More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4861 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4861  ABC transporter related  100 
 
 		 241 aa  492  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62154 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3865  ABC transporter related  87.08 
 
 		 240 aa  431  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.802251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4136  ABC transporter ATP-binding protein  76.15 
 
 		 240 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47960  putative ATP-binding component of ABC transporter  75.73 
 
 		 240 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0293846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1514  ABC transporter ATP-binding protein  68.78 
 
 		 240 aa  349  2e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0101758  normal  0.119322 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1028  ABC transporter related  69.2 
 
 		 240 aa  333  1e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  60.43 
 
 		 246 aa  300  1e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  58.23 
 
 		 242 aa  293  1e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  59.66 
 
 		 247 aa  292  3e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  58.9 
 
 		 244 aa  289  2e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  59.15 
 
 		 253 aa  288  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  58.9 
 
 		 246 aa  288  7e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  57.68 
 
 		 249 aa  287  1e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  60.17 
 
 		 244 aa  287  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  59.66 
 
 		 247 aa  286  2e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  58.58 
 
 		 240 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  57.63 
 
 		 243 aa  285  4e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  57.38 
 
 		 240 aa  285  4e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  57.81 
 
 		 244 aa  285  5.999999999999999e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  60.76 
 
 		 240 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  56.12 
 
 		 242 aa  284  8e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  59.07 
 
 		 244 aa  284  8e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5523  ABC transporter related  61.6 
 
 		 260 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0407401  normal  0.45159 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  57.63 
 
 		 243 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  57.98 
 
 		 242 aa  283  1.0000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  57.63 
 
 		 243 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4668  ABC transporter related  59.66 
 
 		 262 aa  283  1.0000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  57.08 
 
 		 256 aa  281  7.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  58.82 
 
 		 240 aa  281  8.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  55.42 
 
 		 263 aa  280  1e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  58.65 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1343  ABC transporter related  56.54 
 
 		 246 aa  280  1e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  59.75 
 
 		 256 aa  280  2e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0303  ABC transporter related  59 
 
 		 243 aa  280  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  57.56 
 
 		 243 aa  279  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  56.96 
 
 		 243 aa  279  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5462  ABC transporter-like  57.32 
 
 		 245 aa  278  4e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  55.6 
 
 		 244 aa  278  4e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  58.47 
 
 		 242 aa  278  4e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  55.93 
 
 		 251 aa  278  5e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  56.36 
 
 		 247 aa  278  5e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3466  ABC transporter related protein  56.25 
 
 		 247 aa  278  5e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  56.96 
 
 		 240 aa  278  6e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.38 
 
 		 251 aa  278  6e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3310  ABC transporter related  56.25 
 
 		 247 aa  277  9e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  56.96 
 
 		 239 aa  277  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  55.83 
 
 		 247 aa  277  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  57.2 
 
 		 242 aa  277  1e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  58.47 
 
 		 257 aa  276  2e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  56.12 
 
 		 240 aa  276  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0114  ABC transporter related  60.34 
 
 		 250 aa  276  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3147  ABC transporter related  58.05 
 
 		 247 aa  276  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.383516  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0910  ABC transporter related  55.83 
 
 		 243 aa  276  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  56.72 
 
 		 243 aa  276  2e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  56.72 
 
 		 243 aa  275  4e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  58.23 
 
 		 240 aa  275  4e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  58.05 
 
 		 242 aa  275  5e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  56.96 
 
 		 242 aa  275  5e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  56.78 
 
 		 242 aa  275  5e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6373  ABC transporter related  55.79 
 
 		 254 aa  275  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535484  normal  0.530942 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0959  ABC transporter related  56.25 
 
 		 260 aa  275  6e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  56.72 
 
 		 244 aa  275  6e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2076  ABC transporter related  58.47 
 
 		 241 aa  275  6e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.701263  normal  0.274442 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8009  ABC transporter related  59.49 
 
 		 260 aa  274  7e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162522  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4950  ABC transporter related  54.51 
 
 		 259 aa  275  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0880  ABC transporter related  55.42 
 
 		 243 aa  274  8e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5248  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.02 
 
 		 244 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  55.27 
 
 		 246 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  58.47 
 
 		 278 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0693  ABC transporter-related protein  55.42 
 
 		 249 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.413615  normal  0.685528 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7665  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  55.79 
 
 		 255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6988  ABC transporter related  56.36 
 
 		 265 aa  273  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2441  ABC transporter related  57.45 
 
 		 243 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  55.7 
 
 		 240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  57.38 
 
 		 240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4546  ABC transporter related  55.14 
 
 		 254 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.141129 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1180  ABC transporter related  53.75 
 
 		 360 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3973  ABC transporter related  56.9 
 
 		 243 aa  272  3e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.295954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3187  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.83 
 
 		 248 aa  272  4.0000000000000004e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  56.17 
 
 		 257 aa  272  4.0000000000000004e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1030  ABC transporter related  58.05 
 
 		 239 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000180087  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3475  ABC transporter related  57.38 
 
 		 246 aa  272  4.0000000000000004e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3165  ABC transporter related  56.78 
 
 		 257 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.127499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5268  ABC transporter related  58.05 
 
 		 241 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  55.08 
 
 		 243 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3326  ABC transporter related  55.83 
 
 		 248 aa  272  4.0000000000000004e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  55.37 
 
 		 254 aa  271  5.000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  56.36 
 
 		 273 aa  271  6e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6378  ABC transporter related  56.78 
 
 		 273 aa  271  6e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  57.63 
 
 		 240 aa  271  7e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0295  ABC transporter  55.23 
 
 		 244 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1599  ABC transporter related  57.14 
 
 		 246 aa  271  8.000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  54.66 
 
 		 265 aa  271  9e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  55.51 
 
 		 242 aa  270  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  55.93 
 
 		 252 aa  270  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68060  ABC transporter ATP-binding protein  53.6 
 
 		 257 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876897 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  55.08 
 
 		 246 aa  269  2e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.65 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4269  ABC transporter related  53.2 
 
 		 257 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.640229  hitchhiker  7.10033e-16 
 
 
-
 
NC_004310  BR1959  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.51 
 
 		 251 aa  269  2.9999999999999997e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0443525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>