More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1042 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  100 
 
 		 241 aa  489  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  65.42 
 
 		 240 aa  333  1e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1526  ABC transporter, ATPase subunit  63.56 
 
 		 247 aa  326  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  64.26 
 
 		 267 aa  326  2.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  63.87 
 
 		 259 aa  325  4.0000000000000003e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  62.66 
 
 		 246 aa  324  9e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  64.02 
 
 		 273 aa  322  3e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  64.58 
 
 		 244 aa  321  6e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.92 
 
 		 269 aa  321  6e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  61 
 
 		 247 aa  321  8e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.33 
 
 		 240 aa  320  9.000000000000001e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6378  ABC transporter related  63.6 
 
 		 273 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  61.41 
 
 		 246 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.92 
 
 		 249 aa  319  1.9999999999999998e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2068  ABC transporter related  62.24 
 
 		 247 aa  319  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  62.34 
 
 		 256 aa  319  3e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2552  ABC transporter related  61.41 
 
 		 245 aa  319  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221216  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  62.08 
 
 		 253 aa  318  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  61.41 
 
 		 246 aa  318  6e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  61.51 
 
 		 269 aa  318  6e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  62.08 
 
 		 244 aa  317  1e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  59.58 
 
 		 249 aa  317  1e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  61.51 
 
 		 258 aa  317  1e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  61.51 
 
 		 258 aa  317  1e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  62.66 
 
 		 244 aa  316  2e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  62.5 
 
 		 239 aa  315  3e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  62.5 
 
 		 240 aa  315  3e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  61.41 
 
 		 242 aa  315  5e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  62.08 
 
 		 242 aa  315  5e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  65.95 
 
 		 248 aa  315  5e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  62.5 
 
 		 246 aa  315  5e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  65.52 
 
 		 248 aa  314  6e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  63.33 
 
 		 242 aa  315  6e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  63.49 
 
 		 243 aa  314  7e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  61.83 
 
 		 241 aa  314  8e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  61.83 
 
 		 241 aa  314  8e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  63.07 
 
 		 243 aa  314  8e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  61.67 
 
 		 242 aa  313  9.999999999999999e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  62.13 
 
 		 257 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3710  ABC transporter related  61.25 
 
 		 252 aa  313  9.999999999999999e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.110417 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  62.08 
 
 		 242 aa  313  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.41 
 
 		 241 aa  312  1.9999999999999998e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  61.41 
 
 		 241 aa  312  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  63.49 
 
 		 243 aa  312  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1075  ABC transporter  60.42 
 
 		 254 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.520778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  60.67 
 
 		 263 aa  312  2.9999999999999996e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  62.08 
 
 		 258 aa  312  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  61.67 
 
 		 247 aa  312  2.9999999999999996e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0055  general L-amino acid transport ATP-binding protein  61.7 
 
 		 268 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1343  ABC transporter related  62.5 
 
 		 246 aa  312  2.9999999999999996e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  61.28 
 
 		 257 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  59.58 
 
 		 242 aa  311  3.9999999999999997e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  59.83 
 
 		 263 aa  311  3.9999999999999997e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4510  ABC transporter related  62.82 
 
 		 266 aa  311  3.9999999999999997e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00592633  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  60.76 
 
 		 258 aa  312  3.9999999999999997e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  60.42 
 
 		 267 aa  311  4.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  61 
 
 		 241 aa  311  4.999999999999999e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1258  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60 
 
 		 254 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13929  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  60.83 
 
 		 249 aa  311  5.999999999999999e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  61.67 
 
 		 243 aa  311  5.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  62.08 
 
 		 240 aa  311  6.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  61.25 
 
 		 240 aa  310  9e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  63.33 
 
 		 257 aa  310  1e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  62.5 
 
 		 251 aa  310  1e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  61.41 
 
 		 241 aa  310  1e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0230  ABC transporter related protein  60.83 
 
 		 253 aa  309  2e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  60.83 
 
 		 253 aa  310  2e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2223  amino acid permease ATP-binding protein  60.83 
 
 		 251 aa  309  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  61.25 
 
 		 249 aa  309  2e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  61.25 
 
 		 243 aa  309  2e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2581  ABC transporter related  61.09 
 
 		 255 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.507078  normal  0.289132 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  60.83 
 
 		 251 aa  310  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0976  ABC transporter-like  60 
 
 		 254 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.58 
 
 		 252 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  60.42 
 
 		 253 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  60.42 
 
 		 242 aa  308  4e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  60.42 
 
 		 249 aa  308  4e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3332  ABC transporter related  61 
 
 		 261 aa  308  4e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  61 
 
 		 241 aa  308  5e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  61 
 
 		 241 aa  308  5e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2175  ABC transporter related  59.58 
 
 		 260 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.240046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3950  AABC amino acid transporter, ATPase subunit  59 
 
 		 250 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  61.25 
 
 		 243 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3860  ABC transporter related  60 
 
 		 253 aa  308  5.9999999999999995e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2319  ABC transporter related  59.58 
 
 		 260 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3597  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.58 
 
 		 260 aa  307  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  61.67 
 
 		 242 aa  308  6.999999999999999e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  60.42 
 
 		 240 aa  307  8e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0907  ABC transporter related  60 
 
 		 254 aa  307  9e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  58.58 
 
 		 258 aa  307  9e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60 
 
 		 240 aa  307  9e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  60.42 
 
 		 240 aa  307  9e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  61.25 
 
 		 245 aa  307  1.0000000000000001e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  61.25 
 
 		 257 aa  306  1.0000000000000001e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  60.42 
 
 		 265 aa  307  1.0000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.58 
 
 		 252 aa  306  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  60.42 
 
 		 240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4549  ABC transporter related  59.58 
 
 		 254 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  60.42 
 
 		 247 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  60.83 
 
 		 245 aa  306  2.0000000000000002e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>