More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0358 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0358  ABC transporter related  100 
 
 		 252 aa  521  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0238  ABC transporter related  85.77 
 
 		 250 aa  434  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.783536  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0244  ABC transporter related  85.77 
 
 		 250 aa  434  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0299  ABC transporter-related protein  84.65 
 
 		 252 aa  425  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1604  ABC transporter related  84.65 
 
 		 247 aa  399  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0403  ABC transporter related  71.07 
 
 		 245 aa  362  3e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_003296  RS00357  ABC transporter ATP-binding protein  70.83 
 
 		 249 aa  342  5e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  60.47 
 
 		 252 aa  311  5.999999999999999e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  62.61 
 
 		 249 aa  308  5.9999999999999995e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  61.32 
 
 		 244 aa  301  7.000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4546  ABC transporter related  61.25 
 
 		 260 aa  301  9e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.0112462 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  61.41 
 
 		 244 aa  298  5e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  63.4 
 
 		 245 aa  298  6e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4480  ABC transporter related  60.83 
 
 		 266 aa  298  7e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  57.54 
 
 		 253 aa  297  1e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  60.92 
 
 		 240 aa  297  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  59.92 
 
 		 249 aa  297  1e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  61.25 
 
 		 247 aa  296  2e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  58.68 
 
 		 244 aa  296  2e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  61 
 
 		 244 aa  295  5e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  59.58 
 
 		 246 aa  292  3e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  57.2 
 
 		 253 aa  292  3e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3860  ABC transporter related  57.31 
 
 		 253 aa  292  4e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  58.8 
 
 		 273 aa  291  5e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.92 
 
 		 284 aa  291  6e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  59.18 
 
 		 246 aa  291  6e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  59.75 
 
 		 242 aa  291  7e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.54 
 
 		 253 aa  291  9e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  62.23 
 
 		 258 aa  290  1e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  57.98 
 
 		 242 aa  290  1e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  61.25 
 
 		 250 aa  290  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  61.7 
 
 		 245 aa  289  2e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3964  ABC transporter related  60.25 
 
 		 258 aa  289  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  56.52 
 
 		 253 aa  290  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  59.66 
 
 		 242 aa  290  2e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4332  ABC transporter related  60.25 
 
 		 258 aa  289  3e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.282174 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0519  ABC transporter related  59.75 
 
 		 247 aa  289  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  60.83 
 
 		 257 aa  288  6e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  58.37 
 
 		 243 aa  288  7e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1395  ABC transporter related  59.11 
 
 		 251 aa  288  8e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  58.75 
 
 		 253 aa  287  9e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1622  ABC transporter related  59.92 
 
 		 252 aa  287  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320946  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0536  ABC transporter related  59.34 
 
 		 247 aa  287  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  58.68 
 
 		 262 aa  286  2e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  60.42 
 
 		 248 aa  286  2e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  58.82 
 
 		 242 aa  286  2e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  57.98 
 
 		 242 aa  286  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  58.8 
 
 		 242 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0230  ABC transporter related protein  58.33 
 
 		 253 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4441  ABC transporter related  59.5 
 
 		 255 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103673 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5082  ABC transporter related  59.41 
 
 		 244 aa  286  2.9999999999999996e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.27733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  60.89 
 
 		 243 aa  285  4e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  57.44 
 
 		 244 aa  285  4e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  57.94 
 
 		 243 aa  285  5e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  58.02 
 
 		 244 aa  285  7e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3987  ABC transporter related  57.5 
 
 		 255 aa  285  7e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  59.58 
 
 		 247 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  57.68 
 
 		 262 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  55.88 
 
 		 240 aa  284  1.0000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  60.17 
 
 		 242 aa  283  1.0000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  56.57 
 
 		 254 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  56.57 
 
 		 254 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  57.98 
 
 		 241 aa  283  1.0000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  57.68 
 
 		 262 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  58.33 
 
 		 267 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3757  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.35 
 
 		 252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0539181  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4592  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.35 
 
 		 252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3710  ABC transporter related  57.5 
 
 		 252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.110417 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  58.82 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  57.51 
 
 		 243 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  59.24 
 
 		 242 aa  282  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  58.4 
 
 		 242 aa  282  3.0000000000000004e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  57.26 
 
 		 262 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.58 
 
 		 251 aa  282  4.0000000000000003e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  55.46 
 
 		 247 aa  282  4.0000000000000003e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1849  ABC transporter related  54.92 
 
 		 251 aa  282  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  58.1 
 
 		 256 aa  282  4.0000000000000003e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  60.87 
 
 		 244 aa  281  5.000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0985  ABC transporter related  56.85 
 
 		 247 aa  281  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.178128 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  57.5 
 
 		 252 aa  281  6.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0917  ABC transporter related  58.72 
 
 		 240 aa  281  6.000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.834023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  58.33 
 
 		 249 aa  281  6.000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.35 
 
 		 252 aa  281  7.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.95 
 
 		 252 aa  281  7.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0834  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  56.97 
 
 		 249 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60.94 
 
 		 257 aa  281  8.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  59.75 
 
 		 243 aa  281  8.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2223  amino acid permease ATP-binding protein  59.17 
 
 		 251 aa  281  8.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4395  ABC transporter related  58.09 
 
 		 243 aa  281  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0223537  normal  0.50723 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  56.4 
 
 		 253 aa  281  9e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1247  ABC transporter related protein  61 
 
 		 249 aa  280  1e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0795163  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  57.56 
 
 		 240 aa  280  1e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2327  ABC transporter related  56.15 
 
 		 252 aa  281  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  60.08 
 
 		 251 aa  280  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  58.33 
 
 		 242 aa  280  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  60.09 
 
 		 251 aa  280  1e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  60 
 
 		 248 aa  280  1e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  57.92 
 
 		 251 aa  280  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  58.4 
 
 		 240 aa  280  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2139  ABC transporter-related protein  58.85 
 
 		 251 aa  280  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>