More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0959 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0959  ABC transporter related  100 
 
 		 260 aa  530  1e-149  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  72.91 
 
 		 257 aa  377  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  74.9 
 
 		 273 aa  369  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  70.4 
 
 		 253 aa  355  2.9999999999999997e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3136  ABC transporter related  68.92 
 
 		 269 aa  350  2e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2831  ABC transporter related  69.05 
 
 		 262 aa  348  4e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.563862 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  68.57 
 
 		 246 aa  345  6e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6988  ABC transporter related  66.4 
 
 		 265 aa  335  3.9999999999999995e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  65.22 
 
 		 251 aa  331  7.000000000000001e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  65.2 
 
 		 257 aa  330  1e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18720  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  68.57 
 
 		 267 aa  327  8e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  62.5 
 
 		 244 aa  320  9.999999999999999e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0685  ABC transporter related  64.11 
 
 		 255 aa  315  6e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11340  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  62.86 
 
 		 258 aa  313  1.9999999999999998e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.571361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2298  ABC transporter related  58.54 
 
 		 247 aa  305  3e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2233  ABC transporter related  58.3 
 
 		 246 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.693391  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  58.78 
 
 		 242 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  59.43 
 
 		 243 aa  295  4e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  57.96 
 
 		 244 aa  295  4e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  59.43 
 
 		 244 aa  295  6e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  56.73 
 
 		 242 aa  293  2e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  58.61 
 
 		 249 aa  293  3e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  59.84 
 
 		 241 aa  290  1e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7703  ABC transporter related  60.71 
 
 		 264 aa  290  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3014  ABC transporter related  57.26 
 
 		 252 aa  288  5.0000000000000004e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.101758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  59.02 
 
 		 240 aa  288  6e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  56.75 
 
 		 256 aa  288  6e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1801  ABC transporter related  56.92 
 
 		 250 aa  288  8e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0322586 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  57.66 
 
 		 244 aa  288  9e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.45 
 
 		 244 aa  287  1e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1160  polar amino acid ABC transporter ATPase  59.29 
 
 		 254 aa  287  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236932  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.79 
 
 		 241 aa  287  2e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2303  ABC transporter related protein  56.3 
 
 		 246 aa  286  2e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000265903  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4837  ABC transporter related  59.18 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0177235  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  57.79 
 
 		 241 aa  286  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  57.79 
 
 		 241 aa  286  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  58.61 
 
 		 243 aa  286  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  57.14 
 
 		 244 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  59.43 
 
 		 253 aa  285  5.999999999999999e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  55.82 
 
 		 246 aa  285  5.999999999999999e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  57.38 
 
 		 241 aa  285  7e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0599  ABC transporter related protein  56.15 
 
 		 243 aa  285  8e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1059  hypothetical protein  57.09 
 
 		 245 aa  284  8e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  57.79 
 
 		 240 aa  284  8e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2182  ABC transporter related  57.09 
 
 		 245 aa  284  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857357 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  56.56 
 
 		 252 aa  284  1.0000000000000001e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  59.44 
 
 		 258 aa  283  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  58.78 
 
 		 256 aa  283  1.0000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  57.79 
 
 		 241 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  56.45 
 
 		 244 aa  284  1.0000000000000001e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  55.33 
 
 		 246 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1806  ABC transporter related  56.38 
 
 		 248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  57.79 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  54.51 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  59.27 
 
 		 243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1533  ABC transporter related  57.38 
 
 		 246 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534266  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  56.56 
 
 		 240 aa  282  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  57.38 
 
 		 241 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.1 
 
 		 240 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  55.24 
 
 		 244 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  56.2 
 
 		 243 aa  281  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  54.62 
 
 		 246 aa  281  6.000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  54.1 
 
 		 240 aa  280  1e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.74 
 
 		 240 aa  280  1e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4546  ABC transporter related  57.32 
 
 		 260 aa  280  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.0112462 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0468  ABC transporter related  54.92 
 
 		 240 aa  280  2e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3458  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  56.28 
 
 		 246 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.74 
 
 		 240 aa  280  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  56.15 
 
 		 241 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  56.97 
 
 		 242 aa  280  2e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3103  ABC transporter related  56.28 
 
 		 246 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.209111  normal  0.482435 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  56.97 
 
 		 263 aa  280  2e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  56.97 
 
 		 244 aa  280  2e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  56.45 
 
 		 245 aa  280  2e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0085  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  55.19 
 
 		 254 aa  280  2e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000203236  normal  0.523772 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4950  ABC transporter related  58 
 
 		 259 aa  279  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  54.76 
 
 		 251 aa  279  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  55.74 
 
 		 241 aa  279  3e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  55.74 
 
 		 241 aa  279  3e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4480  ABC transporter related  57.72 
 
 		 266 aa  279  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  56.05 
 
 		 245 aa  279  4e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.74 
 
 		 240 aa  278  5e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  55.74 
 
 		 241 aa  278  5e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1438  ABC transporter related  59.27 
 
 		 243 aa  278  5e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3744  ATPase  57.09 
 
 		 247 aa  278  6e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  54.1 
 
 		 242 aa  278  7e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  56.61 
 
 		 243 aa  278  7e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  55.33 
 
 		 247 aa  278  8e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2063  ABC transporter related  56.28 
 
 		 246 aa  278  8e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0300144  normal  0.143114 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  56.13 
 
 		 263 aa  278  8e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.74 
 
 		 240 aa  278  9e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.74 
 
 		 240 aa  278  9e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.74 
 
 		 240 aa  278  9e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.74 
 
 		 240 aa  278  9e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0314  hypothetical protein  55.74 
 
 		 255 aa  277  9e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000509196  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4751  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.5 
 
 		 269 aa  277  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00318924  hitchhiker  0.00202738 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.74 
 
 		 240 aa  277  1e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1820  ABC transporter related  55.24 
 
 		 248 aa  277  1e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2834  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  55.91 
 
 		 268 aa  277  1e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  53.28 
 
 		 242 aa  277  1e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>