More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_2055 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  100 
 
 
244 aa  496  1e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  74.58 
 
 
239 aa  370  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  74.17 
 
 
240 aa  363  1e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  71.37 
 
 
242 aa  358  3e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  70 
 
 
240 aa  346  2e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  69.17 
 
 
240 aa  346  2e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  70 
 
 
240 aa  344  6e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  66.67 
 
 
240 aa  338  4e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  67.22 
 
 
244 aa  337  9.999999999999999e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.83 
 
 
240 aa  336  1.9999999999999998e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  67.5 
 
 
240 aa  335  2.9999999999999997e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  66.67 
 
 
244 aa  335  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  66.67 
 
 
242 aa  334  5.999999999999999e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  67.08 
 
 
240 aa  333  1e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  67.08 
 
 
249 aa  332  4e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  66.67 
 
 
240 aa  331  7.000000000000001e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  67.5 
 
 
242 aa  330  1e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  66.25 
 
 
240 aa  330  1e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  65 
 
 
246 aa  329  2e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  67.08 
 
 
243 aa  327  9e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  66.67 
 
 
243 aa  327  9e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  63.33 
 
 
242 aa  327  1.0000000000000001e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  66.67 
 
 
240 aa  326  2.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  64.34 
 
 
245 aa  326  2.0000000000000001e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  68.75 
 
 
240 aa  325  3e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  63.75 
 
 
240 aa  325  3e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  64.32 
 
 
244 aa  324  8.000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  63.52 
 
 
245 aa  323  1e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.58 
 
 
244 aa  323  2e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  64.32 
 
 
246 aa  323  2e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  65.55 
 
 
244 aa  322  5e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  64.17 
 
 
246 aa  320  9.000000000000001e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  63.93 
 
 
244 aa  318  3.9999999999999996e-86  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  63.75 
 
 
241 aa  318  5e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  64.73 
 
 
241 aa  317  7.999999999999999e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  63.33 
 
 
241 aa  317  1e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  63.33 
 
 
241 aa  317  1e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  62.08 
 
 
241 aa  317  1e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  63.33 
 
 
241 aa  317  1e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  64.32 
 
 
242 aa  317  1e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2492  ABC transporter related  64.61 
 
 
243 aa  316  2e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  63.79 
 
 
244 aa  317  2e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  62.08 
 
 
247 aa  316  2e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  63.6 
 
 
253 aa  315  5e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  63.33 
 
 
241 aa  314  6e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  62.92 
 
 
241 aa  314  7e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  62.76 
 
 
257 aa  314  9e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.08 
 
 
241 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  63.9 
 
 
242 aa  313  9.999999999999999e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  62.08 
 
 
241 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  62.08 
 
 
241 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  62.92 
 
 
241 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3165  ABC transporter related  64.08 
 
 
257 aa  312  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.127499  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  62.96 
 
 
255 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  66.26 
 
 
243 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  63.33 
 
 
240 aa  312  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  61.67 
 
 
241 aa  312  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  61.48 
 
 
244 aa  312  2.9999999999999996e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  62.5 
 
 
241 aa  310  1e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  61.25 
 
 
246 aa  309  2e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0861  ATPase  60.08 
 
 
363 aa  308  4e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1038  ATPase  60.08 
 
 
363 aa  308  4e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.396319 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  59.2 
 
 
259 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  63.07 
 
 
247 aa  308  5.9999999999999995e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0713  ABC transporter related  59.83 
 
 
363 aa  308  6.999999999999999e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  60.67 
 
 
246 aa  307  9e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  60.78 
 
 
273 aa  306  1.0000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  59.58 
 
 
242 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  60.83 
 
 
249 aa  306  1.0000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  59.58 
 
 
240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  62.8 
 
 
263 aa  306  2.0000000000000002e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  62.6 
 
 
251 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4901  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.08 
 
 
240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  61.75 
 
 
263 aa  305  3e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.5 
 
 
240 aa  305  3e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  62.5 
 
 
240 aa  306  3e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  62.5 
 
 
240 aa  306  3e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.5 
 
 
240 aa  306  3e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  62.5 
 
 
240 aa  306  3e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  62.5 
 
 
240 aa  306  3e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  62.66 
 
 
249 aa  305  3e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.5 
 
 
240 aa  305  3e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.08 
 
 
240 aa  306  3e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  62.5 
 
 
240 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1180  ABC transporter related  59 
 
 
360 aa  305  4.0000000000000004e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6988  ABC transporter related  61.92 
 
 
265 aa  305  5.0000000000000004e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  60.83 
 
 
248 aa  305  5.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  62.5 
 
 
252 aa  304  8.000000000000001e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4704  ABC transporter-related protein  61.92 
 
 
257 aa  304  8.000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.874551  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  60.42 
 
 
242 aa  304  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  60.42 
 
 
242 aa  304  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2021  ABC transporter related  59 
 
 
363 aa  303  1.0000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  61.25 
 
 
253 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1820  ABC transporter related  62.96 
 
 
248 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  61.67 
 
 
240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  60.33 
 
 
246 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  60.83 
 
 
240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.25 
 
 
240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  61.67 
 
 
257 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  61.41 
 
 
243 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>