More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0652 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  100 
 
 
244 aa  489  1e-137  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  83.2 
 
 
244 aa  419  1e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  72.54 
 
 
244 aa  370  1e-101  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  73.75 
 
 
240 aa  357  9.999999999999999e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  73.33 
 
 
240 aa  355  5e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  65.02 
 
 
247 aa  337  7e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  67.08 
 
 
240 aa  330  1e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  65.83 
 
 
240 aa  330  2e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  65.42 
 
 
240 aa  329  3e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.42 
 
 
241 aa  328  4e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  63.9 
 
 
242 aa  328  5.0000000000000004e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  65.42 
 
 
241 aa  328  6e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  65.42 
 
 
241 aa  328  6e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  67.22 
 
 
247 aa  328  6e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  65.42 
 
 
241 aa  328  6e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  66.67 
 
 
241 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  66.67 
 
 
241 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.83 
 
 
240 aa  325  3e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  65.57 
 
 
244 aa  326  3e-88  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  66.67 
 
 
240 aa  326  3e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  66.25 
 
 
240 aa  325  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  66.25 
 
 
240 aa  325  4.0000000000000003e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  66.25 
 
 
240 aa  325  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  66.25 
 
 
240 aa  325  4.0000000000000003e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  66.53 
 
 
240 aa  325  4.0000000000000003e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  66.25 
 
 
240 aa  324  7e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  66.25 
 
 
240 aa  324  7e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.42 
 
 
240 aa  323  1e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  64.58 
 
 
241 aa  323  1e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  65.83 
 
 
241 aa  323  1e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  65 
 
 
240 aa  323  2e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  65.83 
 
 
241 aa  323  2e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  65.83 
 
 
241 aa  322  3e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  65.42 
 
 
242 aa  322  5e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  65.42 
 
 
241 aa  321  5e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65 
 
 
240 aa  321  7e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  63.93 
 
 
246 aa  319  1.9999999999999998e-86  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  65.42 
 
 
241 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  65.42 
 
 
240 aa  319  3e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  63.93 
 
 
244 aa  318  3.9999999999999996e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  65.42 
 
 
242 aa  318  5e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  62.4 
 
 
243 aa  318  7e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  64.17 
 
 
242 aa  317  9e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  64.17 
 
 
242 aa  317  9e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  63.75 
 
 
240 aa  317  1e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  62.92 
 
 
240 aa  317  1e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  64.58 
 
 
239 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  62.96 
 
 
256 aa  314  9.999999999999999e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  64.58 
 
 
243 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  60.17 
 
 
242 aa  311  4.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  62.08 
 
 
243 aa  311  4.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  63.6 
 
 
247 aa  311  4.999999999999999e-84  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  64.17 
 
 
243 aa  311  5.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  60.83 
 
 
244 aa  311  7.999999999999999e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  62.92 
 
 
240 aa  311  7.999999999999999e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  62.08 
 
 
244 aa  311  7.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  60.91 
 
 
249 aa  311  9e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  61.67 
 
 
240 aa  310  1e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  64.17 
 
 
243 aa  310  2e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  61.67 
 
 
240 aa  309  2.9999999999999997e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  60.17 
 
 
246 aa  308  2.9999999999999997e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  59.84 
 
 
244 aa  309  2.9999999999999997e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  60.49 
 
 
249 aa  308  4e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  63.33 
 
 
242 aa  308  4e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  60.67 
 
 
257 aa  306  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  60.25 
 
 
246 aa  307  1.0000000000000001e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  62.08 
 
 
240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11340  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60.67 
 
 
258 aa  306  2.0000000000000002e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.571361  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  61.25 
 
 
240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  60.17 
 
 
242 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  60.42 
 
 
241 aa  306  3e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  59.58 
 
 
257 aa  305  5.0000000000000004e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  59.41 
 
 
253 aa  304  7e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  62.76 
 
 
249 aa  304  7e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  61 
 
 
243 aa  304  9.000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  59.92 
 
 
246 aa  303  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  58.92 
 
 
242 aa  303  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2021  ABC transporter related  56.9 
 
 
363 aa  303  1.0000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  58.09 
 
 
244 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  61.25 
 
 
246 aa  303  1.0000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  59.34 
 
 
242 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  61 
 
 
243 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  60.08 
 
 
263 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0726  ABC transporter related  60.73 
 
 
247 aa  302  3.0000000000000004e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000170097  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  60.58 
 
 
241 aa  302  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  58.2 
 
 
245 aa  301  5.000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  60.42 
 
 
242 aa  301  6.000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  60 
 
 
246 aa  301  6.000000000000001e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  57.61 
 
 
253 aa  301  9e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2298  ABC transporter related  60 
 
 
247 aa  300  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  58.92 
 
 
243 aa  300  1e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0713  ABC transporter related  56.49 
 
 
363 aa  300  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  58.75 
 
 
252 aa  299  3e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  60 
 
 
242 aa  299  3e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  55.42 
 
 
244 aa  299  3e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  57.32 
 
 
246 aa  298  4e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  63.75 
 
 
248 aa  298  4e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  57.25 
 
 
273 aa  298  4e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  60.42 
 
 
246 aa  298  5e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.25 
 
 
240 aa  298  6e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>