More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0817 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  100 
 
 		 244 aa  501  1e-141  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  66.94 
 
 		 243 aa  347  7e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  65.7 
 
 		 247 aa  342  4e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  66.12 
 
 		 243 aa  338  2.9999999999999998e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  64.46 
 
 		 243 aa  336  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  66.8 
 
 		 242 aa  333  2e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  65.56 
 
 		 242 aa  329  3e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  61.25 
 
 		 242 aa  328  7e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  62.24 
 
 		 242 aa  327  8e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  60.42 
 
 		 242 aa  324  8.000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  62.92 
 
 		 241 aa  322  2e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2585  ABC transporter related  61.41 
 
 		 244 aa  322  5e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  59.58 
 
 		 242 aa  321  7e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2072  ABC transporter related  62.4 
 
 		 249 aa  319  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0159024  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0693  ABC transporter-related protein  61.98 
 
 		 249 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.413615  normal  0.685528 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  62.24 
 
 		 244 aa  319  3e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2465  ABC transporter related  62.4 
 
 		 249 aa  318  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  62.39 
 
 		 249 aa  318  3.9999999999999996e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  60 
 
 		 242 aa  318  3.9999999999999996e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9237  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  63.18 
 
 		 242 aa  318  6e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185509  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  62.5 
 
 		 245 aa  317  1e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  62.92 
 
 		 245 aa  317  1e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  61.54 
 
 		 259 aa  316  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  61.25 
 
 		 248 aa  314  8e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2260  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  61.57 
 
 		 249 aa  313  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.334703  normal  0.463936 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1832  ABC transporter related  63.33 
 
 		 242 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0351546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  62.5 
 
 		 244 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  61.41 
 
 		 243 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  61.25 
 
 		 248 aa  312  2.9999999999999996e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_004310  BR1959  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.43 
 
 		 251 aa  312  3.9999999999999997e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0443525  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  63.25 
 
 		 246 aa  311  3.9999999999999997e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  59.41 
 
 		 267 aa  312  3.9999999999999997e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  63.25 
 
 		 246 aa  311  4.999999999999999e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  59.34 
 
 		 251 aa  311  4.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  61.25 
 
 		 248 aa  311  6.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  61.41 
 
 		 243 aa  310  9e-84  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  60.58 
 
 		 262 aa  310  1e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60 
 
 		 252 aa  308  2.9999999999999997e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  61.67 
 
 		 254 aa  309  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  61.67 
 
 		 254 aa  309  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  61.67 
 
 		 242 aa  309  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1885  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60 
 
 		 251 aa  309  2.9999999999999997e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00643068  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  57.79 
 
 		 265 aa  308  2.9999999999999997e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  62.98 
 
 		 257 aa  308  4e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  58.33 
 
 		 246 aa  308  5e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2913  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  58.09 
 
 		 245 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  60.42 
 
 		 242 aa  307  8e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  59.17 
 
 		 253 aa  307  8e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.83 
 
 		 240 aa  306  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  60.58 
 
 		 243 aa  306  1.0000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3710  ABC transporter related  59.17 
 
 		 252 aa  306  1.0000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.110417 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  61 
 
 		 252 aa  307  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  60.49 
 
 		 243 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  59 
 
 		 262 aa  305  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  59 
 
 		 262 aa  305  3e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  59.17 
 
 		 246 aa  306  3e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  58.09 
 
 		 246 aa  306  3e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4592  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.58 
 
 		 252 aa  306  3e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3757  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.58 
 
 		 252 aa  306  3e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0539181  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.33 
 
 		 244 aa  305  4.0000000000000004e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0447  amino acid transporter ATP-binding protein  60.58 
 
 		 248 aa  305  4.0000000000000004e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  59.75 
 
 		 251 aa  305  4.0000000000000004e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  59 
 
 		 258 aa  305  4.0000000000000004e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1152  ABC transporter related  58.75 
 
 		 252 aa  305  4.0000000000000004e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03129  predicted amino-acid transporter subunit  59.17 
 
 		 252 aa  305  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0435  ABC transporter related protein  59.17 
 
 		 252 aa  305  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3466  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.17 
 
 		 252 aa  305  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0172997  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03080  hypothetical protein  59.17 
 
 		 252 aa  305  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0435  ABC transporter related  59.17 
 
 		 252 aa  305  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.337414 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.16 
 
 		 269 aa  305  5.0000000000000004e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2987  ABC transporter related  61.83 
 
 		 257 aa  305  5.0000000000000004e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715624  normal  0.638101 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.17 
 
 		 252 aa  305  6e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  57.68 
 
 		 242 aa  305  6e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  59.75 
 
 		 243 aa  304  7e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  58.02 
 
 		 243 aa  304  7e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  59 
 
 		 263 aa  304  7e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  58.33 
 
 		 253 aa  304  8.000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1075  ABC transporter  58.33 
 
 		 254 aa  304  9.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.520778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  58.58 
 
 		 256 aa  304  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1598  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  59.83 
 
 		 240 aa  303  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.842708  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1493  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  59.83 
 
 		 240 aa  303  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.228694  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  58.75 
 
 		 246 aa  303  1.0000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1820  ABC transporter related  60.08 
 
 		 248 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.34 
 
 		 257 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  60.25 
 
 		 249 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.16 
 
 		 249 aa  303  2.0000000000000002e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1258  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.92 
 
 		 254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13929  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  58.51 
 
 		 259 aa  303  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0230  ABC transporter related protein  58.33 
 
 		 253 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  58.16 
 
 		 262 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4395  ABC transporter related  60.49 
 
 		 243 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0223537  normal  0.50723 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  59.34 
 
 		 242 aa  303  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  58.33 
 
 		 246 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  60.83 
 
 		 241 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  58.75 
 
 		 240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  59.17 
 
 		 255 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  57.92 
 
 		 240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  59.17 
 
 		 247 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  59.58 
 
 		 244 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4510  ABC transporter related  59 
 
 		 266 aa  302  3.0000000000000004e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00592633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>