More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0403 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0403  ABC transporter related  100 
 
 		 245 aa  495  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_003296  RS00357  ABC transporter ATP-binding protein  80.25 
 
 		 249 aa  394  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0299  ABC transporter-related protein  73.44 
 
 		 252 aa  365  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0358  ABC transporter related  71.07 
 
 		 252 aa  362  3e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0238  ABC transporter related  70.49 
 
 		 250 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.783536  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0244  ABC transporter related  70.49 
 
 		 250 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1604  ABC transporter related  74.58 
 
 		 247 aa  340  1e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  64.61 
 
 		 249 aa  334  7e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3757  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.83 
 
 		 252 aa  315  5e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0539181  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4592  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.83 
 
 		 252 aa  315  5e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  64.2 
 
 		 252 aa  315  6e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  61 
 
 		 253 aa  314  9.999999999999999e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  61.41 
 
 		 267 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.41 
 
 		 252 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3674  ABC transporter related  62.5 
 
 		 265 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3710  ABC transporter related  61 
 
 		 252 aa  312  2.9999999999999996e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.110417 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.41 
 
 		 252 aa  312  2.9999999999999996e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  62.08 
 
 		 244 aa  312  3.9999999999999997e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0230  ABC transporter related protein  60.58 
 
 		 253 aa  311  5.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  59.84 
 
 		 253 aa  311  9e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03129  predicted amino-acid transporter subunit  61 
 
 		 252 aa  310  1e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0435  ABC transporter related protein  61 
 
 		 252 aa  310  1e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0435  ABC transporter related  61 
 
 		 252 aa  310  1e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.337414 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3860  ABC transporter related  60.25 
 
 		 253 aa  310  1e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3466  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61 
 
 		 252 aa  310  1e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0172997  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03080  hypothetical protein  61 
 
 		 252 aa  310  1e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  59.58 
 
 		 258 aa  308  5e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  59.58 
 
 		 258 aa  308  5e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  60.49 
 
 		 244 aa  308  5e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  59.75 
 
 		 253 aa  308  5.9999999999999995e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  61.22 
 
 		 249 aa  307  8e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  61.63 
 
 		 245 aa  307  9e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  60.82 
 
 		 273 aa  307  9e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  60.83 
 
 		 239 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  59.41 
 
 		 262 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  59.41 
 
 		 262 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  61.28 
 
 		 256 aa  306  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  60.98 
 
 		 258 aa  306  3e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7857  ABC transporter related  60.58 
 
 		 261 aa  305  3e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6378  ABC transporter related  60 
 
 		 273 aa  305  3e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  59 
 
 		 262 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60 
 
 		 269 aa  305  6e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0976  ABC transporter-like  59.34 
 
 		 254 aa  304  7e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  59.17 
 
 		 257 aa  304  9.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  58.75 
 
 		 257 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60 
 
 		 249 aa  304  1.0000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  59.34 
 
 		 242 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  59.09 
 
 		 253 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0907  ABC transporter related  59.34 
 
 		 254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  61.22 
 
 		 245 aa  302  3.0000000000000004e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  59.92 
 
 		 246 aa  302  3.0000000000000004e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1300  general amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.92 
 
 		 254 aa  301  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  60.08 
 
 		 246 aa  301  5.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4425  ABC transporter related  58.92 
 
 		 254 aa  301  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.329357 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4549  ABC transporter related  58.92 
 
 		 254 aa  301  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1152  ABC transporter related  61.48 
 
 		 252 aa  301  6.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  58.16 
 
 		 263 aa  300  1e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2139  ABC transporter-related protein  61.45 
 
 		 251 aa  300  1e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2846  ABC transporter related  60.42 
 
 		 251 aa  299  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.92934  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2552  ABC transporter related  60.25 
 
 		 245 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221216  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1075  ABC transporter related  59.43 
 
 		 250 aa  300  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  57.92 
 
 		 243 aa  300  2e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  57.26 
 
 		 249 aa  300  2e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0519  ABC transporter related  60.66 
 
 		 247 aa  299  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  57.26 
 
 		 249 aa  299  3e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  58.75 
 
 		 269 aa  298  4e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  58.92 
 
 		 253 aa  298  4e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  57.26 
 
 		 249 aa  298  5e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  59.09 
 
 		 244 aa  298  5e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  59.26 
 
 		 247 aa  298  5e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  58.75 
 
 		 267 aa  298  6e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0536  ABC transporter related  60.25 
 
 		 247 aa  298  6e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  60.17 
 
 		 246 aa  297  8e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  59.17 
 
 		 240 aa  297  8e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1526  ABC transporter, ATPase subunit  60 
 
 		 247 aa  297  9e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  59.09 
 
 		 246 aa  297  9e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1075  ABC transporter  58.51 
 
 		 254 aa  297  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.520778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  57.32 
 
 		 258 aa  296  1e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.5 
 
 		 284 aa  296  1e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3332  ABC transporter related  59.84 
 
 		 261 aa  297  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2987  ABC transporter related  61.67 
 
 		 257 aa  297  1e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715624  normal  0.638101 
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.09 
 
 		 253 aa  296  2e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1258  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.09 
 
 		 254 aa  296  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13929  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  57.5 
 
 		 243 aa  296  2e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  57.26 
 
 		 242 aa  296  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  58.75 
 
 		 246 aa  296  2e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2327  ABC transporter related  58.26 
 
 		 252 aa  296  2e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  59.75 
 
 		 248 aa  295  4e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0796  ABC transporter related  58.16 
 
 		 257 aa  295  4e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0985  ABC transporter related  58.68 
 
 		 247 aa  295  5e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.178128 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3987  ABC transporter related  58.92 
 
 		 255 aa  295  5e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  56.43 
 
 		 259 aa  295  6e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  57.02 
 
 		 255 aa  295  6e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3950  AABC amino acid transporter, ATPase subunit  57.5 
 
 		 250 aa  294  8e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  59.26 
 
 		 247 aa  294  1e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  57.08 
 
 		 243 aa  294  1e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  56.38 
 
 		 246 aa  293  2e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  58.02 
 
 		 247 aa  293  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1702  ABC transporter related  59.26 
 
 		 253 aa  292  3e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.478201 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1741  ABC transporter related  59.75 
 
 		 267 aa  292  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>