More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6988 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6988  ABC transporter related  100 
 
 		 265 aa  530  1e-150  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  82.79 
 
 		 251 aa  409  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  72.13 
 
 		 253 aa  364  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  72.31 
 
 		 246 aa  365  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  72.95 
 
 		 257 aa  360  2e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2831  ABC transporter related  71.19 
 
 		 262 aa  353  1e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.563862 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  71.85 
 
 		 273 aa  353  2e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  69.11 
 
 		 257 aa  347  9e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3136  ABC transporter related  71.19 
 
 		 269 aa  347  1e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11340  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  68.75 
 
 		 258 aa  342  2.9999999999999997e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.571361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0959  ABC transporter related  66.4 
 
 		 260 aa  335  5e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  66.25 
 
 		 244 aa  335  5e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18720  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  70.59 
 
 		 267 aa  327  2.0000000000000001e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0685  ABC transporter related  67.49 
 
 		 255 aa  325  4.0000000000000003e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2298  ABC transporter related  61.83 
 
 		 247 aa  321  6e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  61.92 
 
 		 240 aa  312  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2233  ABC transporter related  61.25 
 
 		 246 aa  310  1e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.693391  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  61.45 
 
 		 256 aa  308  4e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  61.92 
 
 		 244 aa  305  6e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2063  ABC transporter related  62.76 
 
 		 246 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0300144  normal  0.143114 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3165  ABC transporter related  58.69 
 
 		 257 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.127499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  61.92 
 
 		 249 aa  301  5.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  58.72 
 
 		 242 aa  300  1e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3458  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  61.51 
 
 		 246 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3103  ABC transporter related  61.51 
 
 		 246 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.209111  normal  0.482435 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0861  ATPase  55.1 
 
 		 363 aa  299  3e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1038  ATPase  55.1 
 
 		 363 aa  299  3e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.396319 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  61.09 
 
 		 241 aa  299  4e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  59 
 
 		 240 aa  299  4e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  61.51 
 
 		 240 aa  298  4e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  58.3 
 
 		 242 aa  298  7e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  57.61 
 
 		 246 aa  297  1e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  58.2 
 
 		 247 aa  296  2e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  57.08 
 
 		 242 aa  296  2e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  60.25 
 
 		 241 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  57.32 
 
 		 240 aa  296  2e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  63.25 
 
 		 240 aa  296  3e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0750  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  56.91 
 
 		 248 aa  295  7e-79  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.23695  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.85 
 
 		 269 aa  294  8e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  59.83 
 
 		 240 aa  293  1e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  59.26 
 
 		 269 aa  293  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  59.83 
 
 		 241 aa  294  1e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  59.58 
 
 		 244 aa  293  1e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  61.92 
 
 		 240 aa  294  1e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  59.83 
 
 		 241 aa  294  1e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  59.83 
 
 		 241 aa  293  2e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  59.83 
 
 		 240 aa  293  2e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0713  ABC transporter related  54.69 
 
 		 363 aa  292  3e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  59.58 
 
 		 244 aa  292  3e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2021  ABC transporter related  54.69 
 
 		 363 aa  291  6e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4704  ABC transporter-related protein  57.53 
 
 		 257 aa  291  6e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.874551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  59.92 
 
 		 243 aa  291  8e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.44 
 
 		 249 aa  290  1e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  59.83 
 
 		 242 aa  291  1e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  58.58 
 
 		 241 aa  290  1e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  55.97 
 
 		 246 aa  290  1e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  58.58 
 
 		 241 aa  290  1e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  57.14 
 
 		 253 aa  290  2e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.58 
 
 		 241 aa  290  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  59 
 
 		 241 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  57.02 
 
 		 243 aa  290  2e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  58.33 
 
 		 247 aa  289  2e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  60.42 
 
 		 242 aa  290  2e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.14 
 
 		 253 aa  289  3e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  56.73 
 
 		 263 aa  289  3e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  61.18 
 
 		 241 aa  289  3e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  61.09 
 
 		 243 aa  289  3e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  57.02 
 
 		 243 aa  289  4e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  58.16 
 
 		 241 aa  289  4e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  56.03 
 
 		 257 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  58.2 
 
 		 252 aa  288  9e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  60 
 
 		 242 aa  287  1e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  57.14 
 
 		 258 aa  287  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  57.08 
 
 		 242 aa  287  1e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  57.14 
 
 		 258 aa  287  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  58.16 
 
 		 244 aa  287  1e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  58.58 
 
 		 241 aa  286  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  58.33 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  57.2 
 
 		 267 aa  286  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.73 
 
 		 284 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  56.61 
 
 		 243 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  58.85 
 
 		 249 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  55.19 
 
 		 247 aa  286  2.9999999999999996e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1180  ABC transporter related  52.24 
 
 		 360 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0599  ABC transporter related protein  54.39 
 
 		 243 aa  285  4e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1059  hypothetical protein  56.49 
 
 		 245 aa  285  5e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  57.96 
 
 		 244 aa  285  5e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  54.86 
 
 		 257 aa  285  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1801  ABC transporter related  57.2 
 
 		 250 aa  285  5.999999999999999e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0322586 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  55.42 
 
 		 242 aa  285  7e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  59.75 
 
 		 243 aa  285  7e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2182  ABC transporter related  58.4 
 
 		 245 aa  284  8e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857357 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4837  ABC transporter related  60 
 
 		 244 aa  284  8e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0177235  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  55.78 
 
 		 258 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  58.18 
 
 		 273 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2389  ABC transporter related  60 
 
 		 266 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  59.41 
 
 		 248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  56.9 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1849  ABC transporter related  59.34 
 
 		 251 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  57.32 
 
 		 242 aa  282  3.0000000000000004e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>