More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3136 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3136  ABC transporter related  100 
 
 		 269 aa  548  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2831  ABC transporter related  86.52 
 
 		 262 aa  471  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.563862 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18720  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  73.08 
 
 		 267 aa  380  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  70.45 
 
 		 253 aa  360  2e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  72.43 
 
 		 257 aa  355  5e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6988  ABC transporter related  68.3 
 
 		 265 aa  352  2.9999999999999997e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0959  ABC transporter related  68.92 
 
 		 260 aa  350  1e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  71.25 
 
 		 273 aa  349  2e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  69.29 
 
 		 246 aa  347  1e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  70.2 
 
 		 251 aa  342  2.9999999999999997e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  67.76 
 
 		 257 aa  338  5e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0685  ABC transporter related  63.67 
 
 		 255 aa  317  1e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11340  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  61.73 
 
 		 258 aa  311  5.999999999999999e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.571361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  61.25 
 
 		 244 aa  308  4e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  61.25 
 
 		 247 aa  306  2.0000000000000002e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  64.68 
 
 		 256 aa  303  1.0000000000000001e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2298  ABC transporter related  60.66 
 
 		 247 aa  302  4.0000000000000003e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  60.25 
 
 		 240 aa  302  5.000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  60.25 
 
 		 241 aa  298  5e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  60.25 
 
 		 241 aa  298  5e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  59.83 
 
 		 240 aa  297  9e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  60.67 
 
 		 241 aa  298  9e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.25 
 
 		 241 aa  297  1e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  64.29 
 
 		 243 aa  297  1e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2233  ABC transporter related  60.42 
 
 		 246 aa  297  1e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.693391  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  58.58 
 
 		 240 aa  296  2e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  59.83 
 
 		 241 aa  296  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  60.67 
 
 		 241 aa  296  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  60.25 
 
 		 241 aa  297  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  58.58 
 
 		 244 aa  296  3e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  58.16 
 
 		 240 aa  295  4e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.74 
 
 		 240 aa  293  2e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  59.41 
 
 		 249 aa  291  7e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  59.41 
 
 		 240 aa  289  3e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6459  ABC transporter related  60.41 
 
 		 255 aa  288  4e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  58.4 
 
 		 249 aa  288  5.0000000000000004e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  56.67 
 
 		 246 aa  288  7e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2182  ABC transporter related  59.24 
 
 		 245 aa  288  7e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857357 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  60 
 
 		 267 aa  288  9e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.32 
 
 		 244 aa  287  1e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  58.16 
 
 		 242 aa  287  1e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  56.67 
 
 		 246 aa  287  1e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  57.74 
 
 		 240 aa  286  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  57.32 
 
 		 240 aa  286  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  60.17 
 
 		 240 aa  286  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  57.74 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  56.9 
 
 		 240 aa  286  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1801  ABC transporter related  59.24 
 
 		 250 aa  286  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0322586 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  58.58 
 
 		 241 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  57.32 
 
 		 244 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  57.74 
 
 		 241 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  57.74 
 
 		 241 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  56.07 
 
 		 240 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  55.42 
 
 		 242 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  55.42 
 
 		 242 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  56.9 
 
 		 252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  57.85 
 
 		 244 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  58.58 
 
 		 278 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2303  ABC transporter related protein  57.08 
 
 		 246 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000265903  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  57.08 
 
 		 247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4837  ABC transporter related  59.92 
 
 		 244 aa  282  3.0000000000000004e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0177235  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  58.16 
 
 		 244 aa  282  3.0000000000000004e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  58.58 
 
 		 248 aa  282  3.0000000000000004e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  56.49 
 
 		 246 aa  282  3.0000000000000004e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  57.5 
 
 		 247 aa  282  3.0000000000000004e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1059  hypothetical protein  57.08 
 
 		 245 aa  282  4.0000000000000003e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  58.82 
 
 		 244 aa  281  6.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2063  ABC transporter related  61.11 
 
 		 246 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0300144  normal  0.143114 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  56.49 
 
 		 242 aa  281  8.000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  57.08 
 
 		 242 aa  281  8.000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0599  ABC transporter related protein  55.23 
 
 		 243 aa  280  1e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  57.32 
 
 		 241 aa  281  1e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  57.02 
 
 		 243 aa  280  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.39 
 
 		 240 aa  280  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.81 
 
 		 240 aa  280  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  57.32 
 
 		 242 aa  280  2e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  57.03 
 
 		 256 aa  280  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  57.32 
 
 		 242 aa  280  2e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  56.9 
 
 		 241 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  56.49 
 
 		 240 aa  279  3e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.81 
 
 		 240 aa  279  3e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.81 
 
 		 240 aa  279  3e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  57.74 
 
 		 248 aa  279  3e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.81 
 
 		 240 aa  279  3e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.81 
 
 		 240 aa  279  3e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0750  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  56.67 
 
 		 248 aa  279  3e-74  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.23695  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0085  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  56.78 
 
 		 254 aa  279  3e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000203236  normal  0.523772 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5523  ABC transporter related  55.29 
 
 		 260 aa  279  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0407401  normal  0.45159 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.81 
 
 		 240 aa  279  4e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  56.85 
 
 		 242 aa  278  6e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.5 
 
 		 244 aa  278  6e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  56.07 
 
 		 247 aa  278  6e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.39 
 
 		 240 aa  278  6e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  56.4 
 
 		 249 aa  278  7e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.58 
 
 		 240 aa  278  9e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3458  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  59.83 
 
 		 246 aa  278  9e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3103  ABC transporter related  59.83 
 
 		 246 aa  278  9e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.209111  normal  0.482435 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  56.07 
 
 		 240 aa  278  9e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  56.07 
 
 		 249 aa  278  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1315  polar amino acid ABC transporter ATPase  59.84 
 
 		 250 aa  277  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.820266  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>