  60.42 
 
 
241 aa  298  4e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2981  ABC transporter related  62.66 
 
 
245 aa  298  4e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137964  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  58.75 
 
 
242 aa  298  5e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  58.33 
 
 
240 aa  298  5e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  61.37 
 
 
246 aa  298  6e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.25 
 
 
240 aa  298  7e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  61.09 
 
 
246 aa  298  7e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  59.58 
 
 
242 aa  297  8e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  60.58 
 
 
243 aa  298  8e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  57.92 
 
 
242 aa  297  8e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  59.58 
 
 
242 aa  297  8e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  60 
 
 
244 aa  297  9e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  58.75 
 
 
246 aa  297  9e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  58.75 
 
 
240 aa  296  1e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  60.42 
 
 
255 aa  296  1e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  59.02 
 
 
256 aa  295  3e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  60.49 
 
 
243 aa  295  4e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6988  ABC transporter related  61.92 
 
 
265 aa  294  9e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2390  ABC transporter related  61.25 
 
 
243 aa  294  9e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  58.57 
 
 
260 aa  293  1e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  61.67 
 
 
251 aa  294  1e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  58.75 
 
 
242 aa  293  1e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>