More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1801 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1801  ABC transporter related  100 
 
 		 250 aa  513  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0322586 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2182  ABC transporter related  94.24 
 
 		 245 aa  470  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857357 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  60.67 
 
 		 240 aa  308  5e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18750  ABC transporter related  58.63 
 
 		 250 aa  308  6.999999999999999e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000378719  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0123  ABC transporter related protein  60.49 
 
 		 265 aa  304  1.0000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  61.6 
 
 		 256 aa  301  6.000000000000001e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1656  ABC transporter related  58.68 
 
 		 255 aa  301  8.000000000000001e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00836866  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  60.5 
 
 		 253 aa  300  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  58.82 
 
 		 246 aa  299  3e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0029  ABC transporter related  60.25 
 
 		 250 aa  295  5e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  57.2 
 
 		 244 aa  294  7e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  57.74 
 
 		 242 aa  292  3e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  59.66 
 
 		 244 aa  292  4e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.75 
 
 		 251 aa  290  1e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.58 
 
 		 273 aa  290  1e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1365  ABC transporter-related protein  57.92 
 
 		 251 aa  289  3e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.886307  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  57.81 
 
 		 240 aa  289  3e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  57.72 
 
 		 257 aa  289  3e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2831  ABC transporter related  60.17 
 
 		 262 aa  288  7e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.563862 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  56.49 
 
 		 240 aa  288  8e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0959  ABC transporter related  56.92 
 
 		 260 aa  288  8e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  58.16 
 
 		 242 aa  287  1e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  57.14 
 
 		 247 aa  287  1e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  54.81 
 
 		 240 aa  286  2e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  57.87 
 
 		 240 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  58.26 
 
 		 257 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3136  ABC transporter related  59.24 
 
 		 269 aa  285  4e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6988  ABC transporter related  57.2 
 
 		 265 aa  285  5e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1690  ABC transporter related  58.47 
 
 		 243 aa  285  5.999999999999999e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.653327 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  57.83 
 
 		 256 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11340  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.44 
 
 		 258 aa  284  8e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.571361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  57.85 
 
 		 244 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  56.81 
 
 		 267 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  58.16 
 
 		 246 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  54.39 
 
 		 242 aa  282  4.0000000000000003e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  55.23 
 
 		 240 aa  282  4.0000000000000003e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  57.2 
 
 		 244 aa  281  5.000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  55.23 
 
 		 241 aa  281  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0431  ABC transporter related  60.66 
 
 		 286 aa  281  8.000000000000001e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0284174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  55.23 
 
 		 241 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  55.23 
 
 		 241 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3901  ABC transporter related  55.33 
 
 		 255 aa  281  9e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.292154  normal  0.145575 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  54.85 
 
 		 242 aa  280  1e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  55.65 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  55.23 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  54.85 
 
 		 242 aa  280  1e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  53.14 
 
 		 240 aa  280  1e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  56.9 
 
 		 242 aa  280  1e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  57.32 
 
 		 252 aa  279  2e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  54.32 
 
 		 244 aa  280  2e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1436  hypothetical protein  57.81 
 
 		 247 aa  280  2e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2303  ABC transporter related protein  55 
 
 		 246 aa  279  3e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000265903  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.23 
 
 		 241 aa  279  3e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  56.9 
 
 		 242 aa  279  3e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  55.23 
 
 		 241 aa  279  3e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  55.23 
 
 		 241 aa  279  3e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  56.07 
 
 		 241 aa  279  3e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  56.91 
 
 		 265 aa  279  3e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.91 
 
 		 244 aa  279  4e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  56.67 
 
 		 253 aa  279  4e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.3 
 
 		 240 aa  278  5e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  55.23 
 
 		 241 aa  278  5e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  55.47 
 
 		 249 aa  278  7e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1343  ABC transporter related  57.08 
 
 		 246 aa  278  8e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.08 
 
 		 284 aa  278  8e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  55.23 
 
 		 241 aa  277  9e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  55.65 
 
 		 240 aa  277  9e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  53.14 
 
 		 240 aa  277  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3458  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  56.15 
 
 		 246 aa  277  1e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  55.37 
 
 		 246 aa  277  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  54.81 
 
 		 242 aa  277  1e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  53.56 
 
 		 240 aa  277  1e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  57.69 
 
 		 243 aa  277  1e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2063  ABC transporter related  56.15 
 
 		 246 aa  277  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0300144  normal  0.143114 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3103  ABC transporter related  56.15 
 
 		 246 aa  277  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.209111  normal  0.482435 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3744  ATPase  57.92 
 
 		 247 aa  276  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  55.42 
 
 		 244 aa  276  2e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.83 
 
 		 253 aa  275  3e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  57.69 
 
 		 243 aa  276  3e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.14 
 
 		 240 aa  276  3e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  56.69 
 
 		 254 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  54.39 
 
 		 241 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  58.1 
 
 		 260 aa  275  4e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  56.78 
 
 		 242 aa  275  5e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  53.91 
 
 		 244 aa  275  6e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  52.72 
 
 		 240 aa  274  8e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  56.78 
 
 		 242 aa  274  9e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  57.26 
 
 		 243 aa  274  9e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  55.23 
 
 		 240 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1806  ABC transporter related  56.07 
 
 		 248 aa  274  1.0000000000000001e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.39 
 
 		 240 aa  273  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.14 
 
 		 240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.14 
 
 		 240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2882  ABC transporter related  59.49 
 
 		 261 aa  273  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0937154  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.56 
 
 		 240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.14 
 
 		 240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  57.5 
 
 		 246 aa  273  2.0000000000000002e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.14 
 
 		 240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0468  ABC transporter related  57.32 
 
 		 240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  56.52 
 
 		 260 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>