More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1315 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1315  polar amino acid ABC transporter ATPase  100 
 
 		 250 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.820266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  62.4 
 
 		 254 aa  306  2.0000000000000002e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  59.6 
 
 		 267 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  60 
 
 		 273 aa  296  2e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1700  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  60.64 
 
 		 581 aa  295  5e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  57.2 
 
 		 268 aa  293  2e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  57.32 
 
 		 256 aa  292  3e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  59.84 
 
 		 254 aa  292  4e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  60.4 
 
 		 252 aa  291  9e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  59.11 
 
 		 267 aa  290  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3766  ABC transporter related  58.68 
 
 		 264 aa  290  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6459  ABC transporter related  59.11 
 
 		 255 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  58.47 
 
 		 258 aa  289  2e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  57.26 
 
 		 250 aa  288  4e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.8 
 
 		 254 aa  289  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  60 
 
 		 244 aa  288  5.0000000000000004e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  56.85 
 
 		 254 aa  288  8e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  56.4 
 
 		 263 aa  287  1e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2890  ABC transporter  55.91 
 
 		 261 aa  287  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00124978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  56.85 
 
 		 250 aa  287  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1160  polar amino acid ABC transporter ATPase  59.51 
 
 		 254 aa  286  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  56.45 
 
 		 260 aa  286  2e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  55.6 
 
 		 259 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  54.94 
 
 		 274 aa  286  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  56 
 
 		 244 aa  285  4e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.82 
 
 		 592 aa  285  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  55.65 
 
 		 260 aa  285  5e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  56.4 
 
 		 263 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4694  ABC transporter related  57.66 
 
 		 254 aa  283  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3009  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.61 
 
 		 261 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0789225  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.8 
 
 		 260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  58.63 
 
 		 249 aa  283  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  55.78 
 
 		 263 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3516  ABC transporter related  54.66 
 
 		 254 aa  282  4.0000000000000003e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2361  ABC transporter-related protein  53.66 
 
 		 253 aa  281  5.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  55.6 
 
 		 259 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5874  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.43 
 
 		 597 aa  281  9e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2284  normal  0.116793 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.83 
 
 		 594 aa  281  9e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3863  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.43 
 
 		 594 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132833  normal  0.716613 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2740  ABC transporter related  55.6 
 
 		 248 aa  279  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  53.2 
 
 		 256 aa  279  3e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  59.2 
 
 		 240 aa  278  4e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  56 
 
 		 240 aa  278  4e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1260  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein  58.09 
 
 		 252 aa  278  4e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.0306795 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0396  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  57.89 
 
 		 602 aa  278  5e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2503  ABC transporter ATP-binding protein  57.44 
 
 		 598 aa  278  7e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1688  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  57.43 
 
 		 636 aa  278  7e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.295284  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0565  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  57.43 
 
 		 636 aa  278  7e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1893  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  57.43 
 
 		 636 aa  278  7e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1685  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  57.43 
 
 		 636 aa  278  7e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0737  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  57.43 
 
 		 636 aa  278  8e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2265  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  57.43 
 
 		 636 aa  278  8e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  54.4 
 
 		 248 aa  278  8e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5459  ABC transporter related  56.8 
 
 		 263 aa  277  9e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26828  normal  0.671869 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4188  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.43 
 
 		 595 aa  277  9e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4351  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  54.62 
 
 		 595 aa  278  9e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3935  amino acid ABC transporter permease  57.03 
 
 		 597 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140716  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3136  ABC transporter related  59.84 
 
 		 269 aa  277  1e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4431  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.03 
 
 		 597 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.813853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  55.6 
 
 		 256 aa  277  1e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  54.8 
 
 		 240 aa  276  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0404  ABC transporter related  57.5 
 
 		 272 aa  276  2e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  57.66 
 
 		 256 aa  276  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  55.6 
 
 		 240 aa  276  3e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2402  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  57.03 
 
 		 636 aa  275  4e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0471039  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  55.47 
 
 		 254 aa  275  4e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  54.37 
 
 		 262 aa  275  4e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2098  ABC transporter ATP-binding protein  57.09 
 
 		 254 aa  275  6e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1531  amino acid ABC transporter inner membrane protein  57.43 
 
 		 619 aa  275  7e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.158795 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  56.05 
 
 		 246 aa  275  7e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  54.18 
 
 		 240 aa  274  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2581  ABC transporter related  56.97 
 
 		 255 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.507078  normal  0.289132 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  55.2 
 
 		 252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  54 
 
 		 240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  55.2 
 
 		 243 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  55.2 
 
 		 240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7087  ABC transporter related  55.6 
 
 		 254 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  56 
 
 		 246 aa  273  3e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  56 
 
 		 240 aa  272  3e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  54.8 
 
 		 240 aa  273  3e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  55.2 
 
 		 245 aa  272  4.0000000000000004e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  54 
 
 		 242 aa  272  4.0000000000000004e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  54.4 
 
 		 255 aa  271  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2086  ABC transporter related  54.13 
 
 		 257 aa  271  5.000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.23 
 
 		 244 aa  271  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1983  ABC transporter related  55.47 
 
 		 261 aa  271  5.000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  57.2 
 
 		 252 aa  271  6e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  51.2 
 
 		 242 aa  271  6e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  56.8 
 
 		 242 aa  271  7e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  55.33 
 
 		 248 aa  271  7e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  56.86 
 
 		 262 aa  271  8.000000000000001e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  53.39 
 
 		 243 aa  271  8.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.23 
 
 		 244 aa  271  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  52.99 
 
 		 243 aa  270  2e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  53.57 
 
 		 256 aa  270  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  53.57 
 
 		 270 aa  270  2e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0314  hypothetical protein  54 
 
 		 255 aa  270  2e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000509196  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2851  ABC transporter related  56 
 
 		 257 aa  270  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  55.38 
 
 		 249 aa  269  2.9999999999999997e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5537  ABC transporter related  54.8 
 
 		 255 aa  269  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.772431 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>