More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1225 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  100 
 
 		 244 aa  491  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3519  ABC transporter related  81.97 
 
 		 244 aa  410  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1247  ABC transporter related protein  71.9 
 
 		 249 aa  360  8e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0795163  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  71.07 
 
 		 258 aa  360  1e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  70.78 
 
 		 252 aa  357  7e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1395  ABC transporter related  71.6 
 
 		 251 aa  357  9.999999999999999e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  70.25 
 
 		 251 aa  355  3.9999999999999996e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  71.49 
 
 		 257 aa  355  5e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  70.78 
 
 		 248 aa  354  5.999999999999999e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  71.19 
 
 		 257 aa  354  5.999999999999999e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  70.37 
 
 		 262 aa  352  2e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  68.72 
 
 		 261 aa  352  2e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  69.14 
 
 		 259 aa  351  5e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1551  ABC transporter related protein  71.19 
 
 		 264 aa  351  5.9999999999999994e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.019793 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  69.55 
 
 		 247 aa  350  1e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  69.96 
 
 		 247 aa  348  3e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3987  ABC transporter related  68.31 
 
 		 255 aa  349  3e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  69.96 
 
 		 250 aa  345  5e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  66.8 
 
 		 254 aa  343  2e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2223  amino acid permease ATP-binding protein  67.49 
 
 		 251 aa  343  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  66.67 
 
 		 270 aa  343  2e-93  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  66.8 
 
 		 254 aa  343  2e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  69.42 
 
 		 242 aa  343  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15420  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  68.44 
 
 		 274 aa  342  2.9999999999999997e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0145582  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22740  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  66.94 
 
 		 264 aa  340  1e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547683  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  66.94 
 
 		 242 aa  340  2e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  68.31 
 
 		 251 aa  338  4e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  65.7 
 
 		 242 aa  337  9.999999999999999e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  66.26 
 
 		 251 aa  336  1.9999999999999998e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0020  amino acid ABC transporter ATPase  66.26 
 
 		 256 aa  333  2e-90  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.732673  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  65.57 
 
 		 244 aa  332  4e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  64.61 
 
 		 256 aa  332  4e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3286  ABC transporter related protein  70.37 
 
 		 280 aa  332  5e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00174942  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2428  ABC transporter-related protein  65.16 
 
 		 264 aa  321  8e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419191  normal  0.0707207 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  61.16 
 
 		 242 aa  311  9e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  61.07 
 
 		 252 aa  309  2.9999999999999997e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  59.5 
 
 		 242 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  61.07 
 
 		 244 aa  304  7e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  61.57 
 
 		 245 aa  303  1.0000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30090  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  64.46 
 
 		 252 aa  303  1.0000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0358  ABC transporter related  61.41 
 
 		 252 aa  298  5e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  58.92 
 
 		 251 aa  296  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  59.75 
 
 		 253 aa  296  2e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.5 
 
 		 240 aa  295  4e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0299  ABC transporter-related protein  60.42 
 
 		 252 aa  295  4e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  59.5 
 
 		 245 aa  295  6e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  58.68 
 
 		 265 aa  295  6e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.75 
 
 		 253 aa  294  7e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  59.34 
 
 		 244 aa  294  8e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2981  ABC transporter related  60.91 
 
 		 245 aa  293  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.5 
 
 		 240 aa  293  1e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.92 
 
 		 240 aa  293  2e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.92 
 
 		 240 aa  293  2e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.92 
 
 		 240 aa  293  2e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  59.35 
 
 		 256 aa  293  2e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.92 
 
 		 240 aa  293  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2139  ABC transporter-related protein  61.04 
 
 		 251 aa  293  2e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.92 
 
 		 240 aa  292  3e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.5 
 
 		 240 aa  292  3e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  55.83 
 
 		 242 aa  292  3e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  57.92 
 
 		 259 aa  292  3e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.58 
 
 		 284 aa  292  4e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  59.09 
 
 		 244 aa  291  5e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  57.02 
 
 		 242 aa  291  7e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  60 
 
 		 246 aa  291  7e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5947  ABC transporter related  58.75 
 
 		 254 aa  291  8e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0218631 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  57.92 
 
 		 253 aa  290  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.5 
 
 		 240 aa  290  1e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.58 
 
 		 240 aa  290  1e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  56.02 
 
 		 246 aa  290  1e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0238  ABC transporter related  59.17 
 
 		 250 aa  290  2e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.783536  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  58.44 
 
 		 243 aa  289  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2327  ABC transporter related  56.56 
 
 		 252 aa  290  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  55 
 
 		 240 aa  290  2e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  58.26 
 
 		 253 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0244  ABC transporter related  59.17 
 
 		 250 aa  290  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  59.18 
 
 		 248 aa  289  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7087  ABC transporter related  58.75 
 
 		 254 aa  289  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  57.68 
 
 		 247 aa  289  3e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  57.5 
 
 		 253 aa  288  4e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  57.92 
 
 		 249 aa  288  4e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3860  ABC transporter related  57.5 
 
 		 253 aa  288  4e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  59.67 
 
 		 243 aa  288  4e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  55.79 
 
 		 246 aa  288  5.0000000000000004e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0230  ABC transporter related protein  57.5 
 
 		 253 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3991  ABC transporter related  54.96 
 
 		 261 aa  288  7e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  59.17 
 
 		 240 aa  287  1e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  56.25 
 
 		 240 aa  287  1e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  57.85 
 
 		 241 aa  287  1e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4546  ABC transporter related  58.44 
 
 		 260 aa  286  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.0112462 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2758  ABC transporter related  56.85 
 
 		 252 aa  286  2e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  57.61 
 
 		 243 aa  286  2e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4480  ABC transporter related  58.85 
 
 		 266 aa  286  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0435  ABC transporter related protein  57.92 
 
 		 252 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3597  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.67 
 
 		 260 aa  285  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345291  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  57.26 
 
 		 246 aa  286  2.9999999999999996e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03080  hypothetical protein  57.92 
 
 		 252 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1343  ABC transporter related  57.68 
 
 		 246 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  56.85 
 
 		 244 aa  285  2.9999999999999996e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2175  ABC transporter related  56.67 
 
 		 260 aa  285  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.240046  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>