More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0599 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0599  ABC transporter related protein  100 
 
 
243 aa  489  1e-137  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2303  ABC transporter related protein  64.58 
 
 
246 aa  328  5.0000000000000004e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000265903  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2233  ABC transporter related  66.25 
 
 
246 aa  328  5.0000000000000004e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.693391  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2298  ABC transporter related  65 
 
 
247 aa  327  1.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1533  ABC transporter related  64.58 
 
 
246 aa  320  9.999999999999999e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534266  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1059  hypothetical protein  64.73 
 
 
245 aa  319  3e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0085  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  61.02 
 
 
254 aa  304  9.000000000000001e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000203236  normal  0.523772 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0750  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  58.75 
 
 
248 aa  297  1e-79  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.23695  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  55.42 
 
 
247 aa  290  2e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  55.79 
 
 
246 aa  288  4e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  54.77 
 
 
257 aa  288  8e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0135  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.55 
 
 
246 aa  286  2e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0181638  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2831  ABC transporter related  56.07 
 
 
262 aa  286  2e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.563862 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  59.05 
 
 
242 aa  285  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0213  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  62.81 
 
 
246 aa  285  2.9999999999999996e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6988  ABC transporter related  54.39 
 
 
265 aa  285  4e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0959  ABC transporter related  56.15 
 
 
260 aa  285  7e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  57.5 
 
 
240 aa  284  9e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.09 
 
 
284 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  55.6 
 
 
249 aa  283  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  56.49 
 
 
244 aa  283  1.0000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  59.05 
 
 
242 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.17 
 
 
273 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.5 
 
 
253 aa  282  3.0000000000000004e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  58.68 
 
 
242 aa  282  3.0000000000000004e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  54.81 
 
 
256 aa  282  4.0000000000000003e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  57.92 
 
 
253 aa  282  4.0000000000000003e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.02 
 
 
244 aa  281  5.000000000000001e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55 
 
 
251 aa  281  7.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  56.25 
 
 
240 aa  280  1e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3136  ABC transporter related  55.23 
 
 
269 aa  280  1e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  57.85 
 
 
242 aa  280  2e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  58.33 
 
 
240 aa  279  3e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  55 
 
 
243 aa  279  3e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  58.44 
 
 
243 aa  278  5e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.08 
 
 
240 aa  278  6e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  56.25 
 
 
243 aa  278  6e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.08 
 
 
240 aa  278  6e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  56.25 
 
 
243 aa  278  7e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  57.08 
 
 
240 aa  277  8e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  57.08 
 
 
240 aa  277  8e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.08 
 
 
240 aa  277  8e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  57.08 
 
 
240 aa  276  1e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  55.83 
 
 
240 aa  277  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18720  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  54.24 
 
 
267 aa  277  1e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  56.2 
 
 
242 aa  277  1e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  53.94 
 
 
244 aa  277  1e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  55 
 
 
240 aa  276  2e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  54.55 
 
 
242 aa  276  2e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  54.55 
 
 
242 aa  276  2e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2280  ABC transporter related protein  50.73 
 
 
274 aa  276  2e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000113339  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  55.42 
 
 
243 aa  276  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  56.25 
 
 
240 aa  275  3e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  55.42 
 
 
240 aa  275  4e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.67 
 
 
240 aa  275  4e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  53.5 
 
 
244 aa  275  4e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.67 
 
 
240 aa  275  4e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  55 
 
 
240 aa  275  4e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  55.79 
 
 
244 aa  275  4e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  55.19 
 
 
244 aa  275  4e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  55.83 
 
 
243 aa  274  8e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  53.97 
 
 
253 aa  274  9e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3744  ATPase  53.53 
 
 
247 aa  273  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  54.39 
 
 
257 aa  274  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  56.67 
 
 
242 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  54.17 
 
 
240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  55 
 
 
240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.42 
 
 
240 aa  272  3e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  57.92 
 
 
252 aa  273  3e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  57.26 
 
 
241 aa  273  3e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  57.45 
 
 
240 aa  272  3e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  57.08 
 
 
240 aa  272  3e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1820  ABC transporter related  59.38 
 
 
248 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  55.23 
 
 
247 aa  272  4.0000000000000004e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.67 
 
 
240 aa  272  4.0000000000000004e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  53.57 
 
 
263 aa  271  5.000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  53.75 
 
 
244 aa  271  5.000000000000001e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11340  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.39 
 
 
258 aa  271  6e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.571361  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  54.92 
 
 
244 aa  271  6e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3014  ABC transporter related  55.24 
 
 
252 aa  271  7e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.101758  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.36 
 
 
241 aa  270  1e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  54.36 
 
 
241 aa  270  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  54.36 
 
 
241 aa  270  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4901  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55 
 
 
240 aa  270  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0490  ABC transporter related  54.96 
 
 
241 aa  270  2e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  53.25 
 
 
254 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1849  ABC transporter related  55.14 
 
 
251 aa  269  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2349  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.79 
 
 
245 aa  269  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.271296  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2061  glutamine transport protein glnQ  56.79 
 
 
245 aa  269  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  55.83 
 
 
240 aa  269  2.9999999999999997e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  53.94 
 
 
244 aa  268  4e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4950  ABC transporter related  53.2 
 
 
259 aa  269  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0598  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.25 
 
 
242 aa  268  4e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00132309  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  53.94 
 
 
241 aa  268  4e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0713  ABC transporter related  53.97 
 
 
363 aa  268  5e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  53.31 
 
 
246 aa  268  5e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0593  ABC transporter related  52.5 
 
 
241 aa  268  5e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.180749  normal  0.457666 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0567  ABC transporter related  52.5 
 
 
241 aa  268  5e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  56.67 
 
 
240 aa  268  5.9999999999999995e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  53.33 
 
 
243 aa  268  5.9999999999999995e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.71588 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>