More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0417 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 253 aa  518  1e-146  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  95.26 
 
 		 253 aa  499  1e-140  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  95.65 
 
 		 284 aa  499  1e-140  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  67.92 
 
 		 249 aa  335  5e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  67.5 
 
 		 240 aa  332  3e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.55 
 
 		 269 aa  331  6e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  64.14 
 
 		 253 aa  331  6e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  64.78 
 
 		 252 aa  331  6e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  66.11 
 
 		 239 aa  331  7.000000000000001e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.9 
 
 		 249 aa  327  9e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  62.15 
 
 		 269 aa  327  9e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  62.8 
 
 		 257 aa  323  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  62.65 
 
 		 253 aa  323  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  66.11 
 
 		 262 aa  323  2e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  67.36 
 
 		 246 aa  323  2e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6378  ABC transporter related  64.58 
 
 		 273 aa  323  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2758  ABC transporter related  63.49 
 
 		 252 aa  323  2e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  66.11 
 
 		 262 aa  323  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  62.7 
 
 		 246 aa  322  5e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  62.5 
 
 		 258 aa  321  6e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  62.4 
 
 		 257 aa  321  6e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  63.07 
 
 		 245 aa  321  7e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4510  ABC transporter related  63.05 
 
 		 266 aa  321  8e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00592633  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1343  ABC transporter related  65.7 
 
 		 246 aa  321  9.000000000000001e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2552  ABC transporter related  63.22 
 
 		 245 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221216  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  63.11 
 
 		 246 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  62.6 
 
 		 273 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  64.34 
 
 		 246 aa  320  9.999999999999999e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  63.33 
 
 		 258 aa  319  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  63.33 
 
 		 258 aa  319  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1959  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.2 
 
 		 251 aa  319  1.9999999999999998e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0443525  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  64.17 
 
 		 246 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  66.67 
 
 		 243 aa  319  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  65.45 
 
 		 247 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  64.85 
 
 		 262 aa  319  3e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  63.11 
 
 		 246 aa  319  3e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  62.4 
 
 		 244 aa  319  3e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1300  general amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.24 
 
 		 254 aa  318  5e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4549  ABC transporter related  60.24 
 
 		 254 aa  318  5e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4425  ABC transporter related  60.24 
 
 		 254 aa  318  5e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.329357 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0907  ABC transporter related  60.24 
 
 		 254 aa  318  6e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  65.31 
 
 		 255 aa  318  6e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  65.16 
 
 		 246 aa  318  7e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  61.72 
 
 		 256 aa  318  7e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  63.22 
 
 		 267 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3987  ABC transporter related  61.79 
 
 		 255 aa  317  2e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  63.49 
 
 		 247 aa  316  2e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1885  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.8 
 
 		 251 aa  316  2e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00643068  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1075  ABC transporter  62.24 
 
 		 254 aa  316  3e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.520778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0976  ABC transporter-like  59.84 
 
 		 254 aa  316  3e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4870  ABC transporter related  61.38 
 
 		 256 aa  315  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.933928  normal  0.605559 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  63.33 
 
 		 267 aa  316  3e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  65.29 
 
 		 248 aa  315  4e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  62.75 
 
 		 257 aa  315  4e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  62.08 
 
 		 242 aa  315  4e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1258  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.83 
 
 		 254 aa  315  5e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13929  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  65.45 
 
 		 248 aa  315  5e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0055  general L-amino acid transport ATP-binding protein  63.33 
 
 		 268 aa  315  6e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  61.41 
 
 		 245 aa  315  7e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  62.5 
 
 		 240 aa  314  7e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  62.55 
 
 		 262 aa  314  8e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0796  ABC transporter related  63.67 
 
 		 257 aa  314  9.999999999999999e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  63.64 
 
 		 242 aa  313  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  62.81 
 
 		 242 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  60.96 
 
 		 253 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  64.63 
 
 		 248 aa  311  3.9999999999999997e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.83 
 
 		 252 aa  311  4.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0230  ABC transporter related protein  60.96 
 
 		 253 aa  311  6.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03129  predicted amino-acid transporter subunit  61.83 
 
 		 252 aa  311  7.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0435  ABC transporter related protein  61.83 
 
 		 252 aa  311  7.999999999999999e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03080  hypothetical protein  61.83 
 
 		 252 aa  311  7.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0435  ABC transporter related  61.83 
 
 		 252 aa  311  7.999999999999999e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.337414 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3466  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.83 
 
 		 252 aa  311  7.999999999999999e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0172997  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  61.79 
 
 		 258 aa  311  9e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  60.74 
 
 		 244 aa  311  9e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1526  ABC transporter, ATPase subunit  61.83 
 
 		 247 aa  310  1e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3991  ABC transporter related  62.5 
 
 		 261 aa  310  1e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  61.04 
 
 		 252 aa  310  1e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  60.58 
 
 		 242 aa  310  1e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  63.33 
 
 		 240 aa  309  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  62.66 
 
 		 247 aa  310  2e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4592  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.83 
 
 		 252 aa  310  2e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0519  ABC transporter related  63.64 
 
 		 247 aa  309  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2020  ABC transporter related  65.57 
 
 		 246 aa  310  2e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3757  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.83 
 
 		 252 aa  310  2e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0539181  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  62.5 
 
 		 240 aa  309  2e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3950  AABC amino acid transporter, ATPase subunit  59.11 
 
 		 250 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  60.91 
 
 		 244 aa  309  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  59.92 
 
 		 253 aa  309  2.9999999999999997e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  60.91 
 
 		 254 aa  308  4e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  60.91 
 
 		 254 aa  308  4e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0985  ABC transporter related  62.7 
 
 		 247 aa  308  4e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.178128 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  58.27 
 
 		 259 aa  308  5.9999999999999995e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.41 
 
 		 252 aa  308  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  62.5 
 
 		 242 aa  308  5.9999999999999995e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  58.47 
 
 		 249 aa  308  6.999999999999999e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  62.96 
 
 		 243 aa  308  6.999999999999999e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0536  ABC transporter related  63.22 
 
 		 247 aa  308  6.999999999999999e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  60 
 
 		 261 aa  308  6.999999999999999e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  60.74 
 
 		 247 aa  308  8e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>