More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2063 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2063  ABC transporter related  100 
 
 		 246 aa  497  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0300144  normal  0.143114 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3458  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  97.97 
 
 		 246 aa  488  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3103  ABC transporter related  97.97 
 
 		 246 aa  488  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.209111  normal  0.482435 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6988  ABC transporter related  62.76 
 
 		 265 aa  303  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  62.08 
 
 		 240 aa  298  5e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  59.17 
 
 		 240 aa  298  6e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  60.25 
 
 		 244 aa  297  8e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  60.08 
 
 		 244 aa  296  2e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  59.75 
 
 		 257 aa  296  3e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  60.17 
 
 		 244 aa  295  5e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  57.08 
 
 		 242 aa  295  6e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  57.92 
 
 		 244 aa  295  6e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  57.2 
 
 		 246 aa  294  1e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  60.91 
 
 		 257 aa  293  2e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  57.44 
 
 		 253 aa  291  6e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11340  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  61 
 
 		 258 aa  291  7e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.571361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  58.75 
 
 		 246 aa  291  8e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  58.2 
 
 		 256 aa  290  1e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  59.41 
 
 		 246 aa  290  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  58.61 
 
 		 245 aa  290  1e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  58.2 
 
 		 244 aa  290  1e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  58.2 
 
 		 245 aa  290  2e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0431  ABC transporter related  58.44 
 
 		 286 aa  290  2e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0284174  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  58.75 
 
 		 244 aa  290  2e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2492  ABC transporter related  58.02 
 
 		 243 aa  290  2e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.43 
 
 		 251 aa  288  5.0000000000000004e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  57.92 
 
 		 242 aa  288  6e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  57.08 
 
 		 252 aa  287  1e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.44 
 
 		 253 aa  286  2e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  56.63 
 
 		 256 aa  286  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  58.68 
 
 		 249 aa  286  2e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  56.67 
 
 		 242 aa  285  2.9999999999999996e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.44 
 
 		 284 aa  285  2.9999999999999996e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  58.75 
 
 		 244 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  60 
 
 		 242 aa  285  4e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  56.43 
 
 		 242 aa  285  4e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  56.43 
 
 		 242 aa  285  4e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  61.97 
 
 		 273 aa  285  4e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  58.97 
 
 		 249 aa  284  9e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.08 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.08 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  56.67 
 
 		 242 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  57.08 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  57.08 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  55.83 
 
 		 242 aa  282  4.0000000000000003e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  56.67 
 
 		 241 aa  281  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  56.67 
 
 		 241 aa  281  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  56.67 
 
 		 241 aa  281  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  57.5 
 
 		 241 aa  281  6.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  56.67 
 
 		 241 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  55.83 
 
 		 240 aa  281  8.000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  59.83 
 
 		 240 aa  280  1e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3136  ABC transporter related  61.11 
 
 		 269 aa  281  1e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  58.33 
 
 		 240 aa  280  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  54.73 
 
 		 256 aa  279  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  52.05 
 
 		 246 aa  279  2e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2298  ABC transporter related  57.32 
 
 		 247 aa  280  2e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  57.08 
 
 		 242 aa  279  3e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  55.83 
 
 		 240 aa  279  3e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  56.41 
 
 		 249 aa  279  3e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  56.22 
 
 		 259 aa  279  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  56.61 
 
 		 248 aa  279  3e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  56.25 
 
 		 241 aa  279  3e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  56.25 
 
 		 241 aa  279  3e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0468  ABC transporter related  57.92 
 
 		 240 aa  279  3e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2758  ABC transporter related  55.14 
 
 		 252 aa  278  4e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  53.33 
 
 		 240 aa  278  6e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0959  ABC transporter related  56.28 
 
 		 260 aa  278  7e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  57.08 
 
 		 242 aa  278  8e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  56.61 
 
 		 248 aa  277  9e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1160  polar amino acid ABC transporter ATPase  56.69 
 
 		 254 aa  277  9e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  58.33 
 
 		 239 aa  277  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  56.61 
 
 		 246 aa  277  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  57.2 
 
 		 248 aa  277  1e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  56.25 
 
 		 241 aa  277  1e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1801  ABC transporter related  56.15 
 
 		 250 aa  277  1e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0322586 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  57.74 
 
 		 242 aa  277  1e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  54.15 
 
 		 254 aa  276  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  56.85 
 
 		 256 aa  276  2e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  57.08 
 
 		 240 aa  275  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  56.67 
 
 		 240 aa  276  3e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  56.18 
 
 		 267 aa  275  3e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1343  ABC transporter related  55.14 
 
 		 246 aa  276  3e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  56.79 
 
 		 261 aa  276  3e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  55.83 
 
 		 240 aa  275  3e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0726  ABC transporter related  52.87 
 
 		 247 aa  275  4e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000170097  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5459  ABC transporter related  53.57 
 
 		 263 aa  275  4e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26828  normal  0.671869 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  58.47 
 
 		 263 aa  275  4e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  54.81 
 
 		 267 aa  275  4e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  56.25 
 
 		 241 aa  275  4e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  54.81 
 
 		 258 aa  275  5e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4546  ABC transporter related  55.79 
 
 		 254 aa  275  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.141129 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  54.81 
 
 		 258 aa  275  5e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  55.42 
 
 		 240 aa  275  5e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  56.67 
 
 		 240 aa  275  5e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  56.43 
 
 		 254 aa  275  6e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  56.07 
 
 		 247 aa  275  6e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  54.92 
 
 		 248 aa  275  6e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3014  ABC transporter related  57.89 
 
 		 252 aa  275  6e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.101758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  56.43 
 
 		 254 aa  275  6e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>