More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2492 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2492  ABC transporter related  100 
 
 		 243 aa  501  1e-141  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1820  ABC transporter related  80.66 
 
 		 248 aa  400  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  74.07 
 
 		 243 aa  382  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  75.31 
 
 		 243 aa  383  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2020  ABC transporter related  72.13 
 
 		 246 aa  367  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  69.96 
 
 		 248 aa  341  5e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  68.72 
 
 		 240 aa  340  1e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  69.14 
 
 		 246 aa  340  1e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  69.55 
 
 		 248 aa  340  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  68.31 
 
 		 247 aa  334  7.999999999999999e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  67.49 
 
 		 246 aa  326  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5813  ABC transporter ATP-binding protein  67.62 
 
 		 244 aa  324  9e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0377  ABC transporter-like  65.98 
 
 		 244 aa  323  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67030  ABC transporter ATP-binding protein  67.21 
 
 		 244 aa  323  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  65.02 
 
 		 248 aa  319  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1343  ABC transporter related  64.2 
 
 		 246 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  64.2 
 
 		 242 aa  317  1e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0443  ABC transporter related  65.57 
 
 		 244 aa  317  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  64.61 
 
 		 244 aa  316  2e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  64.61 
 
 		 240 aa  316  2e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  60.91 
 
 		 242 aa  311  5.999999999999999e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  61.32 
 
 		 240 aa  311  5.999999999999999e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  64.61 
 
 		 239 aa  311  9e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  60.49 
 
 		 246 aa  310  9e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  60.91 
 
 		 242 aa  310  1e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  62.14 
 
 		 240 aa  310  2e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2758  ABC transporter related  62.96 
 
 		 252 aa  309  2.9999999999999997e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  62.14 
 
 		 255 aa  309  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  61.73 
 
 		 242 aa  309  2.9999999999999997e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  61.32 
 
 		 243 aa  309  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.32 
 
 		 240 aa  307  9e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  60.49 
 
 		 244 aa  307  9e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.79 
 
 		 253 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5022  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  65.57 
 
 		 244 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.670825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  60.91 
 
 		 242 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  65.43 
 
 		 253 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  59.5 
 
 		 249 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  61.16 
 
 		 244 aa  306  3e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.2 
 
 		 284 aa  305  3e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5072  ABC transporter related  65.57 
 
 		 244 aa  304  7e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4896  ABC transporter related  65.57 
 
 		 244 aa  304  7e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0657003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  62.55 
 
 		 240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  58.85 
 
 		 243 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  61.32 
 
 		 249 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  60.74 
 
 		 247 aa  303  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  60.91 
 
 		 243 aa  301  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  61.32 
 
 		 241 aa  301  5.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  61.73 
 
 		 240 aa  300  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  59.26 
 
 		 242 aa  300  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.5 
 
 		 269 aa  299  2e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  60.08 
 
 		 242 aa  300  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  60.91 
 
 		 243 aa  300  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  61.32 
 
 		 244 aa  300  2e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  60.08 
 
 		 262 aa  300  2e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  61.32 
 
 		 240 aa  300  2e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  59.92 
 
 		 258 aa  299  3e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  60.91 
 
 		 243 aa  299  3e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  59.92 
 
 		 258 aa  299  3e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  59.92 
 
 		 257 aa  298  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  62.14 
 
 		 240 aa  298  6e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  60.74 
 
 		 256 aa  298  6e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  60.08 
 
 		 242 aa  298  6e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  59.5 
 
 		 269 aa  297  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  59.5 
 
 		 257 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.09 
 
 		 249 aa  296  3e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  59.67 
 
 		 256 aa  295  4e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  60.66 
 
 		 243 aa  295  5e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  60.49 
 
 		 243 aa  295  5e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  60.33 
 
 		 258 aa  295  6e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  55.56 
 
 		 246 aa  294  9e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  60.91 
 
 		 240 aa  294  1e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0055  general L-amino acid transport ATP-binding protein  59.92 
 
 		 268 aa  293  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6378  ABC transporter related  60.74 
 
 		 273 aa  294  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  60.33 
 
 		 263 aa  294  1e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  59.5 
 
 		 262 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  60.49 
 
 		 267 aa  293  2e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  59.5 
 
 		 262 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  59.5 
 
 		 267 aa  293  2e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4510  ABC transporter related  60.33 
 
 		 266 aa  293  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00592633  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  61.32 
 
 		 257 aa  292  3e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  60.49 
 
 		 240 aa  292  3e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3694  ABC transporter related  59.67 
 
 		 248 aa  292  3e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.749012  normal  0.245017 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  58.68 
 
 		 262 aa  291  5e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  58.02 
 
 		 247 aa  291  5e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  59.5 
 
 		 263 aa  291  6e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0693  ABC transporter-related protein  57.85 
 
 		 249 aa  291  6e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.413615  normal  0.685528 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  62.39 
 
 		 263 aa  291  7e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  56.79 
 
 		 242 aa  291  7e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  64.29 
 
 		 246 aa  291  8e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  58.85 
 
 		 249 aa  291  8e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  58.02 
 
 		 242 aa  291  9e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  59.67 
 
 		 243 aa  291  9e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  63.39 
 
 		 243 aa  290  1e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  58.85 
 
 		 259 aa  290  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  58.85 
 
 		 249 aa  290  1e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  59.67 
 
 		 240 aa  290  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0020  amino acid ABC transporter ATPase  59.26 
 
 		 256 aa  290  1e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.732673  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2063  ABC transporter related  58.02 
 
 		 246 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0300144  normal  0.143114 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3103  ABC transporter related  58.44 
 
 		 246 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.209111  normal  0.482435 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3458  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  58.44 
 
 		 246 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>