More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2964 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  100 
 
 		 253 aa  511  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  79.34 
 
 		 246 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  71.71 
 
 		 257 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  73.47 
 
 		 251 aa  370  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6988  ABC transporter related  72.13 
 
 		 265 aa  364  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2831  ABC transporter related  71.66 
 
 		 262 aa  362  2e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.563862 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  72.61 
 
 		 273 aa  362  3e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3136  ABC transporter related  70.45 
 
 		 269 aa  358  3e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  73.25 
 
 		 257 aa  357  9.999999999999999e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0959  ABC transporter related  70.4 
 
 		 260 aa  355  2.9999999999999997e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  69.58 
 
 		 244 aa  350  1e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18720  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  70.54 
 
 		 267 aa  342  4e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0685  ABC transporter related  70.4 
 
 		 255 aa  341  5.999999999999999e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11340  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  66.25 
 
 		 258 aa  332  3e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.571361  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  64.85 
 
 		 244 aa  317  2e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  62.76 
 
 		 240 aa  315  5e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  63.6 
 
 		 244 aa  315  5e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  60.58 
 
 		 244 aa  309  2e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  61.92 
 
 		 240 aa  308  5e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  60.25 
 
 		 247 aa  307  1.0000000000000001e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  62.34 
 
 		 239 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  59.41 
 
 		 243 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  60.83 
 
 		 246 aa  306  2.0000000000000002e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  64.68 
 
 		 256 aa  305  4.0000000000000004e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  61.51 
 
 		 242 aa  305  5.0000000000000004e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  59 
 
 		 240 aa  305  7e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  59.41 
 
 		 244 aa  304  7e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  61.44 
 
 		 240 aa  304  8.000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  59 
 
 		 243 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  60.67 
 
 		 241 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  58.75 
 
 		 242 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  61.09 
 
 		 240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  59 
 
 		 243 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2298  ABC transporter related  59.34 
 
 		 247 aa  302  4.0000000000000003e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  61.75 
 
 		 267 aa  301  6.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1801  ABC transporter related  60.5 
 
 		 250 aa  300  1e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0322586 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7703  ABC transporter related  62.55 
 
 		 264 aa  300  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  63.03 
 
 		 249 aa  300  1e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  62.9 
 
 		 258 aa  298  4e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  57.32 
 
 		 242 aa  298  5e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2182  ABC transporter related  60.92 
 
 		 245 aa  298  5e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857357 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  56.67 
 
 		 242 aa  298  5e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  57.32 
 
 		 240 aa  298  8e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  58.75 
 
 		 246 aa  297  1e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  60.67 
 
 		 241 aa  297  1e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  59.41 
 
 		 246 aa  296  2e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  56.25 
 
 		 242 aa  296  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  58.58 
 
 		 240 aa  295  3e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.44 
 
 		 244 aa  296  3e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  57.61 
 
 		 247 aa  296  3e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  55.23 
 
 		 240 aa  296  3e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2233  ABC transporter related  59.17 
 
 		 246 aa  296  3e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.693391  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  58.58 
 
 		 242 aa  296  3e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  58.94 
 
 		 244 aa  296  3e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  58.16 
 
 		 242 aa  295  4e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60.25 
 
 		 240 aa  295  4e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60.25 
 
 		 240 aa  295  4e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.49 
 
 		 240 aa  295  4e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  58.16 
 
 		 242 aa  295  4e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.25 
 
 		 240 aa  295  5e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  60.25 
 
 		 240 aa  295  5e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  60.25 
 
 		 240 aa  295  5e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  61.09 
 
 		 240 aa  295  6e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  58.85 
 
 		 243 aa  294  9e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.25 
 
 		 240 aa  293  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.25 
 
 		 240 aa  293  1e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  58.58 
 
 		 253 aa  293  2e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  58.58 
 
 		 241 aa  293  2e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  59.83 
 
 		 249 aa  293  2e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0185  ABC transporter related  62.66 
 
 		 243 aa  293  2e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  60.67 
 
 		 245 aa  292  3e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  59 
 
 		 240 aa  292  3e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4837  ABC transporter related  61.25 
 
 		 244 aa  293  3e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0177235  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  60.25 
 
 		 244 aa  293  3e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  55.65 
 
 		 247 aa  293  3e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4901  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.41 
 
 		 240 aa  291  5e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  61 
 
 		 243 aa  291  5e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  57.74 
 
 		 242 aa  291  6e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  59 
 
 		 241 aa  291  6e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  59 
 
 		 241 aa  291  6e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0114  ABC transporter related  60.98 
 
 		 250 aa  291  7e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  56.9 
 
 		 242 aa  291  8e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  60.25 
 
 		 240 aa  291  8e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59 
 
 		 241 aa  291  9e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.41 
 
 		 240 aa  291  9e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  61.51 
 
 		 245 aa  290  1e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  60.25 
 
 		 243 aa  290  1e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  59.61 
 
 		 273 aa  290  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  58.58 
 
 		 241 aa  290  2e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1059  hypothetical protein  57.5 
 
 		 245 aa  290  2e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  60.92 
 
 		 243 aa  289  2e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  58.58 
 
 		 241 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  64.73 
 
 		 253 aa  289  3e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2758  ABC transporter related  56.9 
 
 		 252 aa  289  3e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  59.24 
 
 		 244 aa  289  3e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.16 
 
 		 284 aa  289  3e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  56.49 
 
 		 242 aa  289  3e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1533  ABC transporter related  58.16 
 
 		 246 aa  288  4e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534266  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4861  ABC transporter related  59.15 
 
 		 241 aa  288  4e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62154 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  58.58 
 
 		 241 aa  288  4e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>