More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0849 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  100 
 
 
247 aa  503  9.999999999999999e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  65.02 
 
 
244 aa  337  7e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  65.42 
 
 
240 aa  337  8e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  66.67 
 
 
240 aa  331  6e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  62.4 
 
 
244 aa  330  2e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  66.25 
 
 
240 aa  329  3e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.5 
 
 
244 aa  324  7e-88  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  62.08 
 
 
242 aa  324  8.000000000000001e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  62.08 
 
 
242 aa  318  6e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  61.25 
 
 
242 aa  317  7.999999999999999e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.08 
 
 
241 aa  316  2e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  61.67 
 
 
240 aa  316  2e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  62.08 
 
 
241 aa  316  2e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  62.08 
 
 
241 aa  316  2e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  61.51 
 
 
249 aa  314  6e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  61.67 
 
 
241 aa  314  7e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  61.67 
 
 
240 aa  313  1.9999999999999998e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  60 
 
 
246 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  62.55 
 
 
244 aa  313  1.9999999999999998e-84  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  61.67 
 
 
241 aa  311  3.9999999999999997e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  62.08 
 
 
240 aa  311  5.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  60.42 
 
 
242 aa  311  6.999999999999999e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  60.42 
 
 
242 aa  311  6.999999999999999e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60.42 
 
 
240 aa  310  1e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.42 
 
 
240 aa  310  1e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60.42 
 
 
240 aa  310  1e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.42 
 
 
240 aa  310  1e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.42 
 
 
240 aa  309  2e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  61.67 
 
 
240 aa  309  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.42 
 
 
240 aa  309  2e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  60.83 
 
 
244 aa  309  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.42 
 
 
240 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  59.83 
 
 
247 aa  307  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  60.42 
 
 
240 aa  307  1.0000000000000001e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.17 
 
 
240 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  59.17 
 
 
240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  59.58 
 
 
242 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  59.58 
 
 
240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  60.25 
 
 
247 aa  306  2.0000000000000002e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  60 
 
 
240 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.17 
 
 
240 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  59.58 
 
 
241 aa  305  6e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  59.58 
 
 
240 aa  305  6e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  60.42 
 
 
243 aa  304  7e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  58.02 
 
 
246 aa  304  8.000000000000001e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  59.58 
 
 
241 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  59.5 
 
 
252 aa  304  1.0000000000000001e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  59.58 
 
 
241 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  59.58 
 
 
241 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  61.09 
 
 
244 aa  303  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  56.56 
 
 
249 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  59.17 
 
 
241 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  59.58 
 
 
241 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  57.2 
 
 
246 aa  303  2.0000000000000002e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  60.25 
 
 
256 aa  303  2.0000000000000002e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  60 
 
 
243 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11340  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.58 
 
 
258 aa  302  3.0000000000000004e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.571361  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  59.58 
 
 
241 aa  301  5.000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  58.54 
 
 
249 aa  301  5.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  60.83 
 
 
239 aa  301  5.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  58.02 
 
 
243 aa  301  6.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  60 
 
 
243 aa  301  6.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  60.49 
 
 
243 aa  301  6.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  58.61 
 
 
247 aa  301  8.000000000000001e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  56.85 
 
 
248 aa  300  1e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  57.5 
 
 
242 aa  300  2e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  59.58 
 
 
244 aa  300  2e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5813  ABC transporter ATP-binding protein  59.76 
 
 
244 aa  299  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  58.75 
 
 
243 aa  299  3e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67030  ABC transporter ATP-binding protein  59.76 
 
 
244 aa  299  3e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  56.67 
 
 
242 aa  298  4e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  59.17 
 
 
246 aa  298  5e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  58.33 
 
 
242 aa  298  5e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1231  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.92 
 
 
242 aa  298  6e-80  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1445  ABC transporter related  60.42 
 
 
249 aa  297  9e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.124868  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  55.23 
 
 
246 aa  297  1e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0726  ABC transporter related  57.61 
 
 
247 aa  297  1e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000170097  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  57.08 
 
 
240 aa  296  2e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  57.5 
 
 
243 aa  296  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  57.5 
 
 
244 aa  296  2e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2280  ABC transporter related protein  54.01 
 
 
274 aa  296  3e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000113339  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  57.68 
 
 
243 aa  296  3e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1820  ABC transporter related  59.26 
 
 
248 aa  296  3e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1180  ABC transporter related  55.65 
 
 
360 aa  296  3e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3165  ABC transporter related  58.09 
 
 
257 aa  295  4e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.127499  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.92 
 
 
240 aa  295  5e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  56.85 
 
 
243 aa  295  6e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  56.25 
 
 
242 aa  295  7e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0377  ABC transporter-like  57.79 
 
 
244 aa  294  7e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.79 
 
 
251 aa  294  7e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  56.85 
 
 
243 aa  294  9e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  57.08 
 
 
240 aa  294  1e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  57.92 
 
 
240 aa  293  1e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0439  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  58.02 
 
 
250 aa  294  1e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0501472  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3964  ABC transporter related  57.08 
 
 
258 aa  293  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  56.25 
 
 
241 aa  293  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  57.5 
 
 
240 aa  293  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4332  ABC transporter related  57.08 
 
 
258 aa  293  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.282174 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2258  ABC transporter related  57.02 
 
 
286 aa  293  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21556  normal  0.633697 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0433  glutamine transport ATP-binding protein GlnQ  56.67 
 
 
242 aa  292  3e-78  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>