More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0185 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0185  ABC transporter related  100 
 
 
243 aa  490  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  81.89 
 
 
243 aa  412  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1438  ABC transporter related  80.25 
 
 
243 aa  404  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2390  ABC transporter related  73.25 
 
 
243 aa  363  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3589  ABC transporter related  72.84 
 
 
243 aa  361  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0607744 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0358  ABC transporter related  70.78 
 
 
243 aa  355  5e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.648234  normal 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4837  ABC transporter related  70.12 
 
 
244 aa  346  2e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0177235  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  70.54 
 
 
253 aa  345  3e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  69.14 
 
 
243 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  65 
 
 
252 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  63.98 
 
 
248 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  62.76 
 
 
248 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  63.75 
 
 
240 aa  310  2e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  63.75 
 
 
240 aa  308  6.999999999999999e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  63.75 
 
 
240 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  62.5 
 
 
246 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6012  ABC transporter related  64.58 
 
 
251 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.469772  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  64.17 
 
 
278 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2743  ABC transporter related  64.41 
 
 
248 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  61.67 
 
 
243 aa  301  6.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4025  ABC transporter related  64.58 
 
 
251 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4341  ABC transporter related  64.58 
 
 
251 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.303268  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  61.67 
 
 
243 aa  301  8.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  62.08 
 
 
240 aa  299  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  61.67 
 
 
239 aa  300  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  62.66 
 
 
244 aa  300  2e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  61.25 
 
 
242 aa  298  4e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  61.67 
 
 
244 aa  298  4e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2981  ABC transporter related  62.81 
 
 
245 aa  298  4e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137964  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  60 
 
 
240 aa  298  5e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  61.25 
 
 
241 aa  297  1e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  58.33 
 
 
247 aa  295  3e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  61 
 
 
244 aa  295  5e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  59.17 
 
 
240 aa  295  6e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  60.42 
 
 
241 aa  295  6e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  62.66 
 
 
253 aa  293  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  62.24 
 
 
249 aa  293  2e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  60 
 
 
241 aa  292  3e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  56.67 
 
 
240 aa  292  4e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.75 
 
 
240 aa  291  7e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.75 
 
 
240 aa  291  7e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.17 
 
 
241 aa  291  8e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  59.58 
 
 
241 aa  291  8e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.25 
 
 
240 aa  291  8e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  59.58 
 
 
241 aa  291  8e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.75 
 
 
240 aa  291  9e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  58.75 
 
 
240 aa  291  9e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  58.75 
 
 
240 aa  291  9e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.75 
 
 
240 aa  290  1e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.33 
 
 
240 aa  290  1e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.75 
 
 
240 aa  290  1e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  59.17 
 
 
241 aa  290  1e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  59.17 
 
 
241 aa  290  1e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2934  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  60.16 
 
 
250 aa  290  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4901  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.33 
 
 
240 aa  290  1e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  59.17 
 
 
241 aa  290  1e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  58.75 
 
 
240 aa  290  1e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  60.17 
 
 
241 aa  289  2e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  58.33 
 
 
252 aa  289  3e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2272  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  61.38 
 
 
253 aa  289  3e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  59.58 
 
 
241 aa  289  3e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  58 
 
 
267 aa  289  3e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2151  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  60.41 
 
 
250 aa  289  3e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00643103  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1722  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  60.41 
 
 
250 aa  289  3e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.606951  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2016  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  60.41 
 
 
250 aa  289  3e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00167792  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2374  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  61.38 
 
 
253 aa  289  3e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.90212  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  58.33 
 
 
244 aa  288  4e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  60.42 
 
 
241 aa  288  4e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5182  cystine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  61.63 
 
 
247 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  60.98 
 
 
251 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1045  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  60.41 
 
 
250 aa  288  6e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00188517  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  59.44 
 
 
258 aa  288  6e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1292  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  61.22 
 
 
250 aa  288  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000759261 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  60.17 
 
 
257 aa  287  8e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1729  ABC transporter related protein  60 
 
 
250 aa  287  9e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000704293  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  59.17 
 
 
241 aa  287  1e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  57.08 
 
 
246 aa  287  1e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0356  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  61.22 
 
 
247 aa  287  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1169  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  60.82 
 
 
250 aa  287  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0517714  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4704  ABC transporter-related protein  59.83 
 
 
257 aa  287  1e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.874551  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  56.67 
 
 
240 aa  286  2e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  56.57 
 
 
263 aa  286  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2113  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  60.82 
 
 
250 aa  286  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000755895 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1265  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  59.59 
 
 
250 aa  285  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0153826  normal  0.0123229 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2691  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  59.59 
 
 
250 aa  285  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0086331  normal  0.026152 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2166  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  60.82 
 
 
250 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0966455  hitchhiker  0.00000375322 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2107  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  60.82 
 
 
250 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2033  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  60.98 
 
 
253 aa  285  4e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  59.83 
 
 
249 aa  285  4e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  59.5 
 
 
246 aa  285  4e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  55.6 
 
 
259 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  58.8 
 
 
250 aa  285  5.999999999999999e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  58.33 
 
 
240 aa  285  7e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2504  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  59.18 
 
 
250 aa  284  8e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  57.68 
 
 
244 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18720  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  61.02 
 
 
267 aa  284  1.0000000000000001e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.67 
 
 
240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.33 
 
 
244 aa  283  2.0000000000000002e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5459  ABC transporter related  57.6 
 
 
263 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26828  normal  0.671869 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  58.4 
 
 
250 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>