More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0396 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  100 
 
 		 253 aa  520  1e-146  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  95.26 
 
 		 253 aa  499  1e-140  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  94.47 
 
 		 284 aa  494  1e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  67.08 
 
 		 249 aa  333  2e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  67.08 
 
 		 240 aa  330  1e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  62.8 
 
 		 252 aa  329  2e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.15 
 
 		 269 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  63.49 
 
 		 245 aa  325  5e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  64.85 
 
 		 239 aa  325  6e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  62.95 
 
 		 253 aa  324  8.000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.5 
 
 		 249 aa  323  2e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  62.66 
 
 		 245 aa  323  2e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  66.12 
 
 		 246 aa  322  3e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  61.75 
 
 		 269 aa  322  3e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  62.4 
 
 		 244 aa  321  5e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  63.2 
 
 		 257 aa  322  5e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  66.53 
 
 		 262 aa  321  7e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  66.53 
 
 		 262 aa  321  7e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4510  ABC transporter related  63.86 
 
 		 266 aa  320  9.999999999999999e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00592633  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  66.26 
 
 		 243 aa  320  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  62.7 
 
 		 246 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1343  ABC transporter related  64.46 
 
 		 246 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  62.25 
 
 		 253 aa  319  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  62.8 
 
 		 257 aa  319  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  63.05 
 
 		 258 aa  319  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  62.4 
 
 		 258 aa  318  3.9999999999999996e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  62.4 
 
 		 258 aa  318  3.9999999999999996e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  63.16 
 
 		 257 aa  318  6e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  64.63 
 
 		 247 aa  318  6e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  65.27 
 
 		 262 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2552  ABC transporter related  62.4 
 
 		 245 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221216  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  62.4 
 
 		 244 aa  317  9e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_004310  BR1959  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.8 
 
 		 251 aa  317  1e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0443525  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  61.48 
 
 		 246 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2758  ABC transporter related  62.3 
 
 		 252 aa  317  1e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6378  ABC transporter related  63.33 
 
 		 273 aa  317  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  66.26 
 
 		 248 aa  316  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  63.75 
 
 		 246 aa  316  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  62.81 
 
 		 267 aa  316  2e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  62.3 
 
 		 246 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  62.11 
 
 		 256 aa  316  2e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  62.08 
 
 		 240 aa  316  2e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3987  ABC transporter related  62.2 
 
 		 255 aa  316  2e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  64.49 
 
 		 246 aa  316  3e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  63.11 
 
 		 246 aa  315  3e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  61.35 
 
 		 267 aa  315  4e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  62.4 
 
 		 242 aa  315  4e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  61.79 
 
 		 273 aa  315  5e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  62.75 
 
 		 255 aa  315  5e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  63.49 
 
 		 247 aa  315  6e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1885  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.4 
 
 		 251 aa  314  8e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00643068  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  61.25 
 
 		 242 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  61.41 
 
 		 242 aa  314  9.999999999999999e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  65.45 
 
 		 248 aa  313  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  62.81 
 
 		 242 aa  312  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0055  general L-amino acid transport ATP-binding protein  61.6 
 
 		 268 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3991  ABC transporter related  63.33 
 
 		 261 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  64.46 
 
 		 248 aa  312  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  60.73 
 
 		 253 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  63.33 
 
 		 242 aa  312  3.9999999999999997e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0796  ABC transporter related  63.27 
 
 		 257 aa  312  3.9999999999999997e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  61.16 
 
 		 262 aa  311  3.9999999999999997e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0976  ABC transporter-like  59.44 
 
 		 254 aa  311  4.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1075  ABC transporter  61.41 
 
 		 254 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.520778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0230  ABC transporter related protein  60.73 
 
 		 253 aa  311  6.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  60.64 
 
 		 252 aa  311  6.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2020  ABC transporter related  65.16 
 
 		 246 aa  311  6.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  62.24 
 
 		 244 aa  311  7.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  60.32 
 
 		 253 aa  310  1e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1300  general amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.63 
 
 		 254 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1258  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61 
 
 		 254 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13929  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4425  ABC transporter related  58.63 
 
 		 254 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.329357 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  61.57 
 
 		 247 aa  310  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0907  ABC transporter related  58.63 
 
 		 254 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  61.48 
 
 		 251 aa  310  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4182  ABC transporter related protein  63.18 
 
 		 261 aa  310  2e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4549  ABC transporter related  58.63 
 
 		 254 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  60.98 
 
 		 249 aa  309  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1075  ABC transporter related  61.16 
 
 		 250 aa  309  2.9999999999999997e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1820  ABC transporter related  65.16 
 
 		 248 aa  309  2.9999999999999997e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  60.83 
 
 		 240 aa  308  4e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  61.32 
 
 		 244 aa  309  4e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  61.38 
 
 		 258 aa  308  4e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  60.49 
 
 		 254 aa  309  4e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4427  ABC transporter related  64.85 
 
 		 254 aa  308  4e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120026  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  60.49 
 
 		 254 aa  309  4e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  62.96 
 
 		 243 aa  308  5e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  58.87 
 
 		 252 aa  308  5e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1526  ABC transporter, ATPase subunit  61.41 
 
 		 247 aa  308  5.9999999999999995e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  60.08 
 
 		 249 aa  308  5.9999999999999995e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  63.33 
 
 		 240 aa  308  5.9999999999999995e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3950  AABC amino acid transporter, ATPase subunit  58.7 
 
 		 250 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2327  ABC transporter related  61.69 
 
 		 252 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3710  ABC transporter related  59.13 
 
 		 252 aa  308  6.999999999999999e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.110417 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  61.67 
 
 		 246 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  58.54 
 
 		 259 aa  306  2.0000000000000002e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  63.18 
 
 		 263 aa  306  2.0000000000000002e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  58.13 
 
 		 255 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  59.27 
 
 		 249 aa  306  2.0000000000000002e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  61.29 
 
 		 263 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>