More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0778 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  100 
 
 
278 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6012  ABC transporter related  68.92 
 
 
251 aa  345  4e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.469772  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  68.83 
 
 
252 aa  344  7e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  70.34 
 
 
248 aa  338  5e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4025  ABC transporter related  68.92 
 
 
251 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4341  ABC transporter related  68.92 
 
 
251 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.303268  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  67.56 
 
 
253 aa  337  9e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2390  ABC transporter related  70 
 
 
243 aa  333  3e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  69.07 
 
 
248 aa  331  8e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2743  ABC transporter related  70.34 
 
 
248 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3589  ABC transporter related  69.58 
 
 
243 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0607744 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4837  ABC transporter related  66.12 
 
 
244 aa  326  3e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0177235  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  67.78 
 
 
243 aa  325  6e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0358  ABC transporter related  66.67 
 
 
243 aa  321  9.000000000000001e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.648234  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  65 
 
 
243 aa  311  7.999999999999999e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1438  ABC transporter related  64.17 
 
 
243 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  61.25 
 
 
240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4901  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.42 
 
 
240 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0185  ABC transporter related  64.17 
 
 
243 aa  305  6e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  60.83 
 
 
240 aa  304  9.000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60 
 
 
240 aa  304  9.000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60.42 
 
 
240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60.42 
 
 
240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.42 
 
 
240 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  60.42 
 
 
240 aa  302  3.0000000000000004e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.42 
 
 
240 aa  302  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  60.42 
 
 
240 aa  302  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.42 
 
 
240 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  61.25 
 
 
246 aa  302  4.0000000000000003e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  62.08 
 
 
240 aa  302  5.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  61.67 
 
 
240 aa  301  7.000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  64.17 
 
 
244 aa  300  2e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  60 
 
 
242 aa  299  4e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  61.25 
 
 
240 aa  298  5e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  60.83 
 
 
240 aa  298  6e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  61.25 
 
 
240 aa  298  6e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  60 
 
 
240 aa  298  8e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.67 
 
 
240 aa  297  1e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  56.67 
 
 
240 aa  297  1e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  59.17 
 
 
252 aa  296  2e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  63.18 
 
 
244 aa  296  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  60.83 
 
 
244 aa  296  2e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  59.17 
 
 
243 aa  296  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  59.84 
 
 
258 aa  295  4e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3874  ABC transporter related  59.35 
 
 
254 aa  295  7e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.863325  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  59.09 
 
 
244 aa  294  1e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  60 
 
 
252 aa  294  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  60 
 
 
240 aa  294  1e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  59.36 
 
 
263 aa  294  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  59.75 
 
 
241 aa  293  2e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3744  ATPase  61.25 
 
 
247 aa  293  2e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  59.2 
 
 
267 aa  292  3e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.5 
 
 
241 aa  293  3e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4051  ABC transporter related protein  58.94 
 
 
254 aa  293  3e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  59.17 
 
 
239 aa  293  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0468  ABC transporter related  57.92 
 
 
240 aa  292  4e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  57.5 
 
 
241 aa  292  4e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2098  ABC transporter ATP-binding protein  61.38 
 
 
254 aa  292  4e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  57.5 
 
 
241 aa  292  4e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  57.5 
 
 
241 aa  292  5e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  62.76 
 
 
249 aa  291  8e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  59.17 
 
 
247 aa  290  1e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  60.83 
 
 
246 aa  290  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  58.8 
 
 
254 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  58 
 
 
250 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  58.8 
 
 
250 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  59.17 
 
 
243 aa  289  3e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  56.85 
 
 
242 aa  288  6e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  58 
 
 
256 aa  288  6e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  57.92 
 
 
247 aa  288  7e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  57.08 
 
 
241 aa  288  9e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7703  ABC transporter related  59.27 
 
 
264 aa  287  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  57.08 
 
 
241 aa  287  1e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  57.08 
 
 
241 aa  287  1e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  60.4 
 
 
254 aa  287  1e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  61.92 
 
 
253 aa  288  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2831  ABC transporter related  59.41 
 
 
262 aa  286  2e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.563862 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  57.92 
 
 
240 aa  286  2e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  58.33 
 
 
241 aa  287  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  56.25 
 
 
244 aa  286  2e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  60.41 
 
 
273 aa  287  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  56.61 
 
 
243 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  59.5 
 
 
263 aa  285  7e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  57.6 
 
 
251 aa  285  7e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  57.61 
 
 
248 aa  285  7e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0345  ABC transporter-related protein  59.58 
 
 
240 aa  285  8e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  56.85 
 
 
242 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  58.4 
 
 
267 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  56.25 
 
 
241 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.08 
 
 
244 aa  283  2.0000000000000002e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  54.17 
 
 
242 aa  283  2.0000000000000002e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  58.92 
 
 
243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1832  ABC transporter related  57.5 
 
 
242 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0351546  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6459  ABC transporter related  58.4 
 
 
255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4395  ABC transporter related  57.61 
 
 
243 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0223537  normal  0.50723 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  57.5 
 
 
246 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  56.6 
 
 
246 aa  283  3.0000000000000004e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3136  ABC transporter related  58.58 
 
 
269 aa  283  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  56.2 
 
 
243 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  57.08 
 
 
241 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>