More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1604 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1604  ABC transporter related  100 
 
 		 247 aa  508  1e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0299  ABC transporter-related protein  86.01 
 
 		 252 aa  429  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0238  ABC transporter related  85.48 
 
 		 250 aa  426  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.783536  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0244  ABC transporter related  85.48 
 
 		 250 aa  426  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0358  ABC transporter related  84.3 
 
 		 252 aa  422  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0403  ABC transporter related  74.58 
 
 		 245 aa  364  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_003296  RS00357  ABC transporter ATP-binding protein  72.5 
 
 		 249 aa  345  3e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  63.37 
 
 		 252 aa  309  2.9999999999999997e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  59.18 
 
 		 249 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  60.42 
 
 		 246 aa  301  4.0000000000000003e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  61.92 
 
 		 246 aa  298  4e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0985  ABC transporter related  59.75 
 
 		 247 aa  298  8e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.178128 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  62.08 
 
 		 249 aa  296  2e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  60.42 
 
 		 244 aa  296  3e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  58.78 
 
 		 253 aa  295  4e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60 
 
 		 284 aa  294  1e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  60.58 
 
 		 244 aa  292  4e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1247  ABC transporter related protein  61.48 
 
 		 249 aa  291  6e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0795163  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.78 
 
 		 253 aa  290  1e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  60.42 
 
 		 247 aa  290  2e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0519  ABC transporter related  60.58 
 
 		 247 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  59.66 
 
 		 242 aa  290  2e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  59.34 
 
 		 244 aa  290  2e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  62.34 
 
 		 245 aa  288  4e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0536  ABC transporter related  60.17 
 
 		 247 aa  288  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  58.87 
 
 		 262 aa  287  1e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  60.42 
 
 		 259 aa  287  1e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  58.87 
 
 		 262 aa  287  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  62.08 
 
 		 248 aa  286  2e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  58.44 
 
 		 262 aa  286  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4395  ABC transporter related  59.75 
 
 		 243 aa  286  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0223537  normal  0.50723 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03129  predicted amino-acid transporter subunit  57.56 
 
 		 252 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0435  ABC transporter related protein  57.56 
 
 		 252 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0435  ABC transporter related  57.56 
 
 		 252 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.337414 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3466  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.56 
 
 		 252 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0172997  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  58.01 
 
 		 263 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03080  hypothetical protein  57.56 
 
 		 252 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  57.92 
 
 		 253 aa  285  4e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  57.98 
 
 		 242 aa  285  4e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3987  ABC transporter related  58.75 
 
 		 255 aa  285  5e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2327  ABC transporter related  55.28 
 
 		 252 aa  285  5e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  58.55 
 
 		 240 aa  285  5e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2001  ABC transporter related  59.83 
 
 		 258 aa  285  5.999999999999999e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.56 
 
 		 252 aa  285  5.999999999999999e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  58.68 
 
 		 242 aa  285  7e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1395  ABC transporter related  61.22 
 
 		 251 aa  285  7e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4592  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.56 
 
 		 252 aa  284  7e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3757  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.56 
 
 		 252 aa  284  7e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0539181  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  57.14 
 
 		 242 aa  284  9e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  58.85 
 
 		 254 aa  284  9e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  58.85 
 
 		 254 aa  284  9e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  57.98 
 
 		 267 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  57.98 
 
 		 253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  58.51 
 
 		 244 aa  283  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  57.92 
 
 		 253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60 
 
 		 251 aa  283  2.0000000000000002e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  60 
 
 		 250 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  60.42 
 
 		 257 aa  283  2.0000000000000002e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.14 
 
 		 252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0796  ABC transporter related  58.87 
 
 		 257 aa  283  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4546  ABC transporter related  58.33 
 
 		 260 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.0112462 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7857  ABC transporter related  57.92 
 
 		 261 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  58.09 
 
 		 244 aa  282  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2139  ABC transporter-related protein  60.49 
 
 		 251 aa  281  5.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0230  ABC transporter related protein  57.56 
 
 		 253 aa  281  6.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  57.74 
 
 		 253 aa  281  7.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1622  ABC transporter related  60.5 
 
 		 252 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320946  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1300  general amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.44 
 
 		 254 aa  280  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4425  ABC transporter related  57.44 
 
 		 254 aa  280  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.329357 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4549  ABC transporter related  57.44 
 
 		 254 aa  280  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0907  ABC transporter related  57.44 
 
 		 254 aa  280  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  59.23 
 
 		 258 aa  280  1e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  58.09 
 
 		 244 aa  280  1e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  57.98 
 
 		 242 aa  280  1e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.44 
 
 		 269 aa  280  1e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.44 
 
 		 249 aa  280  2e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0976  ABC transporter-like  57.02 
 
 		 254 aa  280  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  57.14 
 
 		 242 aa  280  2e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  59 
 
 		 242 aa  279  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  58.01 
 
 		 256 aa  279  3e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3860  ABC transporter related  57.14 
 
 		 253 aa  279  3e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  61.04 
 
 		 245 aa  279  3e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4480  ABC transporter related  57.92 
 
 		 266 aa  279  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4427  ABC transporter related  58.82 
 
 		 254 aa  279  3e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120026  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  54.62 
 
 		 240 aa  279  3e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  57.14 
 
 		 242 aa  279  3e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  55.65 
 
 		 240 aa  279  3e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  58.09 
 
 		 244 aa  278  4e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3964  ABC transporter related  59 
 
 		 258 aa  278  5e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  57.14 
 
 		 267 aa  278  5e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  57.14 
 
 		 240 aa  278  6e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0834  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  57.32 
 
 		 249 aa  278  6e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  58.87 
 
 		 246 aa  278  6e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2846  ABC transporter related  60.09 
 
 		 251 aa  278  7e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.92934  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4332  ABC transporter related  59 
 
 		 258 aa  278  7e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.282174 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  57.96 
 
 		 262 aa  278  7e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  58.75 
 
 		 247 aa  277  1e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  57.92 
 
 		 270 aa  277  1e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1152  ABC transporter related  59.17 
 
 		 252 aa  277  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  59.21 
 
 		 243 aa  277  1e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>