More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3519 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  100 
 
 
240 aa  489  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  75 
 
 
242 aa  358  4e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  72.92 
 
 
239 aa  353  2e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  69.17 
 
 
244 aa  351  5.9999999999999994e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  72.08 
 
 
240 aa  350  2e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  70.42 
 
 
240 aa  347  1e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  70 
 
 
244 aa  346  2e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  67.92 
 
 
241 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  67.92 
 
 
241 aa  341  5e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  67.92 
 
 
241 aa  341  5e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  67.5 
 
 
241 aa  340  2e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  69.17 
 
 
240 aa  338  2.9999999999999998e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  68.33 
 
 
240 aa  336  1.9999999999999998e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  67.92 
 
 
240 aa  335  2.9999999999999997e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  66.25 
 
 
245 aa  335  2.9999999999999997e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  65.42 
 
 
245 aa  334  5.999999999999999e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  67.92 
 
 
240 aa  332  4e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  67.08 
 
 
241 aa  331  5e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  65.83 
 
 
244 aa  331  6e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  64.58 
 
 
242 aa  330  1e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  65.27 
 
 
244 aa  330  1e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  66.67 
 
 
241 aa  330  1e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  67.92 
 
 
240 aa  330  1e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  65.42 
 
 
242 aa  330  1e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  66.25 
 
 
241 aa  329  3e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  67.5 
 
 
241 aa  329  3e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  66.67 
 
 
241 aa  329  3e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  66.25 
 
 
241 aa  329  3e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  63.33 
 
 
242 aa  328  4e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  65.83 
 
 
243 aa  328  5.0000000000000004e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  67.08 
 
 
240 aa  328  5.0000000000000004e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  67.08 
 
 
240 aa  328  6e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  65.42 
 
 
240 aa  327  8e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  65.83 
 
 
240 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  65.83 
 
 
240 aa  327  1.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  62.92 
 
 
242 aa  325  5e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  66.53 
 
 
247 aa  325  5e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  62.08 
 
 
242 aa  325  6e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  64.85 
 
 
246 aa  324  7e-88  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  64.17 
 
 
244 aa  324  7e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  65.42 
 
 
241 aa  324  8.000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  64.58 
 
 
242 aa  323  1e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  64.58 
 
 
242 aa  323  2e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  63.75 
 
 
252 aa  323  2e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  65 
 
 
244 aa  323  2e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  65.56 
 
 
243 aa  321  5e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  64.02 
 
 
246 aa  322  5e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  65 
 
 
241 aa  321  7e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  64.29 
 
 
246 aa  320  9.999999999999999e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  61.67 
 
 
242 aa  320  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  65.42 
 
 
243 aa  320  9.999999999999999e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  62.5 
 
 
249 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  64.32 
 
 
243 aa  319  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  62.08 
 
 
242 aa  319  3e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  62.5 
 
 
246 aa  319  3e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  65.42 
 
 
240 aa  318  3.9999999999999996e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1343  ABC transporter related  64.17 
 
 
246 aa  318  5e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  65.69 
 
 
249 aa  318  5e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  64.17 
 
 
244 aa  318  6e-86  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  61.6 
 
 
273 aa  318  7e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  62.92 
 
 
242 aa  317  7e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  63.9 
 
 
243 aa  317  7.999999999999999e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  60.83 
 
 
247 aa  317  7.999999999999999e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2492  ABC transporter related  64.61 
 
 
243 aa  316  2e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  66.26 
 
 
243 aa  317  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  62.08 
 
 
253 aa  316  2e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  63.75 
 
 
240 aa  316  2e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.42 
 
 
240 aa  315  3e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  62.34 
 
 
249 aa  315  3e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  62.76 
 
 
257 aa  315  3e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  61.67 
 
 
255 aa  315  3e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4901  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.42 
 
 
240 aa  315  4e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.5 
 
 
253 aa  314  6e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.83 
 
 
240 aa  314  7e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.83 
 
 
240 aa  314  7e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  65.83 
 
 
240 aa  314  7e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  65.55 
 
 
243 aa  314  7e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  65.83 
 
 
240 aa  314  8e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  64.85 
 
 
247 aa  314  8e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  65.83 
 
 
240 aa  314  8e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  65.83 
 
 
240 aa  314  9e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  65.83 
 
 
240 aa  314  9e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.83 
 
 
240 aa  314  9e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.92 
 
 
244 aa  313  9.999999999999999e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.08 
 
 
284 aa  313  9.999999999999999e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2981  ABC transporter related  62.66 
 
 
245 aa  313  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137964  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  63.33 
 
 
248 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  62.08 
 
 
246 aa  312  1.9999999999999998e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  61.67 
 
 
246 aa  312  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6988  ABC transporter related  61.92 
 
 
265 aa  312  1.9999999999999998e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  62.08 
 
 
243 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3165  ABC transporter related  64.02 
 
 
257 aa  312  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.127499  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  61.25 
 
 
246 aa  312  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  63.9 
 
 
244 aa  312  2.9999999999999996e-84  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  62.92 
 
 
248 aa  311  3.9999999999999997e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4395  ABC transporter related  60.58 
 
 
243 aa  311  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0223537  normal  0.50723 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0985  ABC transporter related  61 
 
 
247 aa  311  5.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.178128 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  60.83 
 
 
248 aa  311  5.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  62.08 
 
 
241 aa  311  6.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1820  ABC transporter related  64.61 
 
 
248 aa  311  7.999999999999999e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>