More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0238 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0238  ABC transporter related  100 
 
 		 250 aa  517  1e-146  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.783536  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0244  ABC transporter related  100 
 
 		 250 aa  517  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0358  ABC transporter related  85.77 
 
 		 252 aa  434  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0299  ABC transporter-related protein  85.37 
 
 		 252 aa  433  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1604  ABC transporter related  85.48 
 
 		 247 aa  403  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0403  ABC transporter related  70.49 
 
 		 245 aa  357  9.999999999999999e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_003296  RS00357  ABC transporter ATP-binding protein  71.07 
 
 		 249 aa  350  1e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  64.05 
 
 		 252 aa  320  9.999999999999999e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  60.89 
 
 		 249 aa  320  9.999999999999999e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  59.67 
 
 		 244 aa  309  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  59.68 
 
 		 253 aa  308  4e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  58.06 
 
 		 253 aa  304  8.000000000000001e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  61.67 
 
 		 244 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  60.48 
 
 		 254 aa  302  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  60.48 
 
 		 254 aa  302  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  59.67 
 
 		 244 aa  302  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  62.92 
 
 		 250 aa  301  4.0000000000000003e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  61.32 
 
 		 249 aa  301  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0519  ABC transporter related  60.74 
 
 		 247 aa  300  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  62.5 
 
 		 245 aa  300  1e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.47 
 
 		 253 aa  299  3e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0536  ABC transporter related  60.33 
 
 		 247 aa  299  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.47 
 
 		 284 aa  298  5e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  61.16 
 
 		 244 aa  298  8e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  59.02 
 
 		 246 aa  297  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60.89 
 
 		 251 aa  296  2e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  61.34 
 
 		 244 aa  296  2e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  60.5 
 
 		 242 aa  295  3e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  58.02 
 
 		 246 aa  296  3e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4546  ABC transporter related  59.27 
 
 		 260 aa  295  5e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.0112462 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  60.49 
 
 		 247 aa  295  5e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3987  ABC transporter related  58.37 
 
 		 255 aa  295  5e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  60.83 
 
 		 242 aa  295  5e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4002  ABC transporter related  59.51 
 
 		 253 aa  295  7e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  60.49 
 
 		 248 aa  293  1e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  59.24 
 
 		 242 aa  293  1e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1622  ABC transporter related  60.08 
 
 		 252 aa  293  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320946  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1395  ABC transporter related  59.27 
 
 		 251 aa  292  4e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  62.34 
 
 		 243 aa  291  5e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  55.04 
 
 		 240 aa  291  6e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  56.4 
 
 		 267 aa  291  7e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  60.08 
 
 		 239 aa  291  8e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0230  ABC transporter related protein  57.55 
 
 		 253 aa  291  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  58.06 
 
 		 258 aa  290  1e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  61.09 
 
 		 246 aa  290  1e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  60.09 
 
 		 240 aa  290  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  58.33 
 
 		 249 aa  290  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  57.55 
 
 		 253 aa  290  2e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3860  ABC transporter related  56.68 
 
 		 253 aa  290  2e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  59.17 
 
 		 244 aa  290  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1247  ABC transporter related protein  60.33 
 
 		 249 aa  290  2e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0795163  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2223  amino acid permease ATP-binding protein  58.06 
 
 		 251 aa  290  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  57.55 
 
 		 253 aa  290  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  60.42 
 
 		 245 aa  290  2e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  58.06 
 
 		 251 aa  290  2e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  57.98 
 
 		 242 aa  289  3e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  60.61 
 
 		 242 aa  289  3e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  58.8 
 
 		 262 aa  288  4e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  59.26 
 
 		 262 aa  288  4e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  59.66 
 
 		 242 aa  288  4e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  55.83 
 
 		 242 aa  288  4e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  58.8 
 
 		 262 aa  288  4e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  58.33 
 
 		 249 aa  288  5.0000000000000004e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  58.06 
 
 		 270 aa  288  6e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  59.5 
 
 		 259 aa  288  6e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  58.65 
 
 		 243 aa  288  6e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  58.2 
 
 		 261 aa  288  7e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2987  ABC transporter related  63.03 
 
 		 257 aa  288  8e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715624  normal  0.638101 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03129  predicted amino-acid transporter subunit  56.56 
 
 		 252 aa  287  9e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0435  ABC transporter related protein  56.56 
 
 		 252 aa  287  9e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3466  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.56 
 
 		 252 aa  287  9e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0172997  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  58.37 
 
 		 262 aa  287  9e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03080  hypothetical protein  56.56 
 
 		 252 aa  287  9e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0435  ABC transporter related  56.56 
 
 		 252 aa  287  9e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.337414 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.56 
 
 		 252 aa  287  1e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  56.28 
 
 		 253 aa  287  1e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  57.98 
 
 		 240 aa  286  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4592  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.56 
 
 		 252 aa  286  2e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.56 
 
 		 252 aa  286  2e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  57.72 
 
 		 252 aa  286  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3757  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.56 
 
 		 252 aa  286  2e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0539181  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.49 
 
 		 257 aa  285  2.9999999999999996e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  59.41 
 
 		 242 aa  286  2.9999999999999996e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  58.94 
 
 		 257 aa  286  2.9999999999999996e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  58.23 
 
 		 243 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3710  ABC transporter related  56.15 
 
 		 252 aa  285  2.9999999999999996e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.110417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2428  ABC transporter-related protein  61.16 
 
 		 264 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419191  normal  0.0707207 
 
 
-
 
NC_004310  BR1959  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.68 
 
 		 251 aa  285  5e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0443525  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  61.11 
 
 		 243 aa  285  5e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3674  ABC transporter related  57.09 
 
 		 265 aa  285  5e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  58.3 
 
 		 256 aa  285  5.999999999999999e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2001  ABC transporter related  57.61 
 
 		 258 aa  285  5.999999999999999e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0976  ABC transporter-like  58.72 
 
 		 254 aa  284  7e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4480  ABC transporter related  57.72 
 
 		 266 aa  285  7e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.2 
 
 		 251 aa  284  8e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1152  ABC transporter related  57.89 
 
 		 252 aa  284  9e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0985  ABC transporter related  56.2 
 
 		 247 aa  284  9e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.178128 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2139  ABC transporter-related protein  59.92 
 
 		 251 aa  284  9e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  58.23 
 
 		 243 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  57.61 
 
 		 247 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>