More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0545 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  100 
 
 		 244 aa  498  1e-140  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0726  ABC transporter related  70.78 
 
 		 247 aa  372  1e-102  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000170097  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0629  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  65.16 
 
 		 244 aa  341  5.999999999999999e-93  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  65.57 
 
 		 244 aa  326  3e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.02 
 
 		 244 aa  325  5e-88  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.61 
 
 		 240 aa  323  1e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  64.61 
 
 		 240 aa  323  2e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  62.24 
 
 		 240 aa  317  7.999999999999999e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  62.66 
 
 		 242 aa  317  7.999999999999999e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  62.66 
 
 		 242 aa  317  7.999999999999999e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  63.79 
 
 		 244 aa  317  2e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  61.98 
 
 		 242 aa  315  5e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  63.37 
 
 		 244 aa  315  5e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  62.55 
 
 		 247 aa  313  1.9999999999999998e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  63.9 
 
 		 240 aa  312  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  63.49 
 
 		 240 aa  310  2e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  61 
 
 		 240 aa  310  2e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1427  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  60.17 
 
 		 254 aa  308  4e-83  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.798316  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.83 
 
 		 240 aa  308  5e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  61.83 
 
 		 240 aa  308  5e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.83 
 
 		 240 aa  308  5e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.83 
 
 		 240 aa  308  5e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  61.83 
 
 		 240 aa  308  5e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.41 
 
 		 240 aa  307  8e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  61.83 
 
 		 241 aa  307  8e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  61 
 
 		 240 aa  307  8e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.83 
 
 		 240 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  62.66 
 
 		 239 aa  306  1.0000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  62.66 
 
 		 241 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61 
 
 		 241 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.41 
 
 		 240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  62.24 
 
 		 241 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  62.24 
 
 		 241 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  61 
 
 		 241 aa  306  3e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  62.08 
 
 		 247 aa  305  3e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  61 
 
 		 241 aa  306  3e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  62.24 
 
 		 241 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61 
 
 		 240 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4704  ABC transporter-related protein  61.32 
 
 		 257 aa  305  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.874551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  60.91 
 
 		 240 aa  304  7e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  60.58 
 
 		 241 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  61 
 
 		 240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  60.08 
 
 		 240 aa  302  3.0000000000000004e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3165  ABC transporter related  60.91 
 
 		 257 aa  302  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.127499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  61.41 
 
 		 241 aa  301  6.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  60.42 
 
 		 246 aa  301  6.000000000000001e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  61.41 
 
 		 241 aa  301  7.000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  61 
 
 		 241 aa  301  9e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  58.92 
 
 		 252 aa  300  1e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  61.25 
 
 		 246 aa  300  2e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  60.58 
 
 		 270 aa  299  2e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  61.98 
 
 		 249 aa  300  2e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  58.09 
 
 		 242 aa  299  3e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  62.55 
 
 		 240 aa  298  4e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2021  ABC transporter related  57.85 
 
 		 363 aa  298  7e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0713  ABC transporter related  57.44 
 
 		 363 aa  297  8e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  58.09 
 
 		 246 aa  297  1e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  59.17 
 
 		 247 aa  296  2e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6373  ABC transporter related  58.82 
 
 		 254 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535484  normal  0.530942 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  60.58 
 
 		 240 aa  295  3e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  58.92 
 
 		 240 aa  295  4e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4546  ABC transporter related  58.16 
 
 		 254 aa  295  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.141129 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2063  ABC transporter related  57.92 
 
 		 246 aa  295  6e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0300144  normal  0.143114 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  56.43 
 
 		 240 aa  294  8e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  56.73 
 
 		 242 aa  293  2e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1180  ABC transporter related  57.08 
 
 		 360 aa  293  2e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3103  ABC transporter related  56.67 
 
 		 246 aa  292  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.209111  normal  0.482435 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3458  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  56.67 
 
 		 246 aa  292  3e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  56.43 
 
 		 246 aa  292  3e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7665  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  57.26 
 
 		 255 aa  292  3e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11340  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.17 
 
 		 258 aa  292  4e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.571361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0439  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  58.33 
 
 		 250 aa  292  4e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0501472  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  58.51 
 
 		 240 aa  291  6e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  58.44 
 
 		 252 aa  291  8e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  57.55 
 
 		 244 aa  290  1e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  56.56 
 
 		 244 aa  290  1e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2280  ABC transporter related protein  54.55 
 
 		 274 aa  290  1e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000113339  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  57.79 
 
 		 243 aa  290  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  56.79 
 
 		 256 aa  290  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  58.73 
 
 		 263 aa  289  2e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  57.79 
 
 		 243 aa  289  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  58.09 
 
 		 240 aa  290  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  58.92 
 
 		 240 aa  290  2e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  59.92 
 
 		 242 aa  289  2e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  58.85 
 
 		 244 aa  289  3e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0861  ATPase  56.67 
 
 		 363 aa  288  5.0000000000000004e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1038  ATPase  56.67 
 
 		 363 aa  288  5.0000000000000004e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.396319 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0494  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  56.02 
 
 		 242 aa  288  5.0000000000000004e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  56.2 
 
 		 244 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  58.68 
 
 		 258 aa  288  8e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1234  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  58.92 
 
 		 240 aa  287  9e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  59.09 
 
 		 242 aa  287  1e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  57.68 
 
 		 250 aa  287  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  55.78 
 
 		 273 aa  286  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  56.61 
 
 		 249 aa  286  2e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  57.14 
 
 		 256 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  56.85 
 
 		 244 aa  285  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  56.38 
 
 		 242 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  55.97 
 
 		 242 aa  285  4e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1315  polar amino acid ABC transporter ATPase  56 
 
 		 250 aa  285  4e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.820266  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>