More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS00357 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS00357  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 249 aa  501  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0403  ABC transporter related  80.25 
 
 		 245 aa  394  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0299  ABC transporter-related protein  73.44 
 
 		 252 aa  352  4e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0244  ABC transporter related  71.07 
 
 		 250 aa  350  1e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0238  ABC transporter related  71.07 
 
 		 250 aa  350  1e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.783536  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0358  ABC transporter related  70.83 
 
 		 252 aa  342  5e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1604  ABC transporter related  72.5 
 
 		 247 aa  326  2.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  65.11 
 
 		 249 aa  312  2.9999999999999996e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  63.64 
 
 		 252 aa  301  4.0000000000000003e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1300  general amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.83 
 
 		 254 aa  294  8e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4549  ABC transporter related  59.83 
 
 		 254 aa  294  8e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4425  ABC transporter related  59.83 
 
 		 254 aa  294  8e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.329357 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  58.68 
 
 		 253 aa  293  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1075  ABC transporter related  59.58 
 
 		 250 aa  293  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03129  predicted amino-acid transporter subunit  60.25 
 
 		 252 aa  293  2e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0435  ABC transporter related protein  60.25 
 
 		 252 aa  293  2e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0435  ABC transporter related  60.25 
 
 		 252 aa  293  2e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.337414 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3466  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.25 
 
 		 252 aa  293  2e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0172997  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03080  hypothetical protein  60.25 
 
 		 252 aa  293  2e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0907  ABC transporter related  59.41 
 
 		 254 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3757  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.25 
 
 		 252 aa  292  3e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0539181  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0976  ABC transporter-like  59.41 
 
 		 254 aa  293  3e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4592  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.25 
 
 		 252 aa  292  3e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  59 
 
 		 253 aa  291  5e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  58.58 
 
 		 253 aa  291  6e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  59.83 
 
 		 244 aa  291  7e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3710  ABC transporter related  59.92 
 
 		 252 aa  290  1e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.110417 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3860  ABC transporter related  58.26 
 
 		 253 aa  290  2e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3987  ABC transporter related  60 
 
 		 255 aa  290  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.83 
 
 		 252 aa  290  2e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7857  ABC transporter related  58.33 
 
 		 261 aa  289  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.41 
 
 		 252 aa  289  3e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  58.51 
 
 		 246 aa  288  4e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0230  ABC transporter related protein  58.58 
 
 		 253 aa  288  4e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  60.49 
 
 		 245 aa  288  7e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  60.91 
 
 		 245 aa  287  1e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  59 
 
 		 267 aa  287  1e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  59.09 
 
 		 246 aa  286  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  57.56 
 
 		 262 aa  286  2e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  59.92 
 
 		 261 aa  286  2e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  57.56 
 
 		 262 aa  286  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3674  ABC transporter related  59.41 
 
 		 265 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  59.09 
 
 		 254 aa  285  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  59.09 
 
 		 254 aa  285  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  57.14 
 
 		 262 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1247  ABC transporter related protein  60.25 
 
 		 249 aa  285  4e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0795163  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  60.76 
 
 		 247 aa  285  5e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60.74 
 
 		 251 aa  285  5.999999999999999e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1075  ABC transporter  58.58 
 
 		 254 aa  284  7e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.520778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1152  ABC transporter related  61.84 
 
 		 252 aa  285  7e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  59.26 
 
 		 253 aa  284  9e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0519  ABC transporter related  59.35 
 
 		 247 aa  284  9e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1258  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.16 
 
 		 254 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13929  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  60.09 
 
 		 253 aa  283  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  60.42 
 
 		 259 aa  284  1.0000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.08 
 
 		 253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0536  ABC transporter related  58.94 
 
 		 247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  58.75 
 
 		 244 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  59.09 
 
 		 256 aa  282  3.0000000000000004e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  59.21 
 
 		 273 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.67 
 
 		 284 aa  282  3.0000000000000004e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  57.32 
 
 		 242 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  57.89 
 
 		 258 aa  282  4.0000000000000003e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  59.41 
 
 		 242 aa  282  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3332  ABC transporter related  58.44 
 
 		 261 aa  281  5.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1551  ABC transporter related protein  60.42 
 
 		 264 aa  281  5.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.019793 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  56.85 
 
 		 256 aa  281  8.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  56.61 
 
 		 242 aa  280  1e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  57.74 
 
 		 242 aa  280  2e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  59.5 
 
 		 251 aa  280  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4332  ABC transporter related  61.92 
 
 		 258 aa  279  3e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.282174 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6378  ABC transporter related  56.79 
 
 		 273 aa  279  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  56.43 
 
 		 244 aa  279  3e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4427  ABC transporter related  57.56 
 
 		 254 aa  279  4e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120026  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3964  ABC transporter related  61.92 
 
 		 258 aa  279  4e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  58.58 
 
 		 242 aa  278  4e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  58.02 
 
 		 270 aa  278  5e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2987  ABC transporter related  59.41 
 
 		 257 aa  278  8e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715624  normal  0.638101 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1622  ABC transporter related  58.94 
 
 		 252 aa  278  8e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320946  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  57.92 
 
 		 244 aa  277  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2175  ABC transporter related  57.32 
 
 		 260 aa  277  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.240046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  55.6 
 
 		 258 aa  277  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0693  ABC transporter-related protein  60.25 
 
 		 249 aa  277  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.413615  normal  0.685528 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2319  ABC transporter related  57.32 
 
 		 260 aa  277  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  55.6 
 
 		 258 aa  277  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  58.65 
 
 		 247 aa  277  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3597  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.32 
 
 		 260 aa  276  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  57.5 
 
 		 262 aa  276  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  59.15 
 
 		 247 aa  276  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  56.07 
 
 		 249 aa  276  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  56.49 
 
 		 249 aa  276  2e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  54.77 
 
 		 257 aa  276  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  55.65 
 
 		 259 aa  276  3e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  55.88 
 
 		 263 aa  276  3e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.02 
 
 		 269 aa  275  3e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  55.19 
 
 		 257 aa  275  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2327  ABC transporter related  55.6 
 
 		 252 aa  275  4e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4480  ABC transporter related  59.09 
 
 		 266 aa  275  4e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2072  ABC transporter related  59.66 
 
 		 249 aa  275  5e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0159024  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.3 
 
 		 249 aa  275  6e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>