More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4750 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  100 
 
 
239 aa  489  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  77.5 
 
 
242 aa  377  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  74.58 
 
 
244 aa  370  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  72.92 
 
 
240 aa  363  2e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  72.92 
 
 
240 aa  353  2e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  70.42 
 
 
240 aa  352  2.9999999999999997e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  71.67 
 
 
240 aa  346  2e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  67.08 
 
 
244 aa  342  2e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  68.33 
 
 
240 aa  338  5e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  68.75 
 
 
240 aa  337  8e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  69.58 
 
 
243 aa  337  9.999999999999999e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  65.42 
 
 
244 aa  332  2e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  66.11 
 
 
244 aa  332  4e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  66.11 
 
 
253 aa  331  6e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  67.92 
 
 
243 aa  330  1e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  65.69 
 
 
249 aa  327  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  66.67 
 
 
240 aa  326  2.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.27 
 
 
284 aa  325  3e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  66.67 
 
 
240 aa  325  4.0000000000000003e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  64.85 
 
 
253 aa  325  5e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  62.76 
 
 
245 aa  324  6e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.83 
 
 
240 aa  324  8.000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  62.76 
 
 
245 aa  322  2e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  67.5 
 
 
240 aa  322  3e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  64.58 
 
 
246 aa  322  3e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  65.42 
 
 
240 aa  322  4e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  63.6 
 
 
252 aa  322  4e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  61.25 
 
 
242 aa  321  7e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  65 
 
 
240 aa  321  8e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0377  ABC transporter-like  65.57 
 
 
244 aa  321  8e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  64.58 
 
 
241 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  64.58 
 
 
240 aa  318  3.9999999999999996e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  64.17 
 
 
244 aa  318  3.9999999999999996e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  64.02 
 
 
244 aa  318  3.9999999999999996e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  62.92 
 
 
249 aa  318  3.9999999999999996e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  63.75 
 
 
246 aa  317  1e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  62.92 
 
 
243 aa  317  1e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  62.08 
 
 
242 aa  316  2e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  63.18 
 
 
246 aa  315  3e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  62.5 
 
 
241 aa  315  3e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  62.08 
 
 
242 aa  315  4e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3674  ABC transporter related  63.33 
 
 
265 aa  315  4e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  62.92 
 
 
242 aa  314  7e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  62.5 
 
 
243 aa  314  7e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  64.58 
 
 
244 aa  314  9e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  60.83 
 
 
242 aa  313  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  62.76 
 
 
246 aa  313  9.999999999999999e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67030  ABC transporter ATP-binding protein  64.75 
 
 
244 aa  313  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5813  ABC transporter ATP-binding protein  64.75 
 
 
244 aa  313  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.33 
 
 
241 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  62.5 
 
 
243 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  63.33 
 
 
241 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  64.44 
 
 
247 aa  313  1.9999999999999998e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  63.33 
 
 
241 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  62.92 
 
 
241 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  62.92 
 
 
242 aa  311  3.9999999999999997e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  62.92 
 
 
241 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  65.43 
 
 
243 aa  312  3.9999999999999997e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  62.92 
 
 
241 aa  311  4.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0443  ABC transporter related  63.11 
 
 
244 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  61.51 
 
 
246 aa  310  9e-84  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2492  ABC transporter related  64.61 
 
 
243 aa  311  9e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  61.67 
 
 
246 aa  310  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  63.18 
 
 
247 aa  310  1e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  63.6 
 
 
249 aa  310  1e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  62.5 
 
 
241 aa  310  1e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  64.17 
 
 
242 aa  310  1e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  62.92 
 
 
241 aa  310  2e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  63.9 
 
 
243 aa  309  2e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  64.32 
 
 
241 aa  309  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  63.33 
 
 
244 aa  309  2e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  60.83 
 
 
247 aa  309  2e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  63.07 
 
 
243 aa  309  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  62.5 
 
 
246 aa  308  4e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  65 
 
 
240 aa  308  4e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0923  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  62.76 
 
 
240 aa  308  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0351202  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0976  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  62.76 
 
 
240 aa  308  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.345768  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0955  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  62.76 
 
 
240 aa  308  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170507  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0892  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  62.76 
 
 
240 aa  308  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0239276  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0864  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  62.76 
 
 
240 aa  308  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  60.42 
 
 
243 aa  308  5e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  60.16 
 
 
263 aa  308  5e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  62.5 
 
 
241 aa  308  5.9999999999999995e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2880  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  63.18 
 
 
240 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.37937  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  62.34 
 
 
257 aa  307  8e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  61.2 
 
 
263 aa  307  8e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  62.08 
 
 
248 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  59.6 
 
 
273 aa  306  1.0000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0403  ABC transporter related  60.83 
 
 
245 aa  307  1.0000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  62.34 
 
 
253 aa  307  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3165  ABC transporter related  63.6 
 
 
257 aa  306  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.127499  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  60 
 
 
242 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  62.66 
 
 
244 aa  306  1.0000000000000001e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1820  ABC transporter related  62.96 
 
 
248 aa  306  1.0000000000000001e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  62.92 
 
 
241 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1526  ABC transporter, ATPase subunit  62.5 
 
 
247 aa  306  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  62.5 
 
 
255 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1582  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  62.34 
 
 
240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.42936  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  62.66 
 
 
243 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1477  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  61.92 
 
 
240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>