More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_11340 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_11340  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 258 aa  523  1e-148  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.571361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  74.9 
 
 		 244 aa  374  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  66.67 
 
 		 246 aa  347  1e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6988  ABC transporter related  68.75 
 
 		 265 aa  342  2.9999999999999997e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  67.36 
 
 		 251 aa  336  1.9999999999999998e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  66.25 
 
 		 253 aa  332  3e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  67.37 
 
 		 273 aa  330  1e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  65.16 
 
 		 257 aa  328  4e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  66.94 
 
 		 257 aa  328  6e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0959  ABC transporter related  62.86 
 
 		 260 aa  313  1.9999999999999998e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  62.3 
 
 		 249 aa  312  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3136  ABC transporter related  61.73 
 
 		 269 aa  311  9e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2831  ABC transporter related  61.32 
 
 		 262 aa  309  2e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.563862 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  61.16 
 
 		 244 aa  309  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  57.32 
 
 		 242 aa  306  3e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  60.67 
 
 		 244 aa  306  3e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.17 
 
 		 244 aa  305  4.0000000000000004e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  59.83 
 
 		 243 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  60.57 
 
 		 256 aa  305  6e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  59.35 
 
 		 247 aa  303  2.0000000000000002e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  59.26 
 
 		 244 aa  303  2.0000000000000002e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  65.16 
 
 		 273 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  59.41 
 
 		 243 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  60.25 
 
 		 240 aa  302  4.0000000000000003e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  58.58 
 
 		 247 aa  302  4.0000000000000003e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  58.58 
 
 		 240 aa  300  1e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4704  ABC transporter-related protein  61.51 
 
 		 257 aa  300  1e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.874551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  59 
 
 		 239 aa  300  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18720  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  64.26 
 
 		 267 aa  300  2e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  59 
 
 		 243 aa  299  2e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  56.9 
 
 		 242 aa  299  3e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  58.09 
 
 		 242 aa  299  3e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  58.09 
 
 		 242 aa  299  3e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  60.67 
 
 		 244 aa  299  3e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3165  ABC transporter related  60.67 
 
 		 257 aa  299  4e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.127499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  60.67 
 
 		 240 aa  299  4e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  57.74 
 
 		 240 aa  298  4e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  61.09 
 
 		 240 aa  298  6e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  61.09 
 
 		 242 aa  298  8e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  56.9 
 
 		 240 aa  297  1e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.32 
 
 		 240 aa  297  1e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  56.49 
 
 		 240 aa  296  2e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  58.16 
 
 		 246 aa  296  2e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.51 
 
 		 253 aa  296  3e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  57.32 
 
 		 246 aa  296  3e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  56.49 
 
 		 242 aa  295  3e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  56.9 
 
 		 246 aa  296  3e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0726  ABC transporter related  59.58 
 
 		 247 aa  296  3e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000170097  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2758  ABC transporter related  56.22 
 
 		 252 aa  295  4e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  59.41 
 
 		 241 aa  294  9e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  60.33 
 
 		 243 aa  294  9e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.09 
 
 		 284 aa  294  1e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  59.09 
 
 		 244 aa  293  2e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  59.91 
 
 		 248 aa  293  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  59.83 
 
 		 241 aa  293  3e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  59.83 
 
 		 241 aa  293  3e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0685  ABC transporter related  60.98 
 
 		 255 aa  292  3e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.83 
 
 		 241 aa  292  4e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3458  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  60.58 
 
 		 246 aa  292  4e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3103  ABC transporter related  60.58 
 
 		 246 aa  292  4e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.209111  normal  0.482435 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  59.91 
 
 		 248 aa  291  5e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  59.17 
 
 		 244 aa  292  5e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  59 
 
 		 241 aa  291  7e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  59 
 
 		 241 aa  291  7e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  59.41 
 
 		 241 aa  291  8e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2063  ABC transporter related  61 
 
 		 246 aa  291  8e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0300144  normal  0.143114 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  57.32 
 
 		 242 aa  291  9e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  57.26 
 
 		 253 aa  290  1e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  59.83 
 
 		 241 aa  290  1e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1820  ABC transporter related  58.2 
 
 		 248 aa  290  1e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  58.02 
 
 		 249 aa  290  1e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  58.16 
 
 		 247 aa  290  1e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  59.41 
 
 		 245 aa  290  1e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  56.07 
 
 		 242 aa  290  2e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  57.32 
 
 		 242 aa  290  2e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  56.07 
 
 		 249 aa  289  3e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  56.79 
 
 		 246 aa  289  3e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  59 
 
 		 241 aa  288  4e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  58.16 
 
 		 241 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  57.92 
 
 		 244 aa  288  5.0000000000000004e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  59 
 
 		 247 aa  288  5.0000000000000004e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.67 
 
 		 269 aa  288  6e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.9 
 
 		 240 aa  288  8e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.67 
 
 		 249 aa  287  1e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  57.74 
 
 		 247 aa  287  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  57.26 
 
 		 246 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  57.74 
 
 		 252 aa  286  2e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2233  ABC transporter related  57.08 
 
 		 246 aa  286  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.693391  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  58.16 
 
 		 241 aa  286  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  57.74 
 
 		 241 aa  286  2e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  54.81 
 
 		 249 aa  286  2.9999999999999996e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  58.16 
 
 		 241 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  55.28 
 
 		 269 aa  285  4e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  56.43 
 
 		 246 aa  285  5e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  55.97 
 
 		 247 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  57.74 
 
 		 245 aa  284  8e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1801  ABC transporter related  57.44 
 
 		 250 aa  284  8e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0322586 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  58.26 
 
 		 243 aa  284  9e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2182  ABC transporter related  57.44 
 
 		 245 aa  284  9e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857357 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  56.07 
 
 		 242 aa  284  9e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>