More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0166 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0166  ATPase  100 
 
 
244 aa  498  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  82.38 
 
 
244 aa  414  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  79.84 
 
 
249 aa  397  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  78.66 
 
 
246 aa  385  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  66.11 
 
 
239 aa  332  4e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  65.27 
 
 
240 aa  330  1e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  64.44 
 
 
242 aa  322  3e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  65.55 
 
 
244 aa  322  5e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  64.02 
 
 
242 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  64.44 
 
 
244 aa  320  9.999999999999999e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1091  ABC transporter related  70.71 
 
 
242 aa  319  1.9999999999999998e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.589551  normal  0.0194834 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  62.66 
 
 
244 aa  318  7e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.18 
 
 
240 aa  317  9e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  63.18 
 
 
240 aa  317  9e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  61 
 
 
242 aa  316  2e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  61.51 
 
 
242 aa  315  4e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  62.66 
 
 
249 aa  315  4e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  62.24 
 
 
249 aa  315  6e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  61.92 
 
 
240 aa  314  7e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  62.92 
 
 
243 aa  314  8e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  64.02 
 
 
242 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  61.09 
 
 
242 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.25 
 
 
269 aa  313  1.9999999999999998e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  61.41 
 
 
247 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  62.66 
 
 
267 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  63.18 
 
 
240 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  63.03 
 
 
246 aa  311  4.999999999999999e-84  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.25 
 
 
249 aa  311  5.999999999999999e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  62.76 
 
 
240 aa  311  6.999999999999999e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  62.08 
 
 
243 aa  310  1e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  61.92 
 
 
240 aa  310  1e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.73 
 
 
284 aa  309  2e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1343  ABC transporter related  62.24 
 
 
246 aa  309  2e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  62.34 
 
 
242 aa  309  2e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  62.76 
 
 
243 aa  310  2e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  61.92 
 
 
242 aa  309  2e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.91 
 
 
253 aa  309  2.9999999999999997e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  61.32 
 
 
253 aa  309  2.9999999999999997e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  60.83 
 
 
246 aa  309  2.9999999999999997e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  60.42 
 
 
258 aa  309  2.9999999999999997e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  60.42 
 
 
258 aa  309  2.9999999999999997e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  59.75 
 
 
246 aa  308  5e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  62.61 
 
 
247 aa  308  5.9999999999999995e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  61.67 
 
 
255 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.41 
 
 
251 aa  307  1.0000000000000001e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  59.83 
 
 
240 aa  307  1.0000000000000001e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  60.25 
 
 
243 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  62.34 
 
 
243 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  58.51 
 
 
246 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  60.5 
 
 
246 aa  306  2.0000000000000002e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  62.34 
 
 
243 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  60.17 
 
 
246 aa  306  3e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.92 
 
 
240 aa  305  3e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  60.74 
 
 
242 aa  306  3e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2492  ABC transporter related  61.16 
 
 
243 aa  306  3e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  59.58 
 
 
269 aa  305  3e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  62.14 
 
 
243 aa  305  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  61.41 
 
 
245 aa  305  5.0000000000000004e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  61.34 
 
 
247 aa  305  5.0000000000000004e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  60.58 
 
 
249 aa  305  6e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1477  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  61.67 
 
 
240 aa  304  7e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  61.92 
 
 
252 aa  304  8.000000000000001e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  59.24 
 
 
262 aa  304  8.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  59.24 
 
 
262 aa  304  8.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  60.33 
 
 
248 aa  304  8.000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6378  ABC transporter related  60.42 
 
 
273 aa  304  9.000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  59.66 
 
 
262 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1075  ABC transporter  58.92 
 
 
254 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.520778  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  60.83 
 
 
247 aa  303  1.0000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  60.67 
 
 
242 aa  303  1.0000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  61.09 
 
 
247 aa  303  1.0000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  61.76 
 
 
246 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  58.85 
 
 
253 aa  302  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  60.25 
 
 
242 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0976  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  61.67 
 
 
240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.345768  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0892  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  61.67 
 
 
240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0239276  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  59.17 
 
 
257 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0864  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  61.67 
 
 
240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0796  ABC transporter related  60.08 
 
 
257 aa  303  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0955  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  61.67 
 
 
240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170507  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0923  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  61.67 
 
 
240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0351202  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  60.25 
 
 
249 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.09 
 
 
241 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1258  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.51 
 
 
254 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13929  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  59.26 
 
 
256 aa  302  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  61.09 
 
 
241 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  61.09 
 
 
240 aa  302  3.0000000000000004e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  61.09 
 
 
241 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.75 
 
 
252 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0238  ABC transporter related  59.67 
 
 
250 aa  302  4.0000000000000003e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.783536  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  61.51 
 
 
240 aa  302  4.0000000000000003e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0244  ABC transporter related  59.67 
 
 
250 aa  302  4.0000000000000003e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  59.09 
 
 
243 aa  302  4.0000000000000003e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0414  putative ABC transporter, ATP-binding protein  59.41 
 
 
242 aa  302  4.0000000000000003e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2490  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  61.67 
 
 
240 aa  301  5.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  61.09 
 
 
241 aa  301  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  60.16 
 
 
254 aa  301  5.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2880  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  62.5 
 
 
240 aa  301  6.000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.37937  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  60 
 
 
257 aa  301  7.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  58.75 
 
 
257 aa  301  7.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.643949 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>