More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1394 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  100 
 
 		 240 aa  487  1e-137  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  77.5 
 
 		 242 aa  386  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  77.5 
 
 		 242 aa  386  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  63.75 
 
 		 240 aa  327  8e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.75 
 
 		 240 aa  326  2.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  62.24 
 
 		 244 aa  317  7e-86  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.08 
 
 		 241 aa  317  1e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  62.08 
 
 		 241 aa  317  1e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  62.08 
 
 		 241 aa  317  1e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  61.67 
 
 		 241 aa  315  3e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  63.75 
 
 		 241 aa  315  4e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  63.75 
 
 		 241 aa  315  4e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  63.33 
 
 		 241 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  63.75 
 
 		 241 aa  312  2.9999999999999996e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  63.75 
 
 		 241 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  61.67 
 
 		 240 aa  311  6.999999999999999e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  60.83 
 
 		 241 aa  310  9e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  60 
 
 		 240 aa  310  1e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  61.25 
 
 		 241 aa  310  2e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  61.67 
 
 		 244 aa  309  2.9999999999999997e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  60.42 
 
 		 241 aa  308  4e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  60.42 
 
 		 240 aa  308  4e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  61.25 
 
 		 244 aa  308  6.999999999999999e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  60.83 
 
 		 240 aa  307  9e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  60.42 
 
 		 242 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  59.58 
 
 		 244 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  58.75 
 
 		 240 aa  305  5.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  59.41 
 
 		 249 aa  303  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  57.92 
 
 		 242 aa  301  6.000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1926  ABC transporter related  56.73 
 
 		 247 aa  301  7.000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  59.17 
 
 		 242 aa  301  7.000000000000001e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  59.58 
 
 		 240 aa  300  1e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  58.33 
 
 		 244 aa  300  1e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  58.75 
 
 		 240 aa  299  3e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.58 
 
 		 244 aa  298  4e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  59.17 
 
 		 243 aa  298  4e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0629  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  58.92 
 
 		 244 aa  298  5e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  59.41 
 
 		 246 aa  297  8e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  58.75 
 
 		 240 aa  296  1e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  59.83 
 
 		 247 aa  296  1e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  57.08 
 
 		 247 aa  296  2e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.75 
 
 		 240 aa  295  3e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1152  ABC transporter related  57.96 
 
 		 247 aa  295  3e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.645905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  58.58 
 
 		 253 aa  295  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.33 
 
 		 240 aa  295  4e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.33 
 
 		 240 aa  295  4e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.33 
 
 		 240 aa  295  4e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  57.5 
 
 		 241 aa  295  4e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.33 
 
 		 240 aa  295  4e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2182  ABC transporter related  56.49 
 
 		 245 aa  295  4e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857357 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  59.58 
 
 		 240 aa  295  5e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  58.58 
 
 		 244 aa  295  5e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  55.83 
 
 		 242 aa  294  7e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  58.33 
 
 		 240 aa  294  9e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.92 
 
 		 240 aa  294  9e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.25 
 
 		 244 aa  294  9e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0726  ABC transporter related  58.09 
 
 		 247 aa  294  9e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000170097  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6988  ABC transporter related  59.83 
 
 		 265 aa  293  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0861  ATPase  56.9 
 
 		 363 aa  293  1e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1038  ATPase  56.9 
 
 		 363 aa  293  1e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.396319 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  57.32 
 
 		 247 aa  293  1e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.92 
 
 		 240 aa  293  1e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.25 
 
 		 244 aa  293  1e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  57.32 
 
 		 246 aa  293  1e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4704  ABC transporter-related protein  59.83 
 
 		 257 aa  294  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.874551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3165  ABC transporter related  60.25 
 
 		 257 aa  293  2e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.127499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.92 
 
 		 240 aa  293  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  57.08 
 
 		 253 aa  292  3e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.83 
 
 		 244 aa  292  3e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.92 
 
 		 240 aa  292  3e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.83 
 
 		 244 aa  292  3e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  57.08 
 
 		 240 aa  291  4e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.83 
 
 		 244 aa  292  4e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.83 
 
 		 244 aa  291  4e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  57.92 
 
 		 242 aa  292  4e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.83 
 
 		 244 aa  291  4e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  57.08 
 
 		 243 aa  291  5e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60 
 
 		 251 aa  291  5e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  56.25 
 
 		 246 aa  291  9e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  57.08 
 
 		 239 aa  290  1e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2740  ABC transporter related  59.5 
 
 		 248 aa  290  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  57.08 
 
 		 240 aa  290  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  58.58 
 
 		 249 aa  290  1e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0814  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60.83 
 
 		 244 aa  290  2e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  56.25 
 
 		 240 aa  289  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0857  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60.83 
 
 		 244 aa  290  2e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  55.83 
 
 		 240 aa  290  2e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  60.83 
 
 		 244 aa  290  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.9 
 
 		 273 aa  290  2e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18720  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  60.43 
 
 		 267 aa  290  2e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0431  ABC transporter related  58.68 
 
 		 286 aa  289  3e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0284174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  57.08 
 
 		 243 aa  288  4e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2298  ABC transporter related  58.68 
 
 		 247 aa  288  4e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  56.07 
 
 		 246 aa  288  6e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5459  ABC transporter related  54 
 
 		 263 aa  288  7e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26828  normal  0.671869 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  57.5 
 
 		 257 aa  288  7e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  56.07 
 
 		 247 aa  287  1e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  58.09 
 
 		 241 aa  287  1e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  55 
 
 		 242 aa  286  2e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  56.67 
 
 		 243 aa  286  2e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>